问题 请问DAVid 数据库 可以对 谷子这个物种 进行注释检索吗？

利用谷子的基因号（来自于JGI数据库）例如 seita.1G36240 这种形式的 基因ID . 在第一步时：输入上面的基因ID号，不知道选择什么形式 进行 检索

问题 为什么在使用TCGAbiolinks包下载数据时会出现以下问题呢？

这是TCGAbiolinks下载数据的问题 加载devtools时总出现这样的问题是为什么呢？

文章 Linux下载数据

...st oss://xxxx    #list用户oss://xxxx目录下所以文件 4. 下载数据 $/share/work/biosoft/nuohe/linuxnd/lnd cp oss://xxxx/目录/文件 .   本地目录    #下载文件到本地目录$/share/work/biosoft/nuohe/linuxnd/lnd cp -d oss://xxxx/目录/目录 .   本地目录  ...

问题 有系谱记录的群体做GWAS分析需要怎么处理表型数据呢？

大多数GWAS分析采用自然群体，表型数据为编号后跟性状即可。那么有系谱记录的群体是否需要对表型做啥处理呢？还是把亲缘关系矩阵算进去就可以了？

问题 基因家族分析--结构域在线数据库中确认

老师， 在基因家族分析--结构域在线数据库中确认的时候， 首先使用的是利用pfam的结构域使用hmmsearch的方法找到的候选基因， 在后续的NCBI-CDD的确认 和 smart 网站确认的过程中， 发现在这两个网站分别有几个基因不含有目标结...

文章 进化树中如何添加热图？

...作用，iTOL不会读取该行的内容。 DATASET_HEATMAP：配置文件数据类型声明，这里声明数据集是对进化树添加热图信息。 SEPARATOR SPACE：指定数据分隔符，即数据列与列之间使用空格分隔。 COLOR #ff00ff：指定数据集初始颜色，可在后...

文章 芯片RNA降解情况

芯片RNA降解图 RNA的降解是影响芯片数据质量的一个很重要因素，一般，RNA从5端开始降解，所以理论上探针5端的荧光强度应该低于3端。 RNA降解曲线的斜率表示了这种变化趋势，斜率越小，说明降解越少， 如果斜率太小，甚至...

问题 WGCNA可以将来自不同组织的表达量数据放在一起计算吗

各位老师： 请问WGCNA可以将来自不同组织的表达量数据放在一起计算吗？ 我有四个不同组织的表达量，每个组织三个重复，可以当作12个样本将表达量进行WGCNA分析吗

问题 如何分析从数据库下载的转录组信息

问题 转录组数据里的count值是指什么？

问题 您好，请问转录组测序数据分析能做吗？

问题 求解TCGA生存分析 数据分集createDataPartition错误

文章 ggplot2几何设置——geom

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

问题 TCGA转录组数据有3中类型，下载哪一种比较好？

GDC上的TCGA的转录组数据，目前支持3中类型下载，分别是Count, FPKM和FPKM-UQ， 下载哪一种比较好呢？

问题 求助：用Rstudio下载数据，出现remaining后不动了，是不能下载了吗？

用tcga_gene_exp_download.r下载数据显示remaining，是下载完成了还是不能下载了？