问题 HGMD数据库hg19版本

我们实验室最近在做全外基因注释，需要用到hgmd数据库，由于小实验室经费有限，找了好久没有找到，老师能付给发一份，非常感谢！

问题 重测序cnv变异需要至少多少乘数据？

老师我看到您再重测序课程中说CNV变异至少需要30乘数据，请问这个有文献说明吗？能不能分享一下

问题 利用360浏览器，访问Pfam数据库，搜某基因家族保守区域的隐马尔科夫模型数据文件，输入基因家族的PF号后，浏览器一直没反应，下图。然后Pfam数据库首页有红色框，提示启用javascript，我在360浏览器启用了，也换了其他电脑和其它浏览器结果还是一样，能告诉是什么原因吗？

问题 R怎样读取下载好了的TCGA数据

TCGA数据是用R包下载的，但是整理的时候出错，显示不能找到全部文件

问题 做转录组数据分析的时候不出图

老师，您好，我在根据RNAseq转录组数据自主分析课程，绘图的时候，在下面这一步始终不出图，这是因为什么原因呢？

问题 GWAS分析的表型数据不符合正态分布，但是极值材料表型是真实存在的，所以是保留原始数据还是用IRNT转换表型值或者剔除不符合正态分布的值呢

问题 请问wgcna怎么获得模块hub基因与该性状数据的相关性

就如上图这样，是提取什么数据来构建这个散点图的。 不知道怎么提取出这些数据，麻烦老师抽空说下。

文章 circos-调整基因组圈图的图片大小

...族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCN...

文章 甲基化数据中探针位置的分类

从TCGA下载下来的甲基化数据中，最后一列Feature type ，是对甲基化位点的位置分类。主要包括5类： N_Shelf：CpG岛上游2-4 kbp N_Shore：CpG岛上游0-2 kb CGI： CpG岛 S_Shore：CpG岛下游0-2 kb S_Shelf：CpG岛下游2-4 kbp 其示意图如下： 如...

问题 相同材料不同处理之间，可相同材料不同处理之间，可以放在一起做WGCNA分析吗？比如重金属和盐碱处理。

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

问题 对代谢数据的黄酮和酚酸与转录组进行WGCNA分析，如何准备文件？

...找到跟黄酮和酚酸含量密切相关的基因。我需要准备哪些数据文件呢？（1）是将黄酮和酚酸代谢物含量数据放一起，还是分别做黄酮和酚酸的 （2）基因数据，是用转录组所有的基因还是仅差异基因，还是黄酮和酚酸合成相关...

文章 基因家族分析linux软件安装列表

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

问题 BSA数据从哪里下载

问题 老师，您好！全基因组选择，利用自己的SNP数据（芯片SNP）进行基因型数据处理，beagle.27Feb25.75f.jar处理完成后，得到的imputed_snp里面没有SNP标记信息。

基因型数据格式

问题 请问一下，FPKM的数据不需要作背景处理、四分位数校正了吗？

我也是看了您的好几个回答，发现您的观点就是FPKM数据不需要作背景处理/四分位数校正，直接使用了。那么为什么这个数据不需要背景处理了呢？