问题 老师您好，我使用P-value进行转录组差异基因筛选，被审稿人质疑了，我看到您之前回复2020年的帖子说校正后p值筛选差异基因较少时用P-value也行，这种情况得后期用qpcr验证我数据是准确的是吗，我之前做了qpcr验证，但是用的不是我关注的差异基因，现在也不能补关注基因的定量了。我准备找几篇使用未校正p值的文章加上我之前做的qpcr来解释我的分析是可行的，您觉得这样可以吗？

问题 无参转录组GO和KEGG富集分析如何实现

在无参转录组分析中，通过Blast2go 比对得到了go和kegg注释信息，也通过Deseq2得到了差异基因，那么请问如何实现GO和KEGG的富集分析呢？在看clusterprofiler进行富集分析的时候需要两个数据，一个是gene id ，另一个是org.***.eg.db注释文...

问题 分析差异基因时，为什么要用FDR，能直接用p_value吗？

问题 老师您好，请问用mega构建进化树根据什么设定bootstrap值呢?还是说一般设定就是1000?

问题 请问预测信号肽或者蛋白质亚细胞定位是用什么方法做的呢？谢谢老师

问题 Linux 生信分析环境搭建可以用苹果的OS系统吗，如果可以最低需要什么配置？

问题 老师，请问一下，用TBtools打开meme.xml文件出现报错，这种情况是怎么回事呢？

问题 你好，之前看您想用转录组比对基因组数据，不知道是否有结果和方法

问题 Mega输出的nwk文件用itol打开出现断杈是怎么回事？谢谢老师们

问题 binning 想做功能注释，但还是不知道该用哪些文件进行基因预测和功能注释？

问题 老师你好，我是用单细胞课程脚本做kegg富集总是报错，请问是怎么回事？

报错信息如下

问题 用GATK call SNP时报错

...索引，这里是还要对输入的bam文件做索引嘛； 但我尝试用 samtools index SRR3274663.new.sorted.bam此命令对输入文件做索引也不成功

文章 multi_cox.r 基因表达量做多因素cox分析

...ngls/test/TCGA_immu/scripts/multi_cox.r       [-h] -i data -t time -e event -v variate [variate ...]       [-P predict.time [predict.time ...]] [-c cut.score] [-s seed]       [-o outdir] [-p prefix]multi variate cox regression analysis using gene expressionoptional arguments:  -h, --hel...

文章 shell变量使用注意事项

...名称进行限制，就可以正常输出了： 大部分时候，shell中的变量确可以不加括号“{}”使用，但是使用括号限制变量确实是个良好的编程习惯，此外，在shell中关于变量的使用还有一些常见的规则与用法，比如： 变量不能出现...

文章 实验研究中的肿瘤细胞从哪来?肿瘤细胞详解

...本期就为大家揭秘这些癌变细胞的基本特征，及我们实验中的肿瘤细胞的那些事儿。 人体内由于细胞分裂失控从而无限增殖的细胞被称为肿瘤细胞，具有转移能力的肿瘤被称为恶性肿瘤，又称为癌(Cancer)。Cancer源于希腊字母螃...