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问题 各位老师好!我电脑之前安装过mapman,后来不小心删掉了,再安装就不能了怎么回事?

具体情况已经再下面附上了截图(示例文件可以正常显示)

问题 GenomeScope软件预测基因组偏小

我在GenomeScope软件预测一个种质的基因组大小的时候,结果显示基因组大小是348M。但是,我做kmer分析的时候,kmer总数量是16756256187,主峰的深度是42,这样计算的话(kmer数量除以深度)基因组大小应该是397M。而且测序公司也...

问题 以拟南芥CYP基因为参考序列,BLAST寻找某一植物转录本的CYP基因,如何操作?一条一条的对比吗?

我已获得某一植物转录本,想从找到所有的CYP基因,如此多的序列,Blast如何操作?

文章 singularity使基础

...是可写的文件系统,于开发过程,方便根据需要修改其的内容。两种格式之间相互转换,即开发完成后转换为sif。具体可参考官网。 2. singularity特性 比如可在本地构建docker镜像,然后上传服务器使singularity运行,从而避...

问题 在绘制circos图时 基因组之间的共线性关系无法条带状表示

如图所示 想把基因组之间的共线性关系条带状表示出来  这段代码如下 <link>        bezier_radius=0r        bezier_radius_purity=0.75        color=82,82,82,0.7        crest=0.5        file=/home/manager/share/cir/genome.txt ...

问题 请问一下,当时期作为表型数据时,文件该是什么格式?行和列各怎么赋值,还有就是重复间要不要区分?

问题 老师,我在却时出现这样的情况是因为颜色不够了吗,有没有办法增加色板颜色呢?谢谢老师。

问题 老师,请问megaX做进化树分析时,序列有22个,但是它老是弹出这个页面是怎么回事呢?

问题 各位前辈老师,TBtools对启动子元件进行可视化,软件老报错,请教一下有没有解决的办法

问题 做基因家族分析时,MCScan做共线性分析,跟着教程走没有发现有串联重复的基因,这种结果正常吗?

问题 已经发表的文章的是两个隐马尔可夫模型,怎么样把搜索出来的数据合在一起呢?

文章 vcftools使

...种可以对VCF文件和BCF文件进行格式转换及过滤的工具,其很多过滤及计算功能我们可以自己使perl或者python编写脚本实现,但都不如这个工具的运算速度快。 有些奇怪的是需要到网页上查看他的使参数,Linux上没有参数查...

问题 string网站预测蛋白质互作网络,为什么相隔两个月预测的两次结果不一致?

string网站预测蛋白质互作网络,六月底进行了一次,hide disconnected nodes in the network后有40个节点,隐藏了20个节点;八月低在string进行了同样的操作,hide disconnected nodes in the network后有63个节点,节点数没有减少;这两次使的...

问题 老师您好,我单细胞课程的脚本做轨迹分析,一直报错是怎么回事?报错信息如下:

提示我sample_name那一列有重复的,但我检查了metadata文件,没有重复的啊?

问题 老师,我需要cufflinks Linux x86_64 binary做表达分析,根据课程安装了虚拟机导入的linux系统

老师,我需要cufflinks做表达分析,由于windows系统cufflinks下载过于繁琐,所以通过咱们课程下载的虚拟机以及成功导了入linux系统,现在要下载安装cufflinks Linux x86_64 binary。想问一下在虚拟机的Linux系统下怎么安装cufflinks Linux x86_...