按照RNA-seq课程教的方面，将自己的课程数据换成自己的数据，得不到结果。中间不知道哪里错了，麻烦老师给个解决的办法，谢谢
...下，我需要分享给别人，要求2:如果是人和小鼠 可以直接分析细胞周期，如果是非模式物种需要提供细胞周期文件才行，不提供不运行跳过，要求3，输入文件不要写死了，需要用户提供；示例脚本shell脚本：~/pbmc/02.data_QC.sh, 质...
...行癌症的治疗，刚好这里就给大家介绍一篇利用公共数据分析的文献：基于共表达分析鉴定骨肉瘤转移相关基因。 数据来源进行数据挖掘分析的所有数据都来自GEO数据库，数据下载基于两个原则：数据集属于骨肉瘤基因表达谱...
...很多生物科研工作者都接触了基因组相关实验。在做数据分析的时候，会用到一个很重要的文件，就是基因组的注释文件，也就是今天分享内容的主角GFF文件！ 什么是GFF文件 GFF格式是Sanger研究所定义，是一种简单的、方...
用GCA文件分析时，找不到该家族的基因，不知道怎么回事。
...乳腺、肿瘤前 BRCA1+/- 组织、乳腺癌的主要临床亚型以及匹配的肿瘤对和涉及的腋窝淋巴结。根据绝经状态对正常组织标本进行比较主要揭示了基质的变化。尽管与正常组织相比，癌前 BRCA1+/- 的微环境发生了适度的变化，但随着...
...封闭式”参考OTU划分，并将得到的OTU丰度矩阵上传至Galaxy在线分析平台（http://huttenhower.sph.harvard.edu/galaxy/root?tool_id=PICRUSt_normalize），按提示操作就能得到预测结果。 4、16S+PICRUSt，研究新趋势 PICRUSt这一方法横空出世后，已有越...
...到2维中。二者的差别如下图： （图片源自 ggplot2: 数据分析与图形艺术） 以内置数据mpg 演示 facet_wrap() 使用 ，设置形式 ~ a + b +c 同时可以基于nrow , ncol 修改默认设置 library(ggplot2)> data(mpg)> print(mpg)# A tibble: 234 x ...
...的比较，也就是样品间的差异，而上次提到的alpha多样性分析为样品内的多样性；Beta多样性利用各样本序列间的进化关系及丰度信息来计算样本间距离，反映样本（组）间是否具有显著的微生物群落差异。 Beta多样性计算 Beta多...
...下： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）...
针对有不少学员问起《TCGA-生存分析》课程中的Risk Score 到底是如何计算的。现进行简单的介绍： cox生存分析模型 Cox比例风险回归模型，是用 作为因变量，模型的基本形式为： ...
做基因家族分析中的染色体定位图，发现有一个基因定位在contig上，这种情况下怎么做mapchart前准备文件？直接不做这个基因的染色体定位图可以吗？
...程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学...
...》，3天时间，让您全面理解转录组结果数据，掌握标准分析后的数据挖掘思路及方法技巧，让您看结果有信心，写文章有底气！ 转录组数据解读与挖掘精讲班，主要内容包含以下三方面：1. 转录组文章行文思路详解；2. 主流测...
...因，应该不是在染色体上的，因为我做的是藻的基因家族分析，而藻的基因组文件中除了33条染色体以外，还有很多其他的序列如下图： 这是藻的基因组gff3文件的前面一部分，可以看出前面应该是染色体，后面还有很多既不...