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问题 请问你们生信的软件一般在哪里下载的呢?mybiosoftware有些软件下载不了,求R8S软件的包,以及教程

文章 siRNA

...发现。 2001 年,Thomas Tuschl 提出合成 siRNA 会在哺乳动物细胞中诱导 RNA 干扰 (RNAi)。 如今,专门设计用于与 RNA 靶序列杂交并使其降解的“合成”siRNA 寡核苷酸已被广泛用于诱导细胞 RNAi。靶 mRNA 的降解能够有效“敲除”相应蛋...

文章 细胞转录组数据挖掘流程记录-BLCA膀胱癌(GSE192575)

为方便学习我们单细胞课程的学员利用我们提供的脚本快速的分析公共数据做数据挖掘,这里开始记录一下不同公共数据相关分析shell代码。大家有了我们的代码就可以照抄分析,提高分析数据效率,今天是第1个数据,后续还有...

问题 Admixture算STRUCTURE,出来的CV erro值随着K增大而递增是怎么回事,算了好几组数据都这样

...lele-order  --allow-extra-chr --set-missing-var-ids @:# #转换成plink格式 vcftools --vcf LDfiltered.vcf --plink \     --out plink #转换成admixture要求的bed格式 plink --noweb --file plink  --recode12 --out admixture \      --allow-extra-chr  --keep-allele-order #admix...

文章 deepseek绘图之--系统发育树

...变了这一局面。只需提供您的群体遗传数据(如Newick/NEXUS格式的树文件),并用自然语言描述定制需求(如标注群体分组),AI即可自动生成"端到端"绘图脚本:从数据解析(处理缺失数据、优化分支布局)、美学调整(智能分...

文章 叶绿体或线粒体基因组重复序列分类及鉴定

细胞器基因组相比整个核基因组小很多,被子植物叶绿体长度为120 kb - 160 kb,动植物及真菌线粒体长度为11kb - 750kb(部分植物超过 1 M,一些裸子植物超过 4 M)。细胞器基因组序列本身就比较短,重复序列也比较简单,分类方...

文章 blastall 参数详细说明

...小结果越可靠。-o :查询结果输出文件名-m: 比对结果显示格式选项,缺省值为0 ,即pairwise格式。另外还可以根据不同的需要选择1~6等不同的格式。-I :在描述行中显示gi号[T/F],缺省值F-v :单行描述(one-line description)的最大数目,...

文章 进化树美化操作详解- iTOL

...de/)注册账户,点击Tree upload即可上传已经构建成功的.nwk格式树文件。 2. 点击上传的树文件进入操作界面,我们主要通过右上角的控制面板进行基本操作。 (1)在Basic面板中,有Mode options、Label options、Branch options三大板块,...

文章 cytoscape插件BinGO安装以及GO富集分析和网络可视化

...学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入门...

问题 细胞定位预测所用的序列是基因的蛋白序列还是这类家族的结构域部分的蛋白序列?如MAP基因家族中某个基因的蛋白序列,还是这个基因中MAP结构域的蛋白序列

细胞定位预测所用的序列是基因的蛋白序列还是这类家族的结构域部分的蛋白序列?如MAP基因家族中,对家族成员进行亚细胞定位预测的时候,用的是某个基因对应的整个蛋白的序列,还是仅仅这个基因中MAP结构域的蛋白序列...

文章 字节跳动核心竞争力到底是什么?

...”直入主题的提问、回答“,”不要包装结果,不要向上管理,投leader所好“,”鼓励群聊不要单聊“,”坦诚清晰“的等原则,其目的是追求信息的高效流通。从经济学的角度上来说,也称为将企业内部成本降到最低。与此同...

问题 mapman.软件无法被java19.01识别.软件无法安装

问题 从ncbi中下载了sra文件到Linux中,如何把文件格式转换为fastq格式呢,复制文章中的命令显示报错

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问题 利用ParaAT2.0生成计算KaKs所需要的AXT文件,但是AXT文件为空

...s_Calculator分析。在用ParaAT2.0时我发现生成的比对结果(AXT格式文件)都是空文件,里面没有序列比对结果。我又用软件里提供的例子文本运行了一遍,结果也是一样。请问这是为什么?

问题 我的目的基因在即将要做的细胞株中通过qPCR定量mRNA表达量只有0.005,还有做CRISPR的必要吗