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文章 TCGA中癌症的名称,简写和中文名称

...癌 DLBC Lymphoid Neoplasm Diffuse Large B-cell Lymphoma 弥漫性大B细胞淋巴瘤 ESCA Esophageal carcinoma 食管癌 FPPP FFPE Pilot Phase II FFPE试点二期 GBM Glioblastoma multiforme 多形成性胶质细胞瘤 GBMLGG Glioma 胶质瘤 HNSC Head and Neck squamous ...

问题 flexbar2.2版本去接头的过程中format不正确,报错文件格式不正确【课程RNAseq有参转录组数据分析】

... 1.我改写的参数是否正确,能够完成相同的任务么? 2.格式中format后面怎么写? 【2018年7月18号下午4点半补充问题】 1.对不起啊,存心大意了 2.修改了之后是这个情况 第二种情况才是我的本意,每次跑出来不对,...

文章 胃癌免疫侵润预后Signature数据挖掘-糖酵解

背景:肿瘤细胞为了适应复杂多变的微环境,肿瘤细胞产生了代谢异质性,这已成为癌症的一个重要特征。相对于正常细胞肿瘤细胞最常见的代谢改变之一是有氧糖酵解,也称为Warburg 效应。Warburg 效应是几乎所有癌细胞的代谢...

问题 如何合并两个单细胞测序中的两个子集?

我把CD8T和NK细胞取子集后进行了重聚类,resolution都是0.2,然后生成了CD8new.added.celltype.rds和NK.added.cellytype.rds两个文件,现在我要把这两个文件,但总是提示报错。 CD8new.added.celltype.rds的meta文件:CD8.added.celltype.metadata.tsv NK.added.ce...

话题 gbff 格式注释文件转换成gff3注释文件格式

文章 tensorQTL :最高效的QTL 分析工具

...变体和个体的基因型剂量(效应等位基因)的矩阵(plink 格式) Covariate 协变量: 表示每个个体的协变量值值的矩阵(协变量 x 个体) 计算方式见下文 eQTL分析之协变量计算 02 — 下载安装方法和使用方法 ...

问题 请问预测信号肽或者蛋白质亚细胞定位是用什么方法做的呢?谢谢老师

文章 三分钟让你理解什么是敏捷开发,这才是敏捷开发......

...知地理,但是也要对产品相关的知识领域有所涉猎。项目管理就是与产品密切相关的一个知识领域,同时也是产品经理日常工作中经常要负责的一部分内容。别问我为什么不是项目经理负责,因为很多公司没有…… 本文结合...

文章 转录组后续实验怎么做?

...个性化分析,求人不如求己,一切痛点都能解决: 1. 单细胞/空间转录组正在大火,高分文章必备,0基础学单细胞/空间转录组分析,做更牛的个性化分析,绘更漂亮的图,点这个链接:单细胞/空间转录组分析实操  2. 2区文章...

问题

...main序列出现问题,提取出来的domain为空。经过查证,是id格式不同导致的,但是应该怎么修改呢,希望各位老师能够答疑一下,附图片。 第二张图片是下载下来的pep.all.fa的文件。 第一张图片是通过命令分析出来的txt文件

文章 bedtools批量提取基因组指定位置序列

...vcf 文件(染色体碱基位置从0开始计数)。 -tab 指定输出格式。 $bedtools getfasta -fi GCA_001651475.1_Ler_Assembly_genomic.fna -bed id.bed>CM004359.1:0-10gtttagggtt>CM004359.1:100-200ttagggtttagggtttagggtttagggtttagggtttagggtttagggtttagggtttagggtttagggtttagggtttagggttt...

问题 docker镜像

请问下载好了镜像,但是有的软件镜像里面没有,所以需要另外在里面安装,该如何怎么安装呢?

问题 IBD 计算2

怎么把我计算的文件传给你,你看看, 我感觉我的格式都没有问题,因为没有报错信息,但是计算出来的值都是0

文章 科研汪必须知道的实验技术,你还差几门?

...相应的目的蛋白,“诱饵蛋白”和“捕获蛋白”均可通过细胞裂解物、纯化的蛋白、表达系统以及体外转录翻译系统等方法获得。此方法简单易行,操作方便。 注:GST是谷胱甘肽巯基转移酶(glutathione S-transferase) 二、足印法...

问题 自己电脑的docker image镜像如何共享到服务器的docker中

...望老师能够出一个教程(文字或视频版都可),展示关于怎么保存镜像、拷贝的镜像放服务器的哪个目录、以及怎么加载这个镜像的过程。 ps:服务器的Linux版本是centos7 —————————————————————————...