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文章 plink 软件core dumped报错

... --keep-allele-order  --allow-extra-chr --set-missing-var-ids @:# 报错信息如下： PLINK v1.90b3.32 64-bit (24 Feb 2016)      https://www.cog-genomics.org/plink2(C) 2005-2016 Shaun Purcell, Christopher Chang   GNU General Public License v3Logging to LDfiltered.log.Options in effect:  -...

文章 水稻根际微生物多样性分析

...并且进一步研究了与甲烷循环相关的微生物。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

文章 R语言用tidyr包进行长宽数据转换

...t;- gather(widedf, key = "variable", value ="value", Var1:Var2:Var3)warning信息不用管参考：https://www.jianshu.com/p/c30200471c7d

文章 提取miRNA前后500bp序列

在提取miRNA前后500bp序列时，若没有其位置信息，提取会比较麻烦，可用以下方法提取： 1.首先利用blast软件将miRNA的前体序列与基因组比对，获取前体序列的位置信息，比对方法： makeblastdb -in Donkey_Hic_genome.20180408.fa -dbtype nucl -t...

文章 muscle软件介绍

...0:00    12 MB(-1%)  Iter   1  100.00%  Root alignment 4、生物信息中的利用目前muscle 主要用来在基因组进化部分，因为构建进化树和计算选择压力，都需要将序列对齐，muscle小而快，毋庸置疑是最好的选择。 此外，我们在网易...

文章 特斯拉宣布降薪！开源节流，疫情之下如何提升企业管理效能

...个时候要放下原有部门固化的思维，保持积极的沟通。在信息高度流通的情况下，团队才能发挥最大的作用，共同解决问题。 为此，也可以尝试通过协同工具来进行辅助配合。在明确的工具和规则内，来培养员工的协同意识。 ...

文章 biolinux操作系统简介

...2G，安装需要至少15G硬盘空间。 内部集成了500多个生物信息学人员常用的软件或包，也可自己将biolinux软件源加入Ubuntu软件列表中，利用Ubuntu的apt-get安装这些软件包。常用软件列表见表1，附中文简介。 表1. Bio-linux8集成主要生...

文章 蛋白质组与转录组的关联分析如何做？

...研究情况做一些更有针对性的个性化分析。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

文章 沉迷游戏，不招学霸——别人家的导师你敢信！？

...收的研究生同学能比较幽默、开朗，期待将你带进痛苦的信息论世界。“ “本人长期沉迷于dota、wow等暴雪游戏，希望招收的学生也是能玩能学的学生。学霸之类的就不要来找我了，我很惭愧带不了你。” 还有： 图：来源于...

文章 linux命令之cp

...创建目录。如果没有文件复制的权限，则系统会显示出错信息。将文件file复制到目录/usr/men/tmp下，并改名为file1cp file /usr/men/tmp/file1将目录/usr/men下的所有文件及其子目录复制到目录/usr/zh中cp -r /usr/men /usr/zh交互式地将目录/usr/men...

文章 项目管理工具到底有什么用?

...如评论任务或附加文件--没有人想在外部工具中丢失重要信息。还有一些其他的协作功能，例如把你的项目进度用图表的方式导出。参与项目的任何人可能都需要共享功能，以获得相关指示或讯息。 五、基准评估          ...

文章 怎么做一张好看的分类学树状图

...接触到分类学树状图。今天分享一款很不错的分类学组成信息可视化软件——GraPhlAn，用它生成的图会更好看哦！ GraPhlAn 安装 首先，是GraPhlAn 的下载安装。 在linux环境下使用如下命令进行下载： hg clone https://hg@bitbucket.org/nsega...

文章 转录组+？分析+？实验=2区文章

...” 即可获得原文献！（注意关键词需写全）。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解...

文章 群体结构分析structure原理

...思路过程是： 1、获得一系列样本的基因型，也就是变异信息  例如，SNP信息2、在大部分情况下，我并不知道这个群体实际包含几个亚群。我们把群体的亚群数称为K值。那么我可以预设群体亚群数等于1~n，即K=1~n。那么软件就...

文章 绘制Upset 图

...效，避免因集合过多导致图表混乱。提供交集大小的定量信息，而维恩图通常只能粗略估计。 3.UpSetR包绘图 准备的数据文件格式如下： all_deg_id CK_vs_A CK_vs_B CK_vs_C CK_vs_D CK_vs_E ENSRNA049471043 1 1 0 0 1 ENSRNA049471090 1 0 0 0 0 ...