老师你看这是什么意思呢
我在用GenomeScope软件预测一个种质的基因组大小的时候,结果显示基因组大小是348M。但是,我做kmer分析的时候,kmer总数量是16756256187,主峰的深度是42,这样计算的话(kmer数量除以深度)基因组大小应该是397M。而且测序公司也...
...c_nums.txt -o3 mat.txt -o4 otu_func.txt 得到功能有无矩阵mat.txt(格式同otu_table后跟物种注释) 2.转换成biom格式文件:(docker上下载QIIME1镜像) biom convert -i mat.txt -o otu_table.from_txt.biom --table-type="OTU table" --process-obs-metadata taxonomy --to-hdf5...
老师好,使用docker镜像gene-family:v2.0进行blastp比对,请问写文章时blast软件应标注哪个版本呢?谢谢
...以找到对应负责人沟通。 在CORNERSTONE里,可以同时并行管理多个项目。每个项目清晰明确可见责任⼈、任务状态、优先级、类别、时间等多维度信息,帮助企业快速⾼效的对项⽬进⾏全周期管理。 1.3 需求讨论及需求分析 ...
为什么组学服务器上找不到如下路径呢??/share/work/biosoft/CAFE/CAFE5/tutorial/clade_and_size_filter.py CAFE软件如何安装? 谢谢
使用python2运行lefse软件的时候报错这是因为当前LEfSe依赖的R包rpy2的版本与你的R版本不兼容,你可以尝试更新一个rpy2的小版本,比如我更新了 pip2 install rpy2==2.8.6 随后就可以直接使用
...加班。(这是音乐APP首次服务器崩溃) 运维:卧槽?怎么访问流量这么高?是出啥bug了吗? 运维:兄弟们,快醒醒!快加机器啊!系统要崩了! 开发:别催!再催自杀! leader:测试在扩容之后赶紧拉出来测测! 测试:...
seqkit是一个序列处理神器,有统计、格式转换、长度筛选、质量值转换、翻译、反向互补、抽样、去重、滑窗、拆分等功能。 seqkit 一共有37个可用的命令,详细内容如下: amplicon 通过引物检索扩增子(或其周围的特定...
谢谢 感激不尽 卡这里好久了
...链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物...
想请教一下MolQuest里对核酸序列和氨基酸序列的结构域分析、染色体定位分析、共系分析、蛋白质互作分析、蛋白质三级结构分析,具体的一些操作和参数的设置