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问题 请问,利用Linux制作circos配置文件时,result文件无数据是什么原因

配置circos作图文件时,result文件夹能正常生成,也没有报错,但是result文件中,genome.blocklink.txt文件为空,genome.blocklink.txt文件只有aliment但是无数据,检查基因序号对应无误,不知道问题出在哪里

问题 利用命令行进行sra数据下载有如下报错

fastq-dump --split-e --gzip SRR1039508 Failed to call external services.

问题 GSEA基因表达数据文件报错

<Error Details> ---- Full Error Message ---- There were errors: ERROR(S) #:1 Parsing trouble edu.mit.broad.genome.parsers.Par ... ---- Stack Trace ---- # of exceptions: 1 ------Bad rowname - cant be empty at: 0 >

文章 批量搜索替换MySQL数据库中的内容

...对所有的student_name 进行搜索替换,如果需要限定特定的数据,后面可以加where限定,如下: UPDATE student SET student_name = replace(student_name, 'John', 'Mark') where id =11;

问题 "组学大讲堂"--Linus常用命令处理生物数据,这一课的免费视频在哪里?

我在购买的课程视频里得知,"组学大讲堂"--Linus常用命令处理生物数据,这一课是免费的。在网易云课堂上。可是我一直没有找到。求指点。谢谢

问题 RNA-SEQ有参转录组的课程,可以来分析全转录组数据

有参转录组课程的代码可以用来分析全转录组数据吗,lnRNA,miRNA这些也可以用hisat2注释吗

问题 多样性数据实操 OTU注释报错

老师 您帮我看看 我用了视频里的代码 但是报错 您讲这一块的时候 说时间太长 没有直接跑 我按源代码都报错

问题 请问重测序可以得到某物种的全基因组序列吗,能不能从重测序数据中找到某个基因的完整序列?

我这里有两株酵母的重测序数据(clean data),可以通过这两个数据得到这两株酵母的全基因组序列吗?另外,我想得到这两株酵母种某个基因的完整序列,可以实现吗?还是说重测序只能得到变异信息。

文章 bioperl批量计算蛋白质分子量等电点pI

...基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,提...

文章 cytoscape插件BinGO安装以及GO富集分析和网络可视化

...BinGO的使用: 还是在 Apps找到刚才安装的BiNGO,点开: 数据准备1: 使用之前先下载物种最新的GO注释文件,以拟南芥为例: http://geneontology.org/page/downloads 找到拟南芥,这个注释文件包含的两列对这里的分析是有用的,分...

问题 荧光定量PCR数据与预期相反

在做一条通路中关键基因在不同诱导子诱导下的表达,已知在这些诱导子诱导下,通路最终产物含量均提高。需要基因表达量提高才能证明基因关键。但做出来表达量降低。原因可能是什么呢?求各位大神解答。(PS:如果真是基...

问题 一般动植物进行转录组测序,要测多少数据量,如何估测?

问题 在TCGA构建ceRNA网络,数据用代码下载不完全啊

问题 请问如果其他数据的metadata.tsv与barcode如何做出来?​

问题 测序数据合并后只有一个fastq文件如何export为全局变量