找到约 15 条结果

问题 GSDS网站本地部署使用一次后，再提交就显示空白页

我已经通过贵公司提供的方法用Docker部署了本地的GSDS网站，能正常打开，但是使用一次后，再Submit就显示空白页，之后就没反应了。这样该怎么处理

问题 verkko组装后怎么生成.hic和.assembly文件

...过verkko v2.2.1版本进行基因组组装后，直接生成了挂载好的genome.fa文件，但是里面有些染色体需要手动调整，我如何区生成.hic和.assembly文件，我看教程里似乎要组装后genome.fa文件进行与hic数据的比对，但是verkko的组装结果文件里...

问题 老师，您好，不能用GFF文件提取exon位置信息文件，结果文件是空的

我的GFF文件是这样的，NCBI下载的，请问下该怎么处理啊老师？

文章 topGO报错

在r包topgo里面绘制node图的函数是showSigOfNodes()，其中提供的第二个参数不能有0，否则会报错： showSigOfNodes(sampleGOdata, score(resultKS.elim), firstSigNodes = 10, useInfo = "all") Error in if ((n <- as.integer(n[1L])) > 0) { :           missing value w...

问题 kegg通路热图是要展示所有差异基因还是部分差异基因

我是有两个品种，三个处理时间点，做kegg注释热图时差异基因太多，是需要挑选fpkm值差异大的基因做热图吗？用log2fc值做两个品种比较的热图可以吗

问题 LDdecay

...OutStat ld.stat 老师，用上面这个命令，但是跑出来是0，用的是自己的数据，前一步都还正常，不知道popid.txt如何设置，这里是按照示例文件，放了所有样品的集合，但是跑出来是如下这样 the Number of subPop samples[found in VCF] is 0 sub...

文章 feature 重要性排序棒棒糖图

...装）==================# 如果是第一次运行，请取消下面两行的注释并运行安装# install.packages("ggplot2")# install.packages("dplyr")# install.packages("data.table")  # 用于 fread# ================== 2. 加载所需库 ==================library(ggplot2)library(dplyr)library(d...

文章 TCGA临床数据各列含义

... Additional notes on the clinical sample. TCGA免疫浸润分析课程：https://study.163.com/course/introduction/1211864801.htm?share=1&shareId=1030291076 TCGA铁死亡+lncRNA分析课程：https://study.163.com/course/introduction/1212128802.htm?share=1&shareId=103029107...

问题 能否不跑Repeatmasker 产生结果文件contig.fa.tbl

我第一次注释重复序列时没有给DNA-MITE进行分类，但是最终的统计信息里MITE类的转座子占了20%，然后我重新使用DeepTE对MITE转座子进行了分类，请问老师能否不重新跑RepeatMasker得到contig.fa.tbl的重复序列信息统计文件

问题 请问差异代谢物数量过多能否调高筛选条件？最大能提高多少？

利用VIP>1；p<0.05筛选出的差异代谢物数量太多了，能不能吧VIP的阈值提高至1.3或者1.5呢？

问题 安装gdc client 时出现问题，打开提示。。。too few arguements 闪退

老师好！我是生信小白。在安装gdc client 时出现问题，打开就提示。。。too few arguements 闪退，怎么办？系统是win10，下载的也是windows相应的。

问题 请问root会影响环境变量吗？

麻烦请看下，我按照老师的要求把新装的python路径放到环境变量中，放在上一个版本之前。 source 后 which python显示路径已经更新，一切ok。 但是切换root后再次查看路径确显示之前老版本了。 即使再次切换成普通用户还是显...

问题 老师您好，我初学生信，在使用KaKscauculator时需要用到paraAT，但是出现了问题

我按照他的使用说明连给的测试文件都运行不了，想问一下老师是什么原因。

问题 如何在linux服务器上安装paircoil2

我从paircoil2的网站上下载了paircoil2-linux-amd64.tar.gz安装包，然后上传到服务器上并解压后， 如图所示，怎么安装运行paircoil2？ 我看README中说是如下这样安装 请问这是什么意思，怎么安装呢，怎么放到家目录下之类的？ ...

问题 叶绿体GetOrganelle组装不成环，调整后还是不行

...要怎样调整其成环呢 - 组学大讲堂问答社区 (omicsclass.com)的方法调整后，还是出现问题： 1、GetOrganelle组装：增加轮数（-R选项），重新指定更近缘物种的叶绿体完整组装序列作为参考（-s 选项），或者不指定-s选项，均不成环：...