数据下载 wget -c "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/download/?acc=GSE145370&format=file" -O GSE145370_RAW.tar#解压tar xvf GSE145370_RAW.tar 准备map.txt 文件： #accession SampleID gender age pathological_stage tissue_type patient GSM4317409 S133A Male 60 IIIB T S133 GSM4317410 S13...
...cgt/TGCAtgca/; return $revcomp;} 用法，以reverse_complement 为例： $str = &reverse_complement($a); #$a变量里存放序列字符串，$str为求得的反向互补序列。
...个pfam的编号，可以得到隐马尔科夫模型。我可以将这个用在其他物种上吗，用来做后续的分析？还是说这个只能在拟南芥物种上使用？
用课程中hmm search的方法做一个关于黄酮代谢的基因家族分析，在验证比对结果步骤遇到了如下问题： smart网站返回结果显示，分析得到的所有序列都未得到有效验证，如下图： 但CDD和pfam数据库的验证显示，分析得到的序列...
有一份分析好的FPKM值，要是可以直接绘制基因表达量热图就不从头分析了。
...） 2. 至少掌握一门高级编程语言 做生信，编程是避免不了的，初学者建议先学perl、Python等语言，简单而功能也够强大！（网易云课堂搜索“组学大讲堂”有Perl语言、R语言学习课程。） 3. 以实战出发，勤加练习 生信学习要...
...具有高度选择性的最为重要的蛋白质降解途径。真核细胞中泛素化修饰后的靶蛋白可能被降解、可能被转移到细胞或细胞外的特定部位，也有可能导致靶蛋白的功能发生变化，这主要取决于靶蛋白所加的泛素链的结构，以及泛素...
连锁不平衡（linkage disequilibrium,LD）是指在某一个群体中，不同位置上的两个基因座同时遗传的频率明显高于预期的随机频率现象，一般用D，D'和r²来表示LD的程度。D（连锁不平衡系数）是最基础的，D衡量的是实际观察到的单倍...