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文章 顺式作用元件分布图绘制

...可生成下图:(部分展示) 不过,目前看来这个图还是比较丑的,不过没关系,我们可以通过下方调整区控件进行图片美化: 最终在编的努力下图片稍微漂亮点: 好了,顺式作用元件分布图初步完成了,后期所做的调...

问题 在共线性分析中发现结果太少

在共线性分析中发现结果太少,将minspan=30改为=0后结果仍然很少,能不能调整cscore的值呢,这个值指向的是哪个参数啊,是类似于E值的存在吗,怎么调整比较好呢

问题 蛋白质全长多序列比对

请问如何对muscle比对之后得到的结果进行手动调整呢?比如这种,试着调整了一下,第一次粗暴的将WRKY中间一条横杠去掉,结果报错ERROR: The sequences in the input alignment should be aligned in order to us,第二次将结构域中阶所有横杠去掉...

文章 LD衰减距离

...述LD衰减速度的快慢。 LD衰减距离通常指的是:当平均LD系数衰减到一定大的时候,对应的物理距离。 “一定大”是这个定义的关键点,但没有特别统一的标准,在不同文章中标准不同。常见的标准包括:a)LD系数降低到最...

文章 推荐一款好用的基因结构图在线绘制工具!

...时显示绘图结果,调整方便,结果支持PDF版下载,是一款比较好用的绘图工具,有需要的请收藏吧!最后奉上Exon-Intron Graphic Maker地址:http://www.wormweb.org/exonintron 总有同学咨询基因家族分析类文章可以投哪些期刊,闲暇之余,...

文章 如何快速从转录组数据中筛选目标基因!

...确定即可。 以上是利用基因ID在总表中查找一列信息,比较简单。如果我们想查找多列信息该如何操作呢? 方法相似,我们可以在总表中插入deg_gene列,然后去差异基因表中查找基因ID即可,具体操作如下: 到这里,一个简...

文章 基因芯片知识

...独与一张芯片杂交,可以方便简单地在多张芯片之间进行比较。产生的芯片数据为单通道信号数据,这种方法产生的数据变异大,需要通过重复实验来减少误差。双染色技术是把两个样本用不同荧光标记后一起杂交到同一张芯片...

文章 一文教你使用Excel画GO富集分析图

...数再做GO富集分析图,那么请继续往下看。编为您讲解如何使用Excel画GO富集分析图。 数据文件准备 转录组测序分析的结果文件中一般都会有GO_enrich.xls的文件,该文件一般在每个差异组合的差异分析结果文件夹下。打开后...

文章 R 相关性系数计算 cor() 报错

转录组分析时,计算完FPKM后进行相关性计算并绘图,出现报错: Error in seq.int(0, 1, length.out = n) : 'length.out' must be a non-negative number 该报错发生在选择颜色的函数colorRampPalette()上,发现是给的值出现问题,而值来自于相关性计...

问题 WGCNA如何选择signed的计算方式

老师您好,我在跑WGCNA时发现同一模块基因的表达模式存在相反的情况,根据大讲堂提供的代码来看跑的应该是unsinged类型,请问现有代码中能调整为signed类型吗?

文章 CORNERSTONE:用项目管理助推企业转型升级

...务,不知道工作的进展,口头承诺、口头协作,任务协作比较杂乱、流程比较随意、风险比较大。用「CORNERSTONE」则集成企业微信端口,帮助团队碎片化操作,打造移动工作平台;绑定个人微信,项目动态即时触达,无缝接收消...

问题 老师好,做比较基因组学时候发现我的基因ID和转录本ID不是单纯的加了点1点2那么简单,如何做我才能只提取一个序列进行后续分析呢?

文章 进化树中如何添加热图?

之前编写了很多iTOL绘制进化树的文章,今天编再介绍一下进化树中添加热图(如下图所示)的方法。 使用的工具依然是iTOL这款在线软件,可点这里 绘一棵超酷炫的系统发育树 了解iTOL的使用方法。基础的使用方法就不...

文章 TCGA数据挖掘生物信息文章(肺鳞癌)

...RNAs-Protein互作网络。 多因素生存分析 采用多因素的COX回归模型对预后特征lncRNAs进行分析并绘制ROC曲线,发现他们都对预后具有显著的分类效果。 分类模型 对特征lncRNAs进行聚类分析并建立分类模型。 稳定性和有效性验...

文章 如何运用项目管理思维制定工作计划?

...(或子)目标,就要分析团队任务的整体完成情况是不是比较慢或者关键结果指标定的较高导致的;前者需要加快团队成员的整体工作(可将成员任务的截止时间提前,提高阶段时间内的任务完成量),后者则需要与直属上级或...