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文章 Docker Volume - 目录挂载以及文件共享

...）添加一个读写层。如果运行中的容器修改了现有的一个已经存在的文件，那该文件将会从读写层下面的只读层复制到读写层，该文件的只读版本仍然存在，只是已经被读写层中该文件的副本所隐藏。当删除Docker容器，并通过该...

文章 机器学习文章套路-预测土壤枯萎病-ISME IF=9

...据随机分成两组：其中80%的数据用于预测模型训练构建，剩余20%的数据用于模型验证。机器学习使用到的方法包括：随机森林（RF）、支持向量机（SVM）和逻辑回归（LR）。作者分别对发病土壤和健康土壤的微生物群落进行学习...

文章 GenomicsDBImport 的多样本变异检测

...一次建库用的参数：# --genomicsdb-workspace-path $my_database \#向已存在的库添加新数据的参数：#--genomicsdb-update-workspace-path $my_database \$gatk --java-options "-Xmx$Xmx -Xms$Xms" \GenomicsDBImport \--genomicsdb-workspace-path $my_database \--intervals $interval_list \--b...

文章 R及R包的更新、移除、卸载

...load the namespace when a package is being detached. 如果要移除所有已加载的包，可参考https://stackoverflow.com/questions/7505547/detach-all-packages-while-working-in-r 中的回答： lapply(names(sessionInfo()$loadedOnly), require, character.only = TRUE)invisible(lapply(paste0('p...

文章 R语言计算两组数据相关性及对应p值的方法——psych包和Hmisc包

...数据集之间变量的相关性。这样的话可以先计算，然后再筛选。 这个函数要求的输入数据是矩阵格式，注意数据最少有5行 rcorr()这个函数的帮助文档也写到了 a numeric matrix with at least 5 rows and at least 2 columns (if y is absent). For print...

文章 搭建生信编程环境eclipse+perl+python+R（java环境）

...版本的java，eclipse，activeperl等，这些都是开源软件 百度搜索一下可到官方网站下载；Eclipse的用法和编程语言学习课程《perl编程入门》自行下载软件地址和方法：初学者建议观看视频《生信编程环境搭建》第一步：java下载与安...

文章 利用 NAS 对实验室数据进行存储备份

...面个人电脑登录都是使用的各自的账号，并为各自的账号分配文件夹，大家的数据都放在自己的文件夹下避免误删除他人文件。 NAS的使用： 上面开通的账号密码发给实验室每一位同学，之后大家可以共用这个nas存储，获得超...

问题 基因组注释提取，gff3_file_to_proteins.pl 序列出错，跟官网给的序列不一致

...序列其中一个序列： 而在官网给的蛋白序列fa文件中，搜索这一条序列： >ENSBTAP00000002107.8 pep primary_assembly:ARS-UCD1.2:10:91495432:91504569:-1 gene:ENSBTAG00000001605.8 transcript:ENSBTAT00000002107.8 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding ...

文章 详细介绍如何利用iTOL在进化树中用颜色体现样品分组信息

...一列：进化树中节点ID。iTOL在导入nwk文件时会为每个节点分配一个Node id，可以点击进化树的节点查看，如下： 第二列：设置修改类型为clade； 第三列：设置枝的颜色； 第四列：设置线条类型，这里用的实线； 第五列：设...

文章 Nature | 获得学术成功的3个技巧——享受社交生活很重要！

...我们的大脑在完成小的简单任务时会更好地工作，然后，分配时间以切合实际的时间表完成活动。1小时内写300个单词对你来说太多?那你可以花改成花两个小时完成，然后一步一步调整，最终实现这个目标。二、努力也要有技巧...

文章 一分钟让你学会PDCA循环项目管理模式

...，也是最重要的部分。有了计划，以及基于计划分解的、分配到每个人任务栏里的、有时间限制的具体任务，执行就变得责任明确、优先级清晰。 3、Check(检查) 每一件交代出去的任务，就像一个扔出去的回旋镖，最终...

文章 蛋白质定量—MaxQuant软件的使用

...认可度相对较高，可针对多种质谱数据。拥有自己的肽段搜索引擎- Andromeda。对于碰撞诱导离解(CID)、高能碰撞离解(HCD)和电子转移离解(ETD)所产生的串联光谱可以很容易地用MaxQuant进行分析。 使用 1.打开maxquant界面 6大参数配...

文章 PM必须懂的4种项目管理模型

...目中最高风险的元素。 3. 构造阶段在构建阶段，所有剩余的构件和应用程序功能被开发并集成为产品，所有的功能被详细测试。 4. 交付阶段交付阶段的重点是确保软件对最终用户是可用的。交付阶段可以跨越几次迭代，包...

文章 如何将SNP标记转化成可跑胶验证的CAPS标记

...快捷和自动化程度高。 由于具有这些优势，CAPS标记技术已成为现在生物学研究的一个非常重要的分子标记技术。其在种质鉴定、辅助育种、基因鉴定和图谱构建等领域得到相当广泛的应用。

文章 阿里云 oss linux命令行下载数据使用方法

...examplefile.txt localfolder/exampleobject.txt以下输出结果表明文件已成功下载至本地目标文件夹。0.720812(s) elapsed有关下载文件的更多示例，请参见cp（下载文件）。