文章 GEO数据芯片数据挖掘-在线工具分析GDS数据

继安利GEO数据库和芯片数据的差异分析方法（欢迎来戳：No.1, No.2）之后，小编又来卖安利了。这次主要针对GEO DataSet 数据（GDS数据）教大家如何在线进行数据分析。 毕竟不是所有人都会编程敲代码，小白人生谁来解救？所以...

问题 如何筛选阈值来作为潜在的成员来做第二次的hmm筛选

老师您好：     我选取的基因家族的hmm文件 该基因qlen大概500多，然后我第一次hmm搜索只得到了35个片段，而其中又有很多是同一个基因的不同部分匹配到了 hmm模型的部分，都是很小的一分部，请问老师这样的话是否需要做构...

问题 图中的用蛋白分子量筛选，那个蛋白分子量的筛选范围是所有基因家族通用的，还是仅限于Hsp20基因家族

文章 转录组数据挖掘的几个建议

... 2. 基因型和表型研究的目的是从基因型到表型的，你的数据反映的是基因的变化，如何跟表型相关联，需要多思考，查查文献 3. 筛选条件要灵活 很多人对差异分析的条件都坚定不移，Fold Change 必须有2倍的差异， FDR 必须小于...

问题 基因家族筛选

基因家族的筛选条件具体有哪些？我在重复一篇文章的结果时，发现他鉴定到24个基因，而我通过鉴定发现40多个基因，不懂他是怎么把那20多个舍去的？

问题 基因家族成员筛选

筛选到的有些成员的保守结构域不完整，但是在UniProt上又有注释，注释为该家族的基因，那我该不该把他们剔除呢

问题 bioenv环境因子筛选运行10几个小时了 还没出结果 env16个 otu300多 要down重新开始吗 还是选择vif进行筛选呢

问题 老师好，我从转录组结果中筛选MYB转录因子，遇到相同的symbol号或者MYB名字，请问做基因家族分析的时候，怎么筛选和过滤MYB呢？

问题 筛选不到串联重复基因

老师您好，根据基因家族课程中共线性分析后的操作我没有筛选到大豆中一个基因家族的重复序列，请问是我操作有问题还是没有串联重复序列也是正常的呢？谢谢老师解答

问题 GWAS分析筛选关联区域

在筛选GWAS关联区域内的基因时，基因或者SNP与选定的显著关联区域有百分之多少的交集可以定义为关联区域内的基因或者SNP

文章 筛选VCF中指定位置变异位点

...       --vcf    后面跟的是vcf文件     --chr    后面跟筛选区域所在的染色体     --form-bp    后跟筛选区域的起始位置     --to-bp        后跟筛选区域的终止位置     --out    输出文件的前缀     --recode    没有此参...

问题 WGCNA如何进一步筛选基因

课程里面讲cytoscape绘图那一部分的时候，在原来得到的文件的基础上筛选出了前三百的基因，这个具体该怎么筛选？

问题 我看好多hsp20基因都是多个物种进行多序列比对的，多个物种比对那个蛋白质序列都需要筛选吗，构建进化树的时候，每个物种都需要筛选吗

问题 如何TajimaD筛选选择区域内的受选择基因的问题

老师，您好，请问脚本绘制完Tajimad之后，生成了一个TajimaD.smoothline_data.txt文件，但是并不像之前有筛选好的top5%或者1%，脚本里是不是没有加上？那么我们怎么筛选，可以根据这个文档手动排序吗？

文章 分分钟教你绘制基因结构图！GSDS

...明了地展示外显子、内含子及UTR的位置。还可以联合其他数据绘制进化树-基因结构图，展现基因结构与系统进化关系。 地址：http://gsds.gao-lab.org/    ，点开就能使用，再也不用担心画图了！ 如果网站打不开可看这里：https://w...