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问题 老师我想问一下，MENA在analysis the network 报错的问题

This is your first time to run parameter calculations on soil20231205 at 0.890 threshold. It will take a few minutes...R project wrong! Please report web administrator.setwd("D:/wwwroot/MENA/datasets/196868ld/1701851366")library(sna)cor.data<-read.table("soil20231205 Pearson Correlation_0.890 4 R...

问题 structure_plot.r: command not found

老师，您好，运行 structure_plot.r  -d ./ -s admixture.nosex的时候，提示bash: structure_plot.r: command not found 这是怎么回事呢？ 用的是这个镜像：

文章 mysql备份数据库恢复导入

...据库编码mysql>set names utf8;（3）导入数据（注意sql文件的路径）mysql>source /home/abc/abc.sql;方法二：mysql -u用户名 -p密码 数据库名 < 数据库名.sql#mysql -uabc_f -p abc < abc.sql

问题 输入绘制circos图时出现错误

...e/scipt/circos.pl": No such file or directory，哪位老师能知道解决的方法？

问题 三倍体等多倍体怎么做比较基因组

三倍体等多倍体怎么做比较基因组，是用全基因组做，还是挑其中一套染色体做呢。因为担心如果用全基因组做单拷贝基因会很少。，一套染色体做又担心不能说明亚染色体的情况

问题 TCGA转录组数据有3中类型，下载哪一种比较好？

GDC上的TCGA的转录组数据，目前支持3中类型下载，分别是Count, FPKM和FPKM-UQ， 下载哪一种比较好呢？

问题 docker安装 设置共享目录想查看文件显示operation not permitted

如图所示，按照“docker desktop安装与使用”课程所教，到这一步出现了问题。且没有像老师那里那样弹出“是否share it”的窗口。

问题 各位老师好，jcvi使用时报错如下，请问应该如何解决呢？非常感谢！

使用jcvi绘制共线性线图时报错如下： 网上搜索的说有空行或者是因为没有填颜色，但我的layout文件没有这些问题，请问应该如何解决呢？

问题 各位老师好，jcvi使用时报错如下，请问应该如何解决呢？非常感谢！

使用jcvi绘制共线性线图时报错如下： 网上搜索的说有空行或者是因为没有填颜色，但我的layout文件没有这些问题，请问应该如何解决呢？

问题 如果interproscan数据库只指定小部分，对注释结果影响大吗？

请教老师，-appl CDD,COILS,Gene3D,Pfam,SMART（运行ok，约4小时），是否还需要增加哪些必须的数据库？谢谢

文章 bioperl同时读取双端的fastq文件

bioperl可以读取fastq文件，对其进行处理，而且一般是双端的序列，可以同时读取两个文件，方法如下： while ( my $obj1=$fq1->next_seq() and my $obj2=$fq2->next_seq() ) {     my ($id1,$id2)=($obj1->id,$obj2->id);     .... } 这样就可以同...

问题 vennerable 三维及以上如何实现按数据大小比例并自定义配色方案

再利用vennerable包VennThemes函数时，我不知道怎么分face，因为三维及以上，其交集的个数很多，请教大家一下！

问题 TCGA中比如说我要下病例报告，slide，还有msi怎么下载?

这个临床数据下载挺全的，但是胃癌相关的：病例报告，slide，还有msi怎么下载? https://www.omicsclass.com/article/1125

问题 在JGI上下载gff文件和fa.gz文件有问题，感谢答疑

我下载的这两个文件对吗，如果是的话，我这条命令为啥有错误啊 感谢答疑

问题 去除文件中的xxxxx.1G026400.1中的.1用sed命令如何实现

文件中存在xxxxx.1G026400.1，目标是去除转录本中的.1。 用sed命令的时候 会成为xxxxxG026400如何实现 xxxxx.1G026400？