我想知道你们在山羊 数据进行call snp 的时候都是设置多大的内存和几个并行任务？
想请教老师一下。我搜出来的motif中，第6个开始，E值0.74，已经高于0.05了。这是不是意味着这些motif（6-15的）在我的基因家族里不存在？ 所以我需要调整参数，将motif设置成5才对。是吧。 我在分析时可以说：根据预测结果，...
...选择anr即可 nmotifs 15 ：在搜素的序列当中一共搜素的motif个数 -minw 6：搜素motif长度范围，最小有6个氨基酸 -maxw 200 ：搜素motif长度范围，最大有200个氨基酸 更改的参数： -nmotifs 10 →20 -maxw 200 →300 meme的各项参数:
例如：修改前 01EVMgene590510967.+.ID=GB_A01G0001; A01EVMmRNA590510967.+.ID=GB_A01G0001;Parent=GB_A01G0001; A01EVMCDS59056099.+0Parent=GB_A01G0001; 修改后： 01EVMgene590510967.+.ID=GB_A01G0001; A01EVMmRNA590510967.+.ID=GB_A01G0001.1;Parent=GB_A01G0001; A01EVMCDS59056099.+0Parent=GB...
...又称文氏图，是科研文章中最常见的图，可以用来表示多个数据集之间的关系。当然也可以进行集合运算。绘制韦恩图的工具有很多，在此，小编简单介绍几种在线绘制韦恩图的工具。 1. Venny 2.1 软件地址：http://bioinfogp.cnb.csic....
...仪系统通过显示RNA片段大小分布的详细画面（下图），能更好的评估RNA完整性。 注：总RNA样品经过不同时间降解，并且在Agilent 2100生物分析仪系统上使用真核细胞总RNA Nano分析法分析所得的样品；随着降解推进，可以观察到向...
老师我有个蛋白 通过ncbi结构域搜索之后没有目标蛋白domain 但在注释文件中注释为我需要的目标蛋白 该怎么办
PBS 是公开源代码的作业管理系统，在此环境下运行，用户不需要指定程序在哪些节点上运行，程序所需的硬件资源由PBS 管理和分配。 PBS 命令 PBS 提供4 条命令用于作业管理。 (1) qsub 命令—用于提交作业脚本 命令格...
...e.raw.vcf.gz，并使用vcftools软件进行过滤，并试验了使用nohup和不使用nohup后得到的文件结果比较，使用nohup得到的vcf文件结果有异常不能进行后续分析，具体如下： 1）不使用nohup时的代码 vcftools --gzvcf rice.raw.vcf.gz --recode --recode-INF...
老师，我在做2个基因组共线性分析时，得到的结果不对，但我找不到原因，您帮我看看，谢谢！
table_annovar.pl ./ -buildver all_sample_INS_DEL.vcf.gz -out all_sample_INS_DEL -remove -protocol refGene -operation g -nastring . -vcfinput ##报错如下，all_sample_INS_DEL.vcf.gz和unknow相关文件见附件 归档.zip NOTICE: the --polish argument is set ON automatically (use --nopolish ...
...本文件做集合交、并、差运算时可以使用sort和uniq sort a b | uniq > c # c 是 a 并 b sort a b | uniq -d > c # c 是 a 交 b sort a b | uniq -u > c # c 是 a - b awk常用命令 awk '{ sum += $2 } END { print sum }' myfile #这个命令将计算myfile文...
...，ctrl+C、ctrl+V就好了，少量基因的还OK，但是如果有几百个甚至上千个ID,手指会不会很酸爽？ 这里墙裂推荐一个软件，功能很强大，就是TBtools！今天主要讲它批量提取序列的功能(其他功能以后再说，你们也可以自己试试)，这...
...Perl 子程序也就是用户定义的函数。 Perl 子程序即执行一个特殊任务的一段分离的代码，它可以使减少重复代码且使程序易读。 Perl 子程序可以出现在程序的任何地方，语法格式如下： sub subroutine{ statements; } 调用子程序语...
老师实验室最近配置了服务器，我有个疑问，怎么可以像虚拟机那样跟本地可以挂载，习惯了虚拟机了我也是