问题 gama 射线引起的大片段缺失

...变体材料单株提取叶片 DNA 进行全基因组重测序” 这一步中是否也可以直接选取不同品系的瘤数增多的稳定突变体，提取叶片DNA，进行混合测序，再通过生信分析获得结构变异，并定位到影响表型的基因？静等您的回复，非常非...

文章 基因家族分析课程更新-批量进行kaks计算

在我们的基因家族视频课程中，演示的计算kaks方法为手动计算，当我们要计算的复制基因对太多时，手动计算就太费时间了，这里我们更新了课程，可以批量提供基因对列表（串联重复和大片段复制），就可以快速批量的进行ka...

文章 An introduction to PERMANOVA and ANOSIM

...比较不同群组间的平均距离。它基于排列方法来检验数据中组间和组内的方差分配是否有显著差异。或许是最泛用的用于计算多元数据差异R函数之一的adonis就是PERMANOVA •特点： •适用性广：可以使用任何形式的距离度量，包...

文章 基因组重测序docker镜像更新到2.0

... 4.其他代码优化等 使用方法： docker pull omicsclass/reseq:v2.0docker run -it -v ~/reseq:/work omicsclass/reseq:v2.0 如果需要用到最新的软件分析数据可以使用这个2.0版本的镜像，老用户重新下载示例数据压缩包   课程链接：https://bdtcd.xet...

问题 请问这2个sam文件对后续有什么帮助吗 占用内存太大 想删掉 不知道有没有用

感觉后面的代码都是基于绿色框框的2个文件在做分析  那红色框内的2个.sam文件有啥用吗？占用存储有点大 可以删掉这2个吗  在跑后续的k2物种注释、蛋白质预测、KEGG注释等分析之前

问题 我想测小鼠的转录组，初次接触转录组，不知选什么公司，希望可靠一点的；不知用二代测序还是三代测序，有什么利弊吗？

问题 图中的用蛋白分子量筛选，那个蛋白分子量的筛选范围是所有基因家族通用的，还是仅限于Hsp20基因家族

问题 老师，我这是结构域所在序列用GeneDoc比对的结果，288个基因比对，没有课程里那纯黑色百分百相似的区域正常吗

问题 老师您好，打扰您了，我想问一下咱们公司服务器上如何调用aspera呢？我试了用调用R的方法，但是不行

问题 请问大家，为什么将含有序列的文本txt格式改为fasta之后，用MEGA打开显示空白，直接打开文本也是显示空白

文章 CommandNotFoundError: Your shell has not been properly configured to use 'conda activate'

使用conda时报上面的错，一般是因为路径错误 使用这个命令获取路径 conda info | grep -i 'base environment' 用得到的路径替换下面命令中的路径 source 路径/etc/profile.d/conda.sh 运行之后conda的使用就正常了

问题 请问老师们有关基因家族分析有利用较大数量物种（例如50种以上）研究某一家族基因的案例吗？

老师，您好！ 考虑到大数据分析具有量变引起质变的本质，目前基因家族分析普遍集中于一种或几种物种上，那试问如果把基因家族分析扩大到较大数量物种（例如50种以上），是不是效果会更好一些，更具创新性一些，有这...

问题 请问老师们有关基因家族分析有利用较大数量物种（例如50种以上）研究某一家族基因的案例吗？

老师，您好！ 考虑到大数据分析具有量变引起质变的本质，目前基因家族分析普遍集中于一种或几种物种上，那试问如果把基因家族分析扩大到较大数量物种（例如50种以上），是不是效果会更好一些，更具创新性一些，有这...

问题 老师您好，我问过我们这边的一个老师，他是直接用的我的plink_pca.eigenvec文件直接在R绘制的，并且没有用我的分组信息，直接PCA就可以做出来图，他说可能是我的分组有点问题，但是我用这个分组可以完成进化树和structure绘图，做PCA的图却只有框没有点

SampleSpeciesGroupGroup1 Unknown_AQ498-S01-01R0001indigenousAsiaII6AsiaII6 Unknown_AQ498-01R0001indigenousAsiaIAsiaI Unknown_AQ498-01R0002 indigenousChina1China1 Unknown_AQ498-01R0003indigenousAsiaII1AisiaII1 Unknown_AQ498-01R0004indigenousAsiaII2AsiaII2 Unknown_AQ498-01R0005indigenousChina6...

问题 做基因家族的表达分析，有几个基因没有表达数据，该怎么处理，画热图的时候是建议不展示这几个没有表达数据的基因，还是把这些没有表达数据的基因用0表示

如果用0表示是否造假