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问题 老师，我在做基因家族鉴定，提取结构域序列，出现这样提示，请问怎么解决

Can't locate Bio/SeqIO.pm in @INC (you may need to install the Bio::SeqIO module) (@INC contains: /home/pc/miniconda3/lib/site_perl/5.26.2/x86_64-linux-thread-multi /home/pc/miniconda3/lib/site_perl/5.26.2 /home/pc/miniconda3/lib/5.26.2/x86_64-linux-thread-multi /home/pc/miniconda3/lib/5.26.2 .) at ...

文章 R语言输出pdf图片，如果有中文出现乱码解决办法

...。 例子： CairoPDF("chinese.pdf",family="SimSun")plot(1:10,1:10,type="n");text(2,10,"宋体",family="SimSun");text(2,8,"黑体",family="SimHei");text(2,6,"楷体",family="KaiTi_GB2312");text(2,4,"隶书",family="LiSu");text(2,2,"幼圆",family="YouYuan");text(6,10,"Arial",family="Arial");t...

文章 世界500强常用的管理方法和工具推荐

...能取得完善每一项工作，完善自己的人生。 5、5W2H What: 命工作的内容和达成的目标 Why:  做这项工作的原因 Who:  参加这项工作的具体人员，以及负责人 When:在什么时间、什么时间段进行工作 Where:工作发生的地点 How:   ...

问题 转录组比对中，同源性很高的两个基因比对不正确

...ount --format bam --order pos --mode intersection-strict \--stranded yes --type exon \--idattr gene_id $workdir/3.map/hisat2/${i}.bam $GTF > ${i}_gene.tsvdone

文章 linux下samtools安装指南

...zipcd htslib-develop 安装指令：  autoconf       #Generate the configure script, if needed./configure    #Optional, needed for choosing optional functionalitymakemake install 在./configure过程中可能会报错，原因是有些库或包没安装，根据报错信...

文章 subset_row.r 提供列表，在行上取数据子集

...IDoptional arguments:  -h, --help            show this help message and exit  -i input, --input input                        input data matrix data [required]  -m idlist, --idlist idlist                        input idlist [required]  -c colname, --colname colname ...

问题 用Docker进行单细胞测序数据合并时，执行合并代码时候，报错。

...码时候，出现这个问题：Error in gzfile(file, "rb") : cannot open the connection Calls: MergeObject -> lapply -> FUN -> readRDS -> gzfile In addition: Warning message: In gzfile(file, "rb") :   cannot open compressed file ' -p', probable reason 'No such file or directory' Exec...

问题 blast2go报错，升级blast ncbi-blast-2.3.0+ 到 ncbi-blast-2.6.0+ 报错

Can not parse BLAST XML because can not find information about the used version!

问题 使用tassel对vcf文件进行 -SortGenotypeFilePlugin 基因型排序时自动锅炉掉了我的两条contig，这个问题怎么解决呀？

我要做Gwas分析，需要生成hapmap文件，但是我直接用vcf转hapmap会报错Please first use SortGenotypeFilePlugin to correctly order the file.所以我就用tassel去排序然后可以正常生成hapmap文件了，但是我的两条比较小的contig不见了

文章 GEO数据库的搜索下载数据技巧

...因表达的数据时，比如组织、细胞等等，在这里ADD想要的type就行。 4、数据下载介绍 选中其中一个感性的标题点击： 之后得到数据介绍页面： 数据介绍及下载详解见：https://www.omicsclass.com/article/1100

文章 修改Docker本地镜像与容器的存储位置的方法

...class ~]# docker info | grep "Docker Root Dir" WARNING: You're not using the default seccomp profile Docker Root Dir: /var/lib/docker 解决这个问题，最直接的方法当然是挂载分区到这个目录，但是我的数据盘还有其他东西，这肯定不好管理，所以采用修...

文章 Graphpad Prism绘制折线图

...），点击折线图图标，并把样本数设为3，同时设置为Mean and Error ,如下图： 2、在Data栏中输入以下数据，软件就会自动帮你算出均值（Mean）和误差值（Error），并做好折线图了。 3、点击Data3，即可看到折线图。 4、双击...

问题 在Rstudio安装WGCNA数据包时有程辑包不能获得，直接输入了> install.packages("WGCNA")代码下载的。文中有图

根据WGCNA课程中给的script进行操作的。上面两张图分别显示了run了> install.packages("WGCNA")和# Load the WGCNA package library(WGCNA)之后的代码。 请求帮助，非常感谢！

问题 老师，转录组差异基因报错，求助，谢谢

...r 0.05 --fc 2 -p J1_vs_J2 --> Q&A for bioinformatics, please visit the website: https://www.omicsclass.com/ --> R beginners ? I suggest your  learning  R language: https://study.omicsclass.com/index Loading required package: ggplot2 Loading required package: edgeR Loading required p...

问题 您好，我在用qiime2进行扩增子测序分析但是导入数据时会一直出现改错误，请问有什么合适的解决办法吗?

There was a problem importing manifest:   manifest is not a(n) PairedEndFastqManifestPhred33V2 file:   Filepath on line 1 and column "forward-absolute-filepath" could not be found ($PWD/home/qiime2/Public/data/dyj/HS15_1.fq.gz) for sample "HS15".