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文章 GSDS基因结构图指定顺序,他这个顺序为什么不是按照我整理的数据的顺序呢 顺势promoter

我开始的时候数据是这个顺序,我现在已经改过来了,他还是没有变过来 解决办法,可以指定顺序列表:

问题 mapman处理后的数据分析和总结

老师:        您好!        我用我的FPKM均值在MAPMAN上画图。如下     要如何分析每个途径有哪些上调,哪些下调,哪些先上调后下调,哪些先下调后上调?每个去看吗?会不会太主观了?有那么多个途径。求指教,或者...

问题 使用悟空云平台进行代谢组数据矫正时报错

其余五种归一化方式均正常,只有QC-RLSC报错显示error in evaluating the argument X in selecting a method for function "t: NA NaNI nf in foreign function call (arg 5)

文章 读 10X的空间转录组数据报错

Error in .local(obj, ...) : cannot derive coordinates from non-numeric matrix #9240 coordinates <- Seurat::Read10X_Coordinates("tissue_positions_list.csv", filter.matrix = TRUE) is.numeric(coordinates) head(coordinates) tissue_positions_list.csv 这个文件不应该有表头的; ...

问题 GO注释:blast了nr数据库并通过blast2go获得了GO注释号;也通过blast了swiss-prot数据库获得了GO注释号。这两个结果需要合并吗?

老师,你好, 首先,我在本地将我的序列blast了nr数据库,并导入blast2go软件进行了GO注释,并获得了go注释号。另外,我还将数据在本地比对swiss-prot数据库并进一步获得了GO注释号。 1. 我想在想讲这个结果导入WEGO进行作图,请...

问题 请问转录组测序得到的同一基因序列在不同数据库得到的注释为什么不一样?

我做转录组测序,结果中有2个基因序列,它们在NR库中得到了相同的注释(gb编码相同),在Swissprot中得到的注释却不同。能解释一下数据库比对的原理吗?为什么会出现这种现象?

文章 samtools tview 可视化查看比对结果

对于二代测序数据的比对结果bam文件我们可以通过samtools的tview可视化查看特定位置的比对情况: 命令行如下: samtools tview -p B05:53425172 accepted_hits.bam Bju.genome.fa DNA重测序比对结果: 结果说明: “.” 比对到正链;“,”...

文章 VIP-转录组数据鉴定病毒

...1. 快速模式鉴定已知的病毒:这个模式是将转录组的测序数据与已知的病毒核酸序列进行比对,找到那些reads多,覆盖度高的病毒序列。 2. 精确模式发现新病毒:这个模式是将转录组的序列与病毒的核酸库进行比较,再与病毒...

文章 seqcluster软件安装

SeqCluster 是一个用于处理小RNA测序数据的生物信息学工具。它主要用于从深度测序数据中识别和表征小RNA簇。SeqCluster 尤其适用于发现新的microRNA和其他小RNA,以及分析已知的小RNA。 SeqCluster 的一些关键特性包括: 小RNA聚类: Se...

文章 多序列比对-蛋白序列保守结构域比对图绘制 genedoc

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

文章 perl程序文件中的第一行:#!/usr/bin/perl

...基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,提...

问题 请问做基因表达热图,应该用转录组数据的counts值还是FPKM值呢?

问题 苹果系统如何将拟南芥基因组的数据共享到ubantu系统上

问题 如何通过perl脚本实现blastn结果只取第一条,后面还有很多数据

问题 如何对不同物种之间的RNA-seq数据进行标准化处理