我看您在组学大讲堂中回复的“他的plink命令是 /biosoft/miniconda/bin/plink,我试了一下在 /biosoft/miniconda 目录下下载了v1.9版本plink,使用 /biosoft/miniconda/plink 就能够运行了”,这个具体怎么运行呢?老师您可以教一下我吗?
下面是ST_AT.collinearity 的结果 ############### Parameters ############### # MATCH_SCORE: 50 # MATCH_SIZE: 5 # GAP_PENALTY: -1 # OVERLAP_WINDOW: 5 # E_VALUE: 1e-05 # MAX GAPS: 25 ############### Statistics ############### # Number of collinear genes: 0, Percentage: 0.00 # Number of a...
...时 出现以下错误> exprSize = checkSets(multiExpr),我看过您的回答:checkSets设置一下参数(checkStructure=T),能否详细点,在哪里设置参数呢?> multiExpr[[1]]$data[1:5,1:5]这个问题该怎么样解决?谢谢您,可以的话可否加个微信 182898168...
看了组学大讲堂里面的几篇贴子,用了2种方法都没有成功下载数据 第一种,按照操作方法获得了SRR List文件: 按照规律生成ftp下载地址: 粘到迅雷中发现都是空的。 第二种方法是获得了SraRunInfo.csv文件,如下: 在bi...
...l formed? chr.info文件如图所示,全在Linux环境下用脚本整理的,是我哪里搞错了?还是数目太多?(用的scaffold,MCScanX也是,全部600个scaffold放到配置文件就报错,只放基因家族所在200个scaffold就能正常运行)
现在一直在跟随组学大讲堂学习家族文章和BSA,但是都需要docker,看docker安装的课程,也没看到在服务器上具体安装,例如BSA中,mutplot这是一个软件吗?还是脚本?
R version 4.1.1 (2021-08-10) 载入需要的程辑包:Rcpp Error: package or namespace load failed for ‘Rcpp’: package ‘Rcpp’ was installed before R 4.0.0: please re-install it 错误: 无法载入程辑包‘Rcpp’ 停止执行
一般我们同时遍历多个相关的列表时,往往用数组下标遍历: my @a = ( ... ); my @b = ( ... );my @c; foreach my $i ( 0 .. $#a) { my ( $a, $b ) = ( $a[$i], $b[$i] ); push @c, $a + $b; } 其实还可以这样: use List::MoreUtils qw(pairwise);my @c = pairwis...
...现问题原因: 有可能是 my.cnf 配置文件中设置了 [mysqld] 的参数 socket ,而没有设置[client]的参数socket mysql.sock 文件有什么用: mysql 支持 socket 和 TCP/IP 连接。那么 mysql.sock 这个文件有什么用呢?连接localhost通常通过一个Unix域套...
... this error message and the time and date of the error. 我用网站提供的示例数据也试了,也换了360浏览器,结果还是一直提示这个错误。请问老师这是为什么呀
...经检查输入文件均可以打开没有问题,无法进行注释结果的整理。
从github上安装qtlseq后,先后又安装了snpEFF 和trimmomotic, 但是运行test中的程序时会出现如下错误,没有安装numpy,然后我安装之后,依然出现这个错误
chainsaw工具,用于预测蛋白序列的酶切结果 运行命令: chainsaw test.fasta 报错: locale::facet::_S_create_c_locale name not valid 解决: 在当前环境中运行命令 export LC_ALL=C; unset LANGUAGE 之后再操作chainsaw工具,屏幕输出: Reading database: ...
在R语言中如何获取两个向量之间的交集与并集? 交集可以用intersect 并集可以用union 譬如针对A,B两个向量: > A=LETTERS[1:10]> B=LETTERS[5:15]##交集 > intersect(A,B)[1] "E" "F" "G" "H" "I" "J" ##并集 > union(A,B) [1] "A" "B" "C" "D...
...脚本呢我下载镜像文件到本地,解压后是一堆随机码命名的文件