老师您好，我的重测序数据是NCBI上下载的，数据质控的时候没有reads1和reads2之分， 因此代码总是报错，请问老师：网上下载的数据如何进行数据质控？
基化水平的计算通常基于测序数据，例如全基因组甲基化测序（WGBS）数据。这种数据提供了每个碱基位点的甲基化状态。甲基化水平一般定义为某个特定位点或区域内甲基化的碱基数占总覆盖碱基数的比例。以下是计算甲基化...
老师，你好， 首先，我在本地将我的序列blast了nr数据库，并导入blast2go软件进行了GO注释，并获得了go注释号。另外，我还将数据在本地比对swiss-prot数据库并进一步获得了GO注释号。 1. 我想在想讲这个结果导入WEGO进行作图，请...
我开始的时候数据是这个顺序，我现在已经改过来了，他还是没有变过来 解决办法，可以指定顺序列表：
...个基因外均有保守的motif 1 和 motif 2（Supplementary Figure S1 数据未能找到）；TCP家族基因保守结构域包含Basic、Helix I、 Loop和Helix II 4个motif，并且class I (PCF) 与class II（CIN and CYC/TB1）相比，存在一个4个氨基酸的缺失，如下图： 4. TCP...
老师： 您好！ 我用我的FPKM均值在MAPMAN上画图。如下 要如何分析每个途径有哪些上调，哪些下调，哪些先上调后下调，哪些先下调后上调？每个去看吗？会不会太主观了？有那么多个途径。求指教，或者...
其余五种归一化方式均正常，只有QC-RLSC报错显示error in evaluating the argument X in selecting a method for function "t: NA NaNI nf in foreign function call (arg 5)
Error in .local(obj, ...) : cannot derive coordinates from non-numeric matrix #9240 coordinates <- Seurat::Read10X_Coordinates("tissue_positions_list.csv", filter.matrix = TRUE) is.numeric(coordinates) head(coordinates) tissue_positions_list.csv 这个文件不应该有表头的； ...
对于二代测序数据的比对结果bam文件我们可以通过samtools的tview可视化查看特定位置的比对情况： 命令行如下： samtools tview -p B05:53425172 accepted_hits.bam Bju.genome.fa DNA重测序比对结果： 结果说明： “.” 比对到正链;“，”...
我做转录组测序，结果中有2个基因序列，它们在NR库中得到了相同的注释（gb编码相同），在Swissprot中得到的注释却不同。能解释一下数据库比对的原理吗？为什么会出现这种现象？
...1. 快速模式鉴定已知的病毒：这个模式是将转录组的测序数据与已知的病毒核酸序列进行比对，找到那些reads多，覆盖度高的病毒序列。 2. 精确模式发现新病毒：这个模式是将转录组的序列与病毒的核酸库进行比较，再与病毒...
SeqCluster 是一个用于处理小RNA测序数据的生物信息学工具。它主要用于从深度测序数据中识别和表征小RNA簇。SeqCluster 尤其适用于发现新的microRNA和其他小RNA，以及分析已知的小RNA。 SeqCluster 的一些关键特性包括： 小RNA聚类： Se...
将自己实验室服务器上的数据直接上传/下载到组学大讲堂云服务器 从本地服务器将文件传输到组学大讲堂服务器scp命令 scp -r -P [组学服务器ssh端口] 本地服务器文件路径 用户名@域名:服务器路径 示例： 把本地的data文...
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