5 在绘制circos图时 基因组之间的共线性关系无法用条带状表示
如图所示 想把基因组之间的共线性关系用条带状表示出来
这段代码如下
<link>
bezier_radius=0r
bezier_radius_purity=0.75
color=82,82,82,0.7
crest=0.5
file=/home/manager/share/cir/genome.txt
ribbon=yes
flat=yes
radius=0.88r
<rules>
<rule>
condition=var(intrachr)
</rule>
<rule>
condition=var(interchr)
</rule>
</rules>
thickness=1
z=15
</link>
radius=0.40r
thickness=1
想请问大家该如何修改...是代码的问题还是缺少安装模块QAQ
最佳答案 2019-03-05 13:39
1、基因组上的共现性区块能够呈现明显条带有一个前提是每个区块都比较大，如果位置区间小，即使设置显示条带状也是很细的条带，看着和普通的线可能差不多。（目测可能是你对应的区块起始到终止之间距离比较小）
2、因为提供的配置文件内容比较多，有的时候需要一个一个参数调试，而且前提是保证对应的输入文件等设置没有错误。
