文章 VirtualBox 中练习安装linux系统centos7

...（这个路径选个磁盘空间大些的盘），系统类型等等 分配内存，注意在绿色的范围分配，最少建议2G，最多建议不超过总内存的一半。 添加硬盘： 选择vbox硬盘vdi建议选择，动态分配。如果固定分配，磁盘上就直接少了这...

问题 泛基因家族mkdir文件夹显示已存在，但目录里没有任何内容

新打开服务器只进行了修改密码的操作，但无法mkdir pan-gene-family的文件夹显示文件已存在，但目录下没有需要解压的demo文件，文件都已从网盘下载了，不知道是什么原因导致的，希望老师看见可以回答一下

问题 docker第三方镜像如何查看已安装的软件？

我们下载第三方镜像，尤其是整套分析流程的镜像之后，如何查看其安装的软件和软件版本？

文章 关于基因家族成员构建进化树时报错如何处理！

...鉴定蛋白的保守结构域，大家可以去网站进一步鉴定自己搜索到的基因家族成员，从而进一步筛选鉴定结果。

问题 如何启用已下载好的数据库

我在windows下载了PFAM数据库然后导入我自己的虚拟机中，我又用conda下载了antiSMASH，然后antiSMASH所需的PFAM如何能直接应用在antiSMASH上，不必再下载一遍PFAM数据库？

问题 第一次hmm搜索时可以搜索出序列，但是接下来一步提取结构域序列时出来的文件是空的，并且hmmer搜索的结果第一列ID与fasta序列中的ID是一致的，求解，谢谢

问题 第一次hmm搜索时可以搜索出序列，但是接下来一步提取结构域序列时出来的文件是空的，并且hmmer搜索的结果第一列ID与fasta序列中的ID是一致的，求解，谢谢

问题 第一次hmm搜索时可以搜索出序列，但是接下来一步提取结构域序列时出来的文件是空的，并且hmmer搜索的结果第一列ID与fasta序列中的ID是一致的，求解，谢谢

问题 两个结构域的hmm搜索

老师您好，我看了课程里面介绍的都是一个结构域的hmm搜索，想问一下例如HD-ZIP这种具有Homeodomain（HD结构域）和HALZ（LZ结构域）的基因家族怎么做hmm搜索？是两个结构域分别搜索之后合并结果做后续HD-ZIP家族鉴定吗？

问题 基因组立调出来序列与NCBI上下载序列有差别

...出入（起初只是发现蛋白质序列过长，就用基因组ID在NCBI搜索了一下），请问此时应该以哪个数据为主？

问题 老师，建立hmmbuild模型后，再用hmmsearch搜索，搜索结果比第一次的还多的情况是正常的吗？

文章 为什么大公司一定要使用 DevOps？

...间内开发并交付。     在CORNERSTONE任务模块里，任务分配给谁，就会是谁的责任。而且任务支持多责任人与子任务关联，所有的任务和状态都会体现在任务模块里，这个任务过程中的参与人员随时知道任务的状态和目前碰到...

问题 一次搜索多个结构域

老师好，请问想一次搜索多个pfam应该如何修改命令“hmmsearch --domtblout WRKY_round1_hmmerOut.txt --cut_tc WRKY.hmm ../01.data_prepare/Arabidopsis_thaliana.gene.pep.fasta”； 对于ring finger这种pfam众多的家族，可以一次性把所有pfam一起做出来吗？还是一...

问题 基因家族成员鉴定分析中，比如WORK基因：为什么要进行两次hmmer（一次WORKhmmer搜索，一次拟拟南芥hmmer搜索）搜索？意义是什么？还有就是第二次搜索出来的结果为什么还要手动检验一下？第二次搜出来的结果不就是有woKY结构域的才能被搜出来吗？（听了您基因家族分析的课，会操作点了，但不懂原理）

问题 蛋白序列搜索

怎么样拿其他物种的基因家族的蛋白序列在需要分析的物种的蛋白序列里搜索？