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文章 ggplot2图片保存

R语言中可以将图片结果保存成pdf、png、tiff等等,具体涉及方法: pdf()、png()、tiff()、svg()..... 以pdf和png进行保存代码如下: 以ggplot2绘图结果 https://www.omicsclass.com/article/92   的图片保存为例 pdf(file = "p.pdf",width =12,height =...

文章 singularity运行fastqc报错OutOfMemoryError

... fastqc $datadir/*.gz  -o $workdir/1.fastqc 可能报错: 可以加一-t选项,多线程运行,如下图,指定一下线程,可以在自己服务器允许的情况下,多指定几线程。

问题 iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -T 2 -mem 8G \ -m GTR -redo \ -B 1000 -bnni \ --prefix iqtree 命令怎么加入外类群分析

文章 提取进化树中基因的顺序

...序即可。这里我写了一脚本,如下: 用法: perl nwk_geneid.pl  -i in.nwk  -o out.txt in.nwk 为输入的nwk文件,out.txt是输出的基因ID文件。 脚本代码; use Getopt::Long;use strict;my %opts;GetOptions(\%opts,"i=s","o=s","h");open(IN,"$opts{i}") || die "open...

问题 蛋白组学差异蛋白的筛选

比较两组不同数据时,每组分别设置了四生物学重复,那么比较这两组数据的差异蛋白时应该怎么把这些生物学重复的数据归一呢?还是要对其中的每一对生物学重复组分别进行比较?

问题 分析差异基因时,为什么要用FDR,能直接用p_value吗?

问题 老师您好,做GWAS分析使用GLM模型时,p值为什么都是-0啊?

问题 blast建库比对

...列有些是有重复的,我选择在TAIR里下载,如图所示,这基因家族有好几选项,都是基于拟南芥的,我查了文献,拟南芥里这基因家族总共是107条,那么是不是我只需要下载这107条就可以了,其他的选项里有包含转录因子...

文章 从月球回来的水稻种子怎么样了?

...作物、花卉种子共30余种,进行深空诱变育种实验。如今3月过去了,这批神秘种子现在怎么样了呢? 据华南农业大学消息: 该校获得共计40克的太空稻种于去年11月搭乘嫦娥五号登月,历时约23天、76万公里的“环月旅行”后,...

文章 利用 NAS 对实验室数据进行存储备份

...一逻辑单元,用于提供更高的性能、针对驱动器故障的更好的数据安全性和更高的存储容量。也就是多块硬盘组成一大的硬盘这样我们不会因为数据太多一盘存储不下分开好几盘存储,管理起来很不方便。还有一好处...

文章 2020年读研还有用吗?工作 or 读研,到底选啥?

...应的,他们的补贴会更高,今后的就业以及落户福利也会更好。 所以,报or不报,就看你自己了。 有些同学想说,既然不确定,那就报咯, 考不考得上另说,就算考上了,如果到时候有更好的选择,也可以不去读嘛。 的确...

问题 芯片探针解读

各位老师,我有问题关于芯片探针的。就我有一芯片同时测得是mRNA和lncRNA。然后,根据平台文件的Gene sybmol进行注释,但是有很多Gene sybmol是这样子的XLOC_l2_007835,XLOC_l2_015212这些是什么东西?也不知道它是不是基因,可不可...

问题 具体用那些数据分析 是两两比较还是总的比较

你好 老师 我做了5时期的种子的转录组,其中有两两比较,具体怎么分析,请老师知道一下

问题 iqtree2 iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -m TEST -B 1000 -bnni -alrt 1000 --prefix iqtree出现报错

使用run_pipeline.pl将vcf.gz文件转换为.phy文件后运行该命令,出现报错,报错内容如下图: phy文件检查了里面有AGCTKMNRSWY这11种字符,这正常吗?是哪里出错了呢

文章 sci分区,是按JCR还是中科院分区?哪更靠谱?

一说到SCI分区这话题, 学霸姐姐就想起了“热门网红”期刊——Nature Communication, 它平均影响因子10分以上、2年内总被引达302306次、各种话题不断、Nature亲儿子....... 然而,它却被划中科院划到了2区。 到底分区的高低是...