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问题 WGCNA 选择基因作热图的问题

请问老师，课程上说的是挑了400个基因作热图，但是这些基因是怎么挑的呢？

问题 MEGA建树的问题

做毕业设计：在对比分析完开始建树会出现下面图片的错误，对比了7个物种的同一个酶的基因，我自己实在不知道咋办，6条序列是ncbi下载的，有一条是测序序列，非常感谢

文章 如何让生信大咖解决自己的问题

...最终问题也就得不到解决。下面我们就来聊聊如何提出一个“好”问题。 错误的提问方法： 懒惰型：代表性语句是"在吗"、"有没有人熟悉XX软件"、"有没有人做过XX分析"。这让潜在回答者不敢应答，谁知道回答这个没边界的问...

文章 Monocle2|单细胞测序的拟时序分析

什么是拟时序分析？拟时序（pseudotime）分析，又称细胞轨迹（cell trajectory）分析。通过拟时序分析可以推断出发育过程中细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程。我们可以理解为在一堆细胞中包含各种各样不同的发育状态的细...

文章 空间转录组数据预处理

...有单细胞分辨率的,一般是将一团细胞所处的位置定为一个spots,通过不同spots 的差异体现出空间的差异 10x visium数据预处理 ST包含多种方法,分别是ISH原位杂交,ISS原位测序,以及ISC原位捕获,前两者其实精度已经达到了亚细胞级别,...

问题 请问虚拟机进不去咋办

好久没用了，今天想做个热图，小鲸鱼也打开了，输入进入虚拟机命令，发现进不去

问题 重测序

nohup ParaFly -c  sh w.sh -CPU 2 > w.sh.o& 这个命令对吗？ 是用大于号把？ nohup ParaFly -c  sh w.sh -CPU 50 > w.sh.o&amp （独享服务器有56线程，我用到50个线程可以把-CPU 50？）

问题 mcmctree运行很长时间

老师您好，我用mcmctree跑分歧时间，一共16个物种，306个单拷贝直系同源，用的BV方法，迭代200000次，已经跑了16天了，显示只跑了14%。还在继续运行，这么慢正常吗？

问题 circos图的名字显示问题

想在这个图片中的，多个名字来自于一大个点，距离较近，怎么配置啊，我的总是不显示完全，会有遮挡的 谢谢啊，没有金币了

文章 seurat_sc_cluster.r 使用帮助：

$Rscript scripts/seurat_sc_cluster.r -husage: scripts/seurat_sc_cluster.r [-h] -i filepath [-d dim]                                   [--resolution resolution [resolution ...]]                                   [--umap.method umap.method]                 ...

文章 项目经理该如何面对频繁的需求变更?

...需求变更从提出到完成的整个任务生命周期的所有状态，更好地把控项目执行，提高项目成功率。现在申请20人以下团队即可免费使用。

问题 关于interproscan的问题

老师，您好！运行interproscan.sh时，用您教的方法（ -appl）试了一下，运行了1天后又没有新文件更新了，后台还在运行，大概3.8万个基因，这种情况正常吗，我是否需要再等等，或者有别的解决办法？谢谢老师！

问题 群体遗传PSMC问题

群体遗传课程57课PSMC那里，我看视频是一个.bam文件就能做一次分析，出一张图了。那我的数据有200多个样本400个bam文件怎么办呢？？需要合并吗？怎么合并啊？ 下面这个是例子代码：

文章 ggplot2图例位置legend.position调整

ggplot2绘图过程种，控制图例在图中的位置利用theme(legend.position）参数 该参数对应的设置如下： legend.positionthe position of legends ("none", "left", "right", "bottom", "top", or two-element numeric vector) 其中none 表示隐藏图例，可参考 https://www.o...