问题 微生物共存网络数据准备

老师，有个小问题请教一下，微生物共存网络那里的课程好像没有更新，所以演示内容里taxonomy和feature table用的都是OTU ID，但是我现在的taxonomy的表头是feature id，好像和table里的OTU id不一样，这影响分析吗

问题 老师好，请问应该怎么下载/处理原始数据才能在single-cell:v3.0镜像里进行分析呢？

老师好，我们在处理原始数据的时候遇到了问题，已经困扰我们一个多月的时间了，不得以来请教老师，非常抱歉打扰您了： 我们这个月尝试了很多方法都不行，最近尝试的方法是：在GEO数据库上下载GSE154778的TAR文件（图1）...

文章 饼图中添加文字的位置控制-ggplot2（非公式）

...on)geom_text（postion)控制饼图文字的添加过程； 譬如： ###数据 type=c("A","B","C","D","E")Num=c(90,34,56,99,15)dat=data.frame(type,Num)dat ###创建有序因子，方便颜色填充 dat$type=factor(dat$type,levels = dat$type,order=T)dat$type###画图,柱状图 position_stack(r...

文章 绘制简单圈图—RCircos包

...y(RCircos) #绘制染色体图形 #导入RCicos包内置的人类染色体数据 data(UCSC.HG19.Human.CytoBandIdeogram) 数据展示： 第一列是染色体编号，第二列是染色体片段起始位点，第三列是染色体片段结束位点，第四列是染色体片段编号，第五列...

问题 转录组学数据可否直接引用

...图片，但是感觉会比较尴尬，所以想问一下这个直接引用数据库（包括富集图片）可以吗，谢谢！（主要是因为课题组经费有限，老板不愿意前面的测序再送一遍，所以特来询问）

问题 RNA-seq课程中的初始数据来源于哪篇文章

老师，请问RNA转录组分析的课程中，用于分析的初始人类normal/tumor/.fasta数据是来源于哪篇文献呀，可以提供下文献名吗？

问题 老师 你好，我通过Git bash利用代码 tcga_gene_exp_download下载数据提示terminate called after throwing an instance of 'std::bad_alloc' what(): std::bad_alloc，无法分析后续数据

问题 比较基因组学NCBI数据提取CDS失败

好像就只有最后一步没提取出来，我不知道什么原因，请老师解答

文章 三代数据SV检测软件安装与使用——cuteSV

...序在检测基因组结构变异方面有着很大的优势，但是由于数据分析算法、软件还处于不断开发更新中，当前还没有公认推荐的软件。这里为大家推荐一款国人开发的三代数据SV检测软件—cuteSV。该软件同时支持目前三代测序领域...

文章 GFF中提取所有转录本的位置信息，以及对应的基因ID信息；

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

文章 LENS:人的基因相互作用分析在线工具

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

问题 想要分析有参转录组，除了测序数据，还需要什么文件？

问题 烟草的基因组数据除了NCBI还有那儿可以下载到？

问题 但是string数据库里没有丹参这个物种怎么办

问题 R进行cox生存分析时读入临床数据一直报错