文章 cBioportal使用教程

cBioportal这个网站，促进多维度癌症基因集数据的探索，可以允许跨gene，样本和数据类型的可视化分析。用户可以可视化一个癌症研究中多样本间基因改变的模式，并比较点多癌症研究中gene改变频率，或者在一个个体肿瘤样本中...

问题 Docker会限制线程数吗

各位大神，在用hifiasm进行基因组组装时，线程数设置为100，但是后台发现线程数不到10个，请问这是怎么回事？

问题 老师您好，我使用P-value进行转录组差异基因筛选，被审稿人质疑了，我看到您之前回复2020年的帖子说校正后p值筛选差异基因较少时用P-value也行，这种情况得后期用qpcr验证我数据是准确的是吗，我之前做了qpcr验证，但是用的不是我关注的差异基因，现在也不能补关注基因的定量了。我准备找几篇使用未校正p值的文章加上我之前做的qpcr来解释我的分析是可行的，您觉得这样可以吗？

用户 亮亮 p( ^ o ^ )q时光机

文章 Monocle2|单细胞测序的拟时序分析

什么是拟时序分析？拟时序（pseudotime）分析，又称细胞轨迹（cell trajectory）分析。通过拟时序分析可以推断出发育过程中细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程。我们可以理解为在一堆细胞中包含各种各样不同的发育状态的细...

问题 基因结构

...xon_info.gff 生成的文件，但是在Gene Structure Display Server中整个数据选中文件后生成的图案是这样的 但是单独选中几个数据是可以做出正常图片的， 但是他们的bp大小不同，所以不能一个一个这样弄，麻烦老师看一下是哪里的问...

文章 Docker Volume - 目录挂载以及文件共享

...器间进行数据共享。数据卷呈现给Docker容器的形式就是一个目录，支持多个容器间共享，修改也不会影响镜像。使用Docker的数据卷，类似在系统中使用 mount 挂载一个文件系统。Docker文件系统工作情况想要了解Docker Volume，首先我...

问题 变异结果统计与绘图时，最后一步出现Error in scan(file = file, what = what, sep = sep, quote = quote, dec = dec, : line 17 did not have 34 elements的问题，查看文件发现并没有缺失的部分，怎么解决

... :   line 17 did not have 34 elements的问题， 查看了第17行，34个元素都在，并没有缺失

文章 转录组测序分析数据库介绍

...   其中我们最常用来进行转录组分析的是GO和KEGG两个数据库。 GO数据库 什么是GO数据库？ GO(Gene Ontology, http://www.geneontology.org）数据库由基因本体论联合会建立，该数据库将全世界所有与基因有关的研究结果进行分类...

问题 基因重叠问题

老师，我在做基因家族分析的时候，发现鉴定出来的两个基因有重叠区域（重叠区域占了80%，两个基因的结构域也在这个重叠区域），并且去查看了基因组的注释信息，发现确实有重叠，当然这两个基因并不是可变剪接类型。这...

问题 重测序 htop 查看服务器使用

这个内存情况怎么看，怎么显示0个Runing? 

问题 老师，请教一下，用gatk call g.vcf.gz格式的文件是，运行中断了，请问怎么样才能和之前跑的数据接着跑，而不是从零开始呢

问题 WGCNA 选择基因作热图的问题

请问老师，课程上说的是挑了400个基因作热图，但是这些基因是怎么挑的呢？

问题 MEGA建树的问题

做毕业设计：在对比分析完开始建树会出现下面图片的错误，对比了7个物种的同一个酶的基因，我自己实在不知道咋办，6条序列是ncbi下载的，有一条是测序序列，非常感谢

文章 ggplot2图例位置legend.position调整

ggplot2绘图过程种，控制图例在图中的位置利用theme(legend.position）参数 该参数对应的设置如下： legend.positionthe position of legends ("none", "left", "right", "bottom", "top", or two-element numeric vector) 其中none 表示隐藏图例，可参考 https://www.o...