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问题 您好老师,我想咨询一下plink 软件core dumped报错

我看您在组学大讲堂中回复“他plink命令是 /biosoft/miniconda/bin/plink,我试了一下在 /biosoft/miniconda 目录下下载了v1.9版本plink,使用 /biosoft/miniconda/plink 就能够运行了”,这个具体怎么运行呢?老师您可以教一下我吗?

问题 老师请问这个没有共线性结果是哪里出问题了

下面是ST_AT.collinearity 结果 ############### Parameters ############### # MATCH_SCORE: 50 # MATCH_SIZE: 5 # GAP_PENALTY: -1 # OVERLAP_WINDOW: 5 # E_VALUE: 1e-05 # MAX GAPS: 25 ############### Statistics ############### # Number of collinear genes: 0, Percentage: 0.00 # Number of a...

问题 检查数据是否正确时 出现以下错误:> exprSize = checkSets(multiExpr) Error in checkSets(multiExpr) : data does not appear to have the correct format. Consider using fixDataStructureor setting checkStructure = TRUE when calling this function.

...时 出现以下错误> exprSize = checkSets(multiExpr),我看过您回答:checkSets设置一下参数(checkStructure=T),能否详细点,在哪里设置参数呢?> multiExpr[[1]]$data[1:5,1:5]这个问题该怎么样解决?谢谢您,可以话可否加个微信 182898168...

问题 NCBI中下载SRA数据不成功

看了组学大讲堂里面几篇贴子,用了2种方法都没有成功下载数据 第一种,按照操作方法获得了SRR List文件: 按照规律生成ftp下载地址: 粘到迅雷中发现都是空。   第二种方法是获得了SraRunInfo.csv文件,如下: 在bi...

问题 求助大佬,circos图chr.info文件怎么整理?

...l formed? chr.info文件如图所示,全在Linux环境下用脚本整理,是我哪里搞错了?还是数目太多?(用scaffold,MCScanX也是,全部600个scaffold放到配置文件就报错,只放基因家族所在200个scaffold就能正常运行)

问题 老师你们好,想问一下如何在自己服务器上下载docker

现在一直在跟随组学大讲堂学习家族文章和BSA,但是都需要docker,看docker安装课程,也没看到在服务器上具体安装,例如BSA中,mutplot这是一个软件吗?还是脚本?

问题 老师,您好,在用qiime2 运行dada2 时,报错

R version 4.1.1 (2021-08-10)  载入需要程辑包:Rcpp Error: package or namespace load failed for ‘Rcpp’:  package ‘Rcpp’ was installed before R 4.0.0: please re-install it 错误: 无法载入程辑包‘Rcpp’ 停止执行

文章 perl中一次遍历多个列表

一般我们同时遍历多个相关列表时,往往用数组下标遍历: my @a = ( ... ); my @b = ( ... );my @c; foreach my $i ( 0 .. $#a) {     my ( $a, $b ) = ( $a[$i], $b[$i] ); push @c, $a + $b; }  其实还可以这样: use List::MoreUtils qw(pairwise);my @c = pairwis...

文章 MySQL报错:ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/tmp/mysql.sock'

...现问题原因: 有可能是 my.cnf 配置文件中设置了 [mysqld] 参数 socket ,而没有设置[client]参数socket mysql.sock 文件有什么用: mysql 支持 socket 和 TCP/IP 连接。那么 mysql.sock 这个文件有什么用呢?连接localhost通常通过一个Unix域套...

问题 MENA网站上传数据提示错误

... this error message and the time and date of the error. 我用网站提供示例数据也试了,也换了360浏览器,结果还是一直提示这个错误。请问老师这是什么呀

问题 非模式物种建立注释库问题

...经检查输入文件均可以打开没有问题,无法进行注释结果整理。

问题 安装qtlseq后,运行程序出现ModuleNotFoundError: No module named 'numpy'错误

从github上安装qtlseq后,先后又安装了snpEFF 和trimmomotic, 但是运行test中程序时会出现如下错误,没有安装numpy,然后我安装之后,依然出现这个错误

文章 运行Linux版本ProteoWizard中chainsaw工具时报错

chainsaw工具,用于预测蛋白序列酶切结果 运行命令: chainsaw test.fasta 报错: locale::facet::_S_create_c_locale name not valid 解决: 在当前环境中运行命令 export LC_ALL=C; unset LANGUAGE 之后再操作chainsaw工具,屏幕输出: Reading database: ...

文章 R语言获取两个数组向量交集与并集

在R语言中如何获取两个向量之间交集与并集? 交集可以用intersect 并集可以用union 譬如针对A,B两个向量: > A=LETTERS[1:10]> B=LETTERS[5:15]##交集 > intersect(A,B)[1] "E" "F" "G" "H" "I" "J" ##并集 > union(A,B) [1] "A" "B" "C" "D...

问题 请问怎么从镜像里拷贝pl脚本2.0

...脚本呢我下载镜像文件到本地,解压后是一堆随机码命名文件