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文章 统计不同分组差异表达结果并统计上下调基因数目并绘制柱状图

...括基因的名称，基因的表达量已经差异分析结果，上下调信息如下，所以我只需要第一列可以做venn图，最后一列做数量统计： 当然我的差异表达分组很多，有很多这样的文件，不同的组合比较，我需要批量的用R读入数据，然...

文章 密度图--ggplot2

...图技能，我们推荐：R语言绘图基础（ggplot2) 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

文章 python特殊属性和方法的详解与运用

...， 先来看下保留属性： >>> Class1.__doc__ # 类型帮助信息 'Class1 Doc.' >>> Class1.__name__ # 类型名称 'Class1' >>> Class1.__module__ # 类型所在模块 '__main__' >>> Class1.__bases__ # 类型所继承的基类 (<type 'object'>,) ...

问题 请问request returned Internal Server Error for API route and version http://%2F%2F.%2Fpipe%2Fdocker_engine/v1.24/containers... check if the server supports the requested API version 这个问题该怎么解决

运行docker 解析gff信息时，中断， docker软件的containers中出现 request returned Internal Server Error for API route and version http://%2F%2F.%2Fpipe%2Fdocker_engine/v1.24/containers/025fef2a3e783d8c473c644d58e2ffd31be5f157743e797b0649966a18031dfc/json, check if the server supports ...

问题 vcftools过滤除了等位基因选项外，其他参数通通没用

...out of a possible 118111 Sites之外，其他参数全部失败了，结果信息都一样，如下： --gzvcf 1.vcf.gz       7         --recode-INFO-all       8         --max-missing 0.8       9         --recode      10         --stdout      11      12 U...

文章 你懂荧光定量PCR吗？要点一二三帮你解惑

...曲线都出现双峰这样一般都是由于有DNA的污染。更多生物信息课程：1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读2. 转录组数据理解不深...

文章 你懂荧光定量PCR吗？要点一二三帮你解惑

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文章 群体进化和GWAS文章没那么难发！

...，组学生物愿与您携手共进，再攀科研高峰！ 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

文章 circos-基因组圈图调整标签文字重叠

...比较拥挤，之后简单调整一下link_dims即可 更多生物信息课程：https://study.omicsclass.com/index

文章 O2PLS-DA分析

...O2PLS 模型可灵活进行组学数据挖掘，发现不同层面的调节信息，从而有助于建立系统生物学调节网络。 选取所有的差异基因、差异代谢物建立 O2PLS 模型，通过载荷图初步判断不同数据组中相关性和权重都比较高的变量，筛选出...

文章 MySQL报错：ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/tmp/mysql.sock'

错误信息： ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/tmp/mysql.sock' (2) 出现问题原因： 有可能是 my.cnf 配置文件中设置了 [mysqld] 的参数 socket ，而没有设置[client]的参数socket mysql.sock 文件有什么用： mysql 支持 socke...

文章 2020年读研还有用吗？工作 or 读研，到底选啥？

...引进落户大战白热化 ...... 这些新闻连在一起，透露的信息就是： 预计2020考研人数会更多，尤其是女生占比更大； 硕士研究生压力也会越来越大，被退学可能很常见，但是相应的，他们的补贴会更高，今后的就业以及落户福...

文章 GWAS模型介绍

...用右侧的GLM以QTNs当做协变量进行SNP检测，得到的SNP根据LD信息确定QTNs的信息（根据染色体实际位置来选择对应的bin大小），进而利用左侧的GLM以BIC（Bayesianinformation criterion）策略进行QTNs准确性检测，排除假设错误的部分，保留...

问题 gset = getGEO(GEO='GSE12417', destdir=".",getGPL = F) 下载不了这个GEO文件，应该如何处理？

...GSE12417-array/GSE12417-GPL97_series_matrix.txt.gz #手动下载 GPL注释信息 wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/platforms/GPLnnn/GPL96/annot/GPL96.annot.gz -O GSE12417-array/GPL96.annot.gz wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/platforms/GPLnnn/GPL97/annot/GPL97.annot.gz -O GSE12417-a...

文章 Ka/Ks与进化选择压力

...解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入门到精通必修基础课：linux系统使用、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图 7. 医学相关数据挖掘课程，不用做实验也能发文章：TCGA-差异基因分析、GEO芯片数据...