话题 单细胞转录组数分析

话题 单细胞转录组 拟时序分析

文章 蛋白质定量—MaxQuant软件分析多样品定量

...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容：linux、perl、R语言画图，更多免费课程请点击以下链接： htt...

话题 单细胞转录测序 Marker基因查找

话题 单细胞转录组KEGG富集分析

文章 B/T细胞分类：

初始B细胞 naive B (Bn cells)、记忆B细胞memory B (Bm)、增殖B细胞(proliferative B cells),生发中心B细胞germinal center B (Bgc)、循环B细胞(cycling B cells)和抗体分泌B细胞（antibody-secreting cells ASC） Bn cells:   IGHD/TCL1A Bm cells:  CD27/TNFRSF13B Bgc...

文章 OrthoFinder 输出结果文件说明

...拷贝直系同源组。 2. Orthogroup_Sequences 文件夹 均为 FASTA 格式文件，记录了每个 Orthogroup 所包含的基因 / 蛋白的序列信息 3. Single_Copy_Orthologue_Sequences 文件夹 均为 FASTA 格式文件，记录了每个单拷贝 Orthogroup 所包含的基因 / 蛋白...

问题 单细胞测序数据rds文件替代某列信息

老师您好!我想问下单细胞测序数据如何将rds文件和pbmc.metadata.tsv文件中的某列信息给替换成其它信息？麻烦老师解答，谢谢

问题 突然出现不能为虚拟机打开一个新任务，没有找到跟我一样的报错问题。详细报错如下

Call to WHvSetupPartition failed: ERROR_SUCCESS (Last=0xc000000d/87) (VERR_NEM_VM_CREATE_FAILED). 返回 代码: E_FAIL (0x80004005) 组件: ConsoleWrap 界面: IConsole {872da645-4a9b-1727-bee2-5585105b9eed}

文章 不同物种基因组之间的比对与可视化

...比对情况，可以使用其他工具来将PAF文件转换为可视化的格式 paf文件可视化 软件 minidot # 下载minidotgit clone https://github.com/lh3/minidot.gitcd minidotmake./minidot  alignment.paf > alignment.epsepstopdf.pl alignment.eps alignment.pdf R dotplot： l...

文章 immunedeconv 包安装错误： download from 'https://api.github.com/repos/icbi-lab/immunedeconv/tarball/HEAD' failed

.../tarball/HEAD' failed 可以用Rstudio安装包： 以管理员身份打开Rstudio：   然后在终端依次运行： 以下代码： #设置镜像，local({r <- getOption("repos")  r["CRAN"] <- "https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"   options(repos=r)}) #2 ...

问题 用singularity做Braker时，出现与前文相同的报错，求解

师，您好！我遇到和动植物基因组组装课程，结构注释部分，运行braker.pl出错 - 组学大讲堂问答社区 (omicsclass.com)相同的问题。已用管理权限解决写入的问题，但请问关于以下报错可以怎么解决呢？

问题 WGCNA分析，导出cytoscape的.nodes文件 但是打开txt文档里面的内容是空白的，代码中参数有基因的名字，恳请各位大佬帮忙解决问题。

问题 你好老师有关网络图绘制的问题

...r file with node annotation here.请问这是上传哪个文档啊，后面怎么操作呢(因为网上看到的博客写到这个地方就没了)，2.用Cytoscape软件中CoNet插件绘制网络图时老是出现错误这个是怎么回事具体参数是怎么设置的呢

问题 Rstudio为什么不显示菜单栏？

我是先安装的R，后安装的Rstudio，步骤都没有报错，打开Rstudio之后却没有菜单栏，但是鼠标放到菜单栏应该在的位置偏下一点又是可以按到菜单的，仅仅是看不到，这怎么解决啊？