#wget -c https://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/uniref/uniref50/uniref50.fasta.gz wget -c https://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/uniref/uniref90/uniref90.fasta.gz #wget -c https://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/uniref/uniref100/uniref100.fasta.gz #gunzip *gz #wget https://...
...通的物种、基因等等的丰度信息的表格转化成LEfSe识别的格式。这一步会生成.in结尾的文件 第二步：这一步也是最关键的一步，统计显著差异的biomarker、统计子组组间差异、统计effect sizes（LDA score），会生成.res格式的文件。如...
十分感谢 QQ:1767863540 邮箱：1767863540@qq.com
老师；我这儿GFF3文件格式和教学视频不一样；蛋白序列上显示gene_id有三个；我不知道如何选取哪一个进行接下来的GFF3基因位置分析；GFF3文件上没有染色体位置信息，和教学视频的格式不同-gene出现在第3列；gene_id出现在第9列我...
...anio.com/simple 2. 授权 首先把数据上传到百度网盘，打开浏览器，登陆百度网盘，保持此页面。 回到linux系统，输入 bypy info 从Linux输出屏幕中得到一个链接，复制到浏览器打开（第一步） 这时浏览器会...
...困境。只需上传你的OTU丰度表或物种相对丰度矩阵（如CSV格式，包含样本和分类单元），并用自然语言描述分组信息（如不同采样点、处理条件或时间序列），AI即可自动生成“端到端”绘图脚本：从数据归一化、物种筛选，到...
...eRNA调控网络可能非常的庞大。 解读文献 研究背景 肝细胞癌（HCC）是危害人类健康的最致命的恶性肿瘤之一。越来越多的证据强调竞争性内源RNA（ceRNA）调控网络在各种人类癌症中的关键作用。然而，HCC中ceRNA网络的复杂性...
...入文件路径及文件名 -out：输出文件路径及文件名 -db：格式化了的数据库路径及数据库名 -outfmt：输出文件格式，总共有12种格式，6是tabular格式对应BLAST的m8格式 -evalue：设置输出结果的e-value值 -num_descriptions：tabular格式输出...
fastp是一款较新的数据质控软件，可以对测序数据进行处理。这里介绍如何对fastq文件进行剪切。 其命令如下: fastp --in1 data_yuanshi/Tres_2_1.clean.fq.gz --out1 Tres_2_1.clean.fq.gz --in2 data_yuanshi/Tres_2_2.clean.fq.gz --out2 Tres_2_2.clean.fq.gz --trim_...
...中），最后转移至-80℃冰箱保存。 另外很多老师用的是细胞样品，对于培养的细胞系，首先要确定细胞数量（建议5×106以上）。首先对收集好的细胞用1×PBS清洗几遍，贴壁培养的最好先用少量胰酶消化一下（切记不要消化过度...