我开始的时候数据是这个顺序,我现在已经改过来了,他还是没有变过来 解决办法,可以指定顺序列表:
老师: 您好! 我用我的FPKM均值在MAPMAN上画图。如下 要如何分析每个途径有哪些上调,哪些下调,哪些先上调后下调,哪些先下调后上调?每个去看吗?会不会太主观了?有那么多个途径。求指教,或者...
其余五种归一化方式均正常,只有QC-RLSC报错显示error in evaluating the argument X in selecting a method for function "t: NA NaNI nf in foreign function call (arg 5)
Error in .local(obj, ...) : cannot derive coordinates from non-numeric matrix #9240 coordinates <- Seurat::Read10X_Coordinates("tissue_positions_list.csv", filter.matrix = TRUE) is.numeric(coordinates) head(coordinates) tissue_positions_list.csv 这个文件不应该有表头的; ...
老师,你好, 首先,我在本地将我的序列blast了nr数据库,并导入blast2go软件进行了GO注释,并获得了go注释号。另外,我还将数据在本地比对swiss-prot数据库并进一步获得了GO注释号。 1. 我想在想讲这个结果导入WEGO进行作图,请...
我做转录组测序,结果中有2个基因序列,它们在NR库中得到了相同的注释(gb编码相同),在Swissprot中得到的注释却不同。能解释一下数据库比对的原理吗?为什么会出现这种现象?
对于二代测序数据的比对结果bam文件我们可以通过samtools的tview可视化查看特定位置的比对情况: 命令行如下: samtools tview -p B05:53425172 accepted_hits.bam Bju.genome.fa DNA重测序比对结果: 结果说明: “.” 比对到正链;“,”...
...1. 快速模式鉴定已知的病毒:这个模式是将转录组的测序数据与已知的病毒核酸序列进行比对,找到那些reads多,覆盖度高的病毒序列。 2. 精确模式发现新病毒:这个模式是将转录组的序列与病毒的核酸库进行比较,再与病毒...
SeqCluster 是一个用于处理小RNA测序数据的生物信息学工具。它主要用于从深度测序数据中识别和表征小RNA簇。SeqCluster 尤其适用于发现新的microRNA和其他小RNA,以及分析已知的小RNA。 SeqCluster 的一些关键特性包括: 小RNA聚类: Se...
...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...
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