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文章 linux下解压命令

...很多压缩文件，种类较多，这里就介绍一下各种常见类型的文件如何压缩以及解压缩。 .tar  解包：tar xvf FileName.tar 打包：tar cvf FileName.tar DirName 要注意  tar 是打包，而不是压缩哦！ .gz 解压1：gunzip FileName.gz 解压2：gzip -...

问题 动植物基因组课程，数据筛选步骤提示数据库错误

... Error: Not a valid version 4 database.   搜索百度要么下载版本4的数据库，要么 更新blast+ （https://blog.csdn.net/zhangjunya/article/details/108279859）。查看了一下课程所用镜像和数据库，无法操作啊（能力有限），还是请老师帮忙吧，谢谢！...

问题 挂载共享文件夹，每次打开bio-linux都要重新挂载sudo mount -t……

我自己在Oracle VM VirtualBox里重新设置了一个新的共享文件夹路径（D:\Job……），但每次打开bio-linux都要重新挂载，要输入sudo mount -t vboxsf gene_family1 /home/manager/gene_family1 可以挂载一次，以后每次不用重输挂载命令吗

问题 比较基因组学分析共线性中 No module named jcvi.compara

我是下载安装的课程中的LINUX 一个报错：manager@bl8vbox[mcscan_between_genome] /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH Pp --cscore=0.7 /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python: No module named jcvi.compara 之后我去看了根目录下是否...

问题 R中apply同时计算行和列使用c(1,2)，为什么不起作用

... 4    6    8 question：上述使用了c(1,2)来同时计算行和列的平均值，但为什么结果仍旧是原矩阵？

文章 CentOS 7 清理删除卸载 Docker 环境

...mount /var/lib/docker/devicemapper 6. 卸载 docker     查看已安装的 docker 包 # yum list installed | grep docker     卸载相关包 # yum remove docker-engine docker-engine-selinux.noarch sudo yum –y remove docker-buildx-plugin.x86_64 docker-ce.x86_64 docker-ce-cli.x86_64 doc...

问题 叶绿体基因组GetOrganelle组装时出现killed，内存从10G改为30G又改成70G，但是还是不行，程序终止。

1、在get.sh.o文件中，出现：Retrying with more reads。 2、GetOrganelle_out文件夹中只有，没有组装的序列结果。

问题 计算KaKs时，axt文件中两序列长度一致，但是仍然提示“not equal”（详情见下图）

这是我截的图，具体可见长度相同，下边我把具体序列贴出来。 Gh_A03G1821.1&Gh_D12G0330.1MLSGLMNLLRACFLPRSDRHVHTSSENGGRQDGLLWYKDSGQHFNGEFSMAVVQANNLLEDQSQLESGCLSLHESGPYGTFVGVYDGHGGPETSRYINDHLFQHLKRFTSEQQGMSADVIRKAYQATEDGFLSLVTKQWPMKPQIAAVGSCCLVGVICNGTLYVANLGDSRAVLGRAVKATGE...

问题 picard.jar安装，已从网站上下载picard.jar 2.6.0运行jar -O picard.jar显示 Illegal option: O需要怎样改正

改为0后需要添加怎样的参数

文章 BWA mem比对报错 paired reads have different names 解决

...s情况，导致比对出错 问题解决：采用bbmap进行fastq文件的修复 1.软件安装 conda安装 conda install -c bioconda bbmap 或直接安装 wget https://nchc.dl.sourceforge.net/project/bbmap/BBMap_39.01.tar.gz 2.fq文件修复 sh ./repair.sh in=r1.fq in2=r2.fq out=r1.rep...

文章 subset_row.r 提供列表，在行上取数据子集

...t file name prefix [default demo] 参数说明： -i 输入要取子集的数据， ID TCGA-D7-A74A-01A-11R-A32D-31 TCGA-BR-7704-01A-11R-2055-13 TCGA-VQ-A91N-01A-11R-A414-31 TCGA-CD-A4MH-01A-11R-A251-31 TCGA-BR-7715-11A-01R-2055-13 TCGA-EQ-8122-01A-11R-2343-13 TCGA-BR-7704-11A-01R...

问题 无法链接到docker守护进程

...containerd/blob/main/docs/PLUGINS.md#version-header" 然后我按照GitHub的导航操作了还是没解决这个报错，请问我改怎么解决这个问题？

问题 无法链接到docker守护进程

...containerd/blob/main/docs/PLUGINS.md#version-header" 然后我按照GitHub的导航操作了还是没解决这个报错，请问我改怎么解决这个问题？

文章 TCGA癌症数据库挖掘发表的大文章CNS级别汇总2019

TCGA Research Network Publications A comprehensive list of publications by The Cancer Genome Atlas program. This list is updated as the TCGA Analysis Network continues to study and mine the data. Cancers Selected for Study lists original marker publications by cancer type. Supplemental and ...

问题 建立共享文件夹失败错误提示wrong fs type, bad option, bad superblock on bioshare

... info is found in syslog - try       dmesg | tail  or so按照网上的方法sudo apt-get install nfs-common尝试解决，但是没有