我手里有十来个转录组样品的原始数据,想寄到公司重新分析下,但是太大了,应该怎么给他们呢?
1.安装 注意:Windows Terminal 要求 Windows 10 1903 (build 18362) 及以上版本。 WT 现在已经上架 Microsoft Store,所以直接在商店里搜索安装即可。 2.配置 安装完成之后,WT 默认是长这样的: 修改配置: 可以复制以下内容直接配置文...
...和溶菌温度等,在适宜的条件下质粒DNA和染色体DNA才能够更好的分离开来。 细菌浓度对于质粒DNA的提取也是非常重要的,如果细菌的浓度比较高,那么在溶菌时,溶菌液很难和细菌液充分混合,导致溶菌不彻底的问题,...
想做个开花基因的家族分析。
第一个no前面应该没有错误啊为什么会出现no 第二个问题百度不到不知道怎么解决,求告知
请问一下老师为什么我解压出来的script里面的脚本不全,做顺式作用元件预测时并没有:get_gene_weizhi.pl这个脚本?(与视频课程里相比缺少了好几个脚本)
faprotaxs数据库注释得到的过程报告如何转化成绘物种分类功能热图所需的输入文件? 1.对过程报告整理: grep 'OTU' -B 1 faprotax_report.txt | grep -v -P '^--$' > faprotax_report.clean perl otu.pl -iclean faprotax_report.clean -o1 func_otu.txt -o2 func_nums....
我用示例文件报错也是这个。用自己文件也是 ../scripts/ggtree.r -t fasttree.nwk -f ../data/pop_group.txt -g GROUP -n fasttree 这个是我给的命令行 WARNING: ignoring environment value of R_HOME --> Q&A for bioinformatics, please visit the website: https://www.omics...
经常看到组学文献中提到,掩盖1%的SNP,先填充再推断,还是先推断再填充,计算填充率和准确性。这种模拟的过程是怎么个编程思路?
一个有两个结构域的基因家族在分析的时候必须把这两个结构域的对应的蛋白序列分别截取出来吗?还是只要把这两个结构域分别分析之后得到的基因ID取个交集,直接用这个基因ID对应的蛋白质全长序列继续往下分析就可以?
...,可以尝试使用函数式编程 函数式编程,顾名思义,整个代码都由相互独立的纯函数构成,而且参数和返回值都可以是函数,纯函数还有个优点,他比较稳定不会改变引用值, 但普通函数会,举个例子 def num_1(list):for index in r...
...置比较合理?那在运行的时候就要减少分配的内存了,一个任务分给20G,同时运行5个任务可以把?不知道分给20G的内存够不够? 这并行运行和直接分给100G 一个任务运行,速度有差别吗? nohup ParaFly -c w.sh -CPU 5 > w.sh.o&
...行多因素的分析。 # 构建多因素分析的公式 multi_var <- paste0(sign_rbsure_gene_names, collapse = '+') fml <- as.formula(paste0('mysurv~', multi_var)) # 进行多因素分析 Multi_cox <- coxph(fml, data=exprSet) # 汇总多因素分析结果 Multi_sum <- summary(Multi_co...
进行排序时提示 ERROR net.maizegenetics.dna.map.PositionListBuilder - validateOrdering: PositionChr:HIC_SCAFFOLD_11Pos:40436InsertionPos:0Name:SHIC_SCAFFOLD_11_40436Variants:G/AMAF:NaNRef:G and PositionChr:HIC_SCAFFOLD_9Pos:117578893InsertionPos:0Name:SHIC_SCAFFOLD_9_117578893Variants:G/AMAF:N...
水稻样品,重测序3个样本,深度分别为13×和60×和3×,然后得到了all.clean.vcf里面只有一万多的snp。但是我们老师call到的snp太少了,老师说就是即便是同一个品种测了两次,也不会只有一万多的snp,至少几十上百万。我参数用的...