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文章 芯片原始数据标准化的几个包的安装

...外,也可以利用bioconductor的几个包,过需要注意介于R版本的问题,包的安装基于install.packages可能安装成功。 具体安装方法最好去网站查找R包和对应R版本,新老版本的R差别可能会很大。 下面基于R version 3.5.1下面基于列...

文章 蛋白纯化的原理、操作及注意事项有哪些?

...骤的数量始终取决于所需的纯度和蛋白的预期用途。   分析纯化通常利用三个特性来分离蛋白。首先,蛋白可以通过pH梯度凝胶或离子交换柱,根据其等电点进行纯化。其次,根据蛋白大小或分子量,可以通过体积排除色谱法...

问题 老师您好,我在用CoNet插件做网络分析时Permutaion出网络,所有的值都为0,怎么办

老师您好,我在用CoNet插件做网络分析时Permutaion出网络,所有的值都为0,怎么办?

文章 植物 SSR引物数据库 NAR 发核酸研究

...小以及序列信息。用户可以利用数据库进行微卫星DNA位点在线鉴定及分子标记在线设计。该数据库还提供了多种检索方式和下功能,所有数据和分析结果都可下。    该数据库为全球研究者们提供了在线的、友好的、便利...

问题 老师您好,我在用CoNet插件做网络分析时总是提示出错,请问是哪里出了问题?

问题 cytoscape插件conet运行报错

老师您好,我现在碰到的问题是在运行conet 插件时,第一步可以生成初始网络图,但是进行下一步计算时(如图所示设置),运行一会就报错,可以生成了图中sss文件,但是出现网络图,请问是哪里设置对嘛?

问题 GEO在线分析工具--GEO2R进行基因差异表达分析

你好,我对这个GEO2R分析时,数据分组理解。 在GEO中检索出所有样品之后,选择Define groups,选定差异比较分组的样品(如果是多平台数据,请先确定平台)。在Define groups下拉输入框中,先输入control,点击Enter键,确定第一个...

问题 GEO在线分析工具--GEO2R进行基因差异表达分析

你好,我对这个GEO2R分析时,数据分组理解。 在GEO中检索出所有样品之后,选择Define groups,选定差异比较分组的样品(如果是多平台数据,请先确定平台)。在Define groups下拉输入框中,先输入control,点击Enter键,确定第一个...

文章 Mapchart绘制基因染色体位置图时加标尺

...下: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解深入?图表看懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)...

问题 CDs序列和基因序列匹配

匹配的CDs序列和基因序列输入后却提示匹配,是什么原因呢

文章 R实现统计中的检验方法---方差分析ANOVA

...专注于珊瑚礁研究,喜欢用R各种清洗数据。 前言 方差分析(均数的显著性检验) 方差分析(Analysis of Variance,简称ANOVA),又称“变异系数分析”,是R.A.Fisher发明的,用于两个及两个以上样本均数差别的显著性检验。 1.适用...

文章 转录组比对软件HISAT2的使用说明

...考序列名称加上 'chr'    --version          输出软件的版本信息   -h/--help          输出软件的使用文档 大部分使用参数采用默认即可,具体参数设置需要结合分析需求。如果对转录组数据分析感兴趣的话,可以学习我的...

文章 affy包查看全匹配探针与错配探针

affymetrix表达谱芯片在设计时 除了全匹配(perfect match, pm) 探针(25-mer探针)进行进行荧光信号检测外,有时会设计错配(mismatch, mm) 探针(一个位点错配),基于PM-MM探针设计可以使检测低浓度靶序列的特异性和灵敏度大大提高,...

问题 我在NCBI上下的CDS数据,在进行提取基因家族的CDS序列时,提取出来

我看到CDS文件里的ID与基因家族ID对应,多了前缀和后缀,然后我想询问老师怎么在notepad里批量删除以下的信息

问题 python中安装上下好的lastal的zip格式文件。输入命令输出为语法错误