问题 如何通过perl脚本实现blastn结果只取第一条，后面还有很多数据

问题 如何对不同物种之间的RNA-seq数据进行标准化处理

问题 老师您好，请问使用Docker时需要把测定数据定位到基因组上吗？

问题 基因家族分析-数据准备

输入agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl --gff  $gff --attribute biotype --value protein_coding -t '!' -o $species.protein_coding.gff3 以及agat_sp_keep_longest_isoform.pl --gff $species.protein_coding.gff3 -o $species.longest_isoform.gff3 这两个命令后总是报错bash: agat_sp_ke...

问题 想问一下视频课程里的data内容换成自己的数据就行了嘛？

文章 多序列比对-蛋白序列保守结构域比对图绘制 genedoc

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

文章 组建专属KEGG数据库

前情提要： GWAS关联到的基因做KEGG富集，竟然全，不显著。所以听人劝，试试自己做一个自己物种的。 正文： step1： https://www.genome.jp/kaas-bin/kaas_main  KEGG注释的网址 step2：模仿下图填空  ps 上传文件有点慢呀  （找个不断网...

问题 单细胞测序数据两个子集合并

我想把CD4.added.celltype.rds文件和subsetCD8.reanalysis.rds文件进行合并，但是这两个文件的最后一列列名不同无法进行合并，有什么办法可以修改列名或者删除这一列呢？ CD4.added.celltype.rds对应的meta文件：CD4.added.celltype.metadata.tsv subsetC...

文章 perl程序文件中的第一行:#!/usr/bin/perl

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问题 您好，在NR数据库本地化的教程中，在运行perl脚本之后，内容为 unknown gi

您好，在NR数据库本地化的教程中，在运行perl脚本之后，内容为   unknown gi    请问有什么解决办法吗

问题 您好，我使用rescript结合您发表的qiime2分类器建立sliva数据库一文，发现自己做到最后一步，数据库训练时一直显示内存不够，除了增加内存，还有没有其他的办法解决这个问题？例如，设置那些参数之类的？或者，我还要多大的内存才能做呢？谢谢

问题 老师您好，请我一下您这里或是哪里有关于WGCNA分析的性状数据准备的详细介绍的资料或课程吗？因为我之前买了您这里的关于WGCNA分析的课程，但是课程里面用到的性状数据应该属于类别性状，用了01转换的，那要是数量性状应该具体是如何准备的我也不太理解，我看有人提到说是表达量，我也不太理解这个表达量指什么？请问老师有相关课程或资料吗？您这里有篇文章是讲了这两种性状数据，但是描述的有点简单。

文章 在线绘制circos的数据格式说明

...绍一下输入文件的格式。 1.您上传的文件必须是纯文本数据。该文件可以是空格或制表符分隔的。行名不可重复。列名亦是如此，行列名可相同。每一行必须有相同数量的字段。 任何#开头的行都被视为注释，而不是解析。空...

文章 NBT同时两篇文章：单细胞数据分析流程 比较

7种单细胞测序技术比较:https://www.nature.com/articles/s41587-020-0465-8 13种单细胞测序技术比较：https://www.nature.com/articles/s41587-020-0469-4

问题 GEO数据的处理问题（没有NCBI官方注释文件情况）

我从soft文件里头提取出Ensemble_ID和GENE symbol，但是现在出现多个Ensemble_ID，我在和ENTREZID对应的过程中，这些多个Ensemble_ID对应之后以NA返回，这个情况要怎么处理呢？