找到约 15 条结果

问题 map bwa出错

...SQ line "VBZB010" with no LN: tag samtools view: failed to add PG line to the header 但grep   .fa文件后。 1到>29 dna:primary_assembly primary_assembly:LU_Bosgru_v3.0:29:1:46153303:1 REF >X dna:primary_assembly primary_assembly:LU_Bosgru_v3.0:X:1:136336377:1 REF >Y dna:primary_a...

问题 在学习基因组重测序过程中，执行变异结果统计与绘图展示的命令报错

...5.var_ann -n SNP_gene_ann --> Q&A for bioinformatics, please visit the website: https://www.omicsclass.com/ --> R beginners ? I suggest your  learning  R language: https://study.omicsclass.com/index Error in library("getopt") : there is no package called ‘getopt’ Execution halted...

文章 送你一个小巧好用的序列分析软件-APE-功能强大，操作简单！

...点击Tool中Find primer，软件默认引物长度为20—25nt、GC含量45-60%、Tm值55-60度，如下图，设计特异性引物非常方便！ 引物设计结果如下，引物与序列关系是交互式的，引物前数字是引物起始位置： 3. 序列比对 打开两个序列文件...

问题 问题："不能为虚拟电脑 Bio-Linux-8.0.7 打开一个新任务",已经按照提示看了自己的虚拟化设置是打开的，但还是下面的结果，求解答！

不能为虚拟电脑 Bio-Linux-8.0.7 打开一个新任务. The virtual machine 'Bio-Linux-8.0.7' has terminated unexpectedly during startup with exit code 1 (0x1). More details may be available in 'D:\软件安装包\VM\Bio-Linux-8.0.7\Logs\VBoxHardening.log'. 返回 代码: E_FAIL (0x80004005)...

文章 批量邮件推送python代码模板，可支持html邮件格式

... to Get Up and Running With Vue</h5>              <p>In the introductory post for this series we spoke a little about how web designers can benefit by using Vue. In this tutorial we’ll learn how to get Vue up..</p>            </td>            <td width...

文章 前沿科普：间充质干细胞的研究为什么这么火？

...肪细胞、软骨细胞等。流式检测结果显示，CD19、CD34、CD45阴性;CD90、CD105阳性。并且经过了细菌、真菌、霉菌、支原体检测。 而配套的精心优化的人间充质干细胞无血清培养基，也是十分优秀! 化学成分明确、无血清、无动物...

文章 时隔4年，四川大学华西医院全球首个CRISPR人体实验结果出炉！

...发表在 Nature Medicine 上，论文题目为《Safety and feasibility of CRISPR-edited T cells in patients with refractory non-small-cell lung cancer》，为 CRISPR/Cas9 基因编辑的 T 细胞临床应用基本的安全可行提供了重要证明。 1. 实验简介：这项1期临床试验...

问题 使用xpclr_smooth_line_plot.r绘制时，没有报错，但没有图片生成

...n all.chr.xpclr.smoothline --> Q&A for bioinformatics, please visit the website: https://www.omicsclass.com/ --> R beginners ? I suggest your  learning  R language: https://study.omicsclass.com/index Loading required package: ggplot2 chr_name =  1 chr_name =  8 chr_name =  15 chr_name...

文章 使用R语言安装包编译时gcc标准报错——“error: for loop initial declarations are only allowed in C99 mode”

...。 参考内容：https://stackoverflow.com/questions/35198301/how-use-the-option-std-c99-for-installing-r-packages

文章 WGCNA 根据KME值筛选hub基因

...)值来筛选hub基因：Hub genes are those that show most connections in the network as indicated by their high KME (eigengene connectivity) value 代码部分很简单，输出所有的基因与模块的KME矩阵，然后筛选每个模块中kme最大的前几个基因就是hub基因： #merg...

问题 老师您好！我在使用ParaAT是报错，提示Generating homologous group files for alignments: 0，请问这个如何解决？

...ultiple sequence aligner = muscle Output format = axt Genetic code = 1-The Standard Code  KaKs_Calculator used = FALSE Remove gap = FALSE Remove mismatched codons = FALSE Verbose output = FALSE Reading homologous groups from homo_pairs.txt1: 100 groups Reading nucleotide sequences f...

文章 GATK ERROR MESSAGE

... ERROR MESSAGE: Bad input:We encountered a non-standard non-IUPAC base in the provided reference: '10'， 检查了输入文件也没有发现问题在哪，一直没有找到原因。后来在网上查了一下了问题可能是参考基因组序列文件编码格式有问题。然后我试着改...

问题 基因组注释Braker里面的报错

...t;/work/work/genome_annotation/03.Braker/braker/errors/GeneMark-ET.stderr The most common problem is an expired or not present file ~/.gm_key!” 更新了gm_key文件还是同样的报错

问题 植物线粒体组装unicycler软件里的spades报错

...      (kmer_coverage_model.cpp   : 218)   Too many erroneous kmers, the estimates might be unreliable  * 0:07:10.518  1785M / 18G   WARN    General                 (kmer_coverage_model.cpp   : 327)   Valley value was estimated improperly, reset to 3  * 0:07:10.523  1785...

文章 tensorQTL ：最高效的QTL 分析工具

...it(1) file_name = sys.argv[1] output_file = f"{file_name}.txt" # Read the parquet file object parquet_file = pq.ParquetFile(file_name) # Open the output file (binary mode) with open(output_file, "wb") as f:     # Write header (avoid pyarrow auto-quotes)     header = "\t".join(parquet_f...