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问题 GEO2R三组之间怎么比较呢?

请教老师,看了一些GEO2R教学视频,都是分两组进行比较(normal and tumor),想问下三组之间怎么比较呢? 正常对照组、疾病组、治疗组,然后想看看药物对疾病靶点

文章 linux中进程状态

...行队列中等待)  2. 中断(休眠中, 受阻, 在等待某个条件形成或接受到信号)  3. 不可中断(收到信号不唤醒和不可运行, 进程必须等待直到有中断发生)   4. 僵死(进程已终止, 但进程描述符存在, 直到父进程调用wait4()系统调用...

问题 求助,docker toolbox虚拟机挂载共享系统文件夹失败

按照课上讲述,使用虚拟机安装了docker,启动和进入容器没有问题,但是共享文件夹里数据文件看不到,尝试了restart,也不行,情况如附图所示。求指点,多谢!

问题 SSR查找及引物设计

使用网易云课程《Perl语言高级编程》中老师同款perl脚本做SSR查找及引物设计时出现问题:unescaped left brace in regex is deprecated here(and will be fatal in Perl 5.30),passed through in regex;marked by <-- HERE in m/([ACGT]{2})\1{ <-- HERE 0.5}/ at ../prim...

问题 hmmer二次搜索结果空白,第一次结果有是什么情况?

然后就是在后续操作中,会出现无geneID提示是什么原因

问题 求助,怎么把vcf文件中非变异位点去掉呀?

也就是ALT列.行 我想用vcftools或者bcftools命令没找到官方命令 自己写命令删除ALT列.行它正常运行但是生成文件没办法正常打开,显示binary文件求大佬解答

文章 ssh登陆报错

...ic,password). 这个警告信息是由于SSH客户端检测到目标主机身份验证信息发生了变化。这可能是由于目标主机SSH密钥已更改。 解决这个问题需要找到并编辑 家目录下~/.ssh/known_hosts 文件,在文件中找到包含目标主机信息...

问题 抱歉打扰,我在做circos时遇到了下面问题,看到了您也遇到相似问题,想知道您是如何解决,期待您回复。

manager@bl8vbox[laccasecircos] /biosoft/circos/circos-0.69-6/bin/circos -conf /home/manager/share/laccasefamily/laccasecircos/config3.txt -outputdir ./ -outputfile ABRE3a debuggroup summary 0.43s welcome to circos v0.69-6 31 July 2017 on Perl 5.018002 debuggroup summary 0.43s current working direc...

问题 请问DAVid 数据库 可以对 谷子这个物种 进行注释检索吗?

利用谷子基因号(来自于JGI数据库)例如 seita.1G36240 这种形式 基因ID . 在第一步时:输入上面基因ID号,不知道选择什么形式 进行 检索

问题 什么在使用TCGAbiolinks包下载数据时会出现以下问题呢?

这是TCGAbiolinks下载数据问题 加载devtools时总出现这样问题是什么呢?

问题 比较基因组,无法获得pep和cds序列

在学习比较基因组课程中,我使用从葫芦库基因组数据库中下载genome.fa,cds.fa,pep.fa,gff文件运行01.prepare_data.sh脚本时可以正常获得gff文件,但是在提取cds和ped时,出现报错 报错如下

问题 mcmctree运行报错"error: raise NGENE?"

老师好,我工作文件夹是 10.time_tree_cds 日志文件显示:"error: raise NGENE?" 但课程讲mcmctree控制文件里并没有NGENE这个参数 —————————————— 输入文件如下: 序列文件 标定两个分化时间树文件: 控制...

文章 linux下ClustalW2安装

...个下载链接。 FTP和HTTP下载都可以,然后找到最新版本linux 64位安装包。 右键复制链接地址,在linux中使用wget 命令下载。 wget  http://www.clustal.org/download/current/clustalw-2.1-linux-x86_64-libcppstatic.tar.gztar -zxvf clustalw-2.1-linux-x86_64-lib...

问题 安上了EPIC又遇到问题了,老师您有时间了帮我看下。

python可以用,perl是这样显示

问题 建立基因组索引时gene_length文件出问题

老师我在服务器里用咱们镜像做索引时gene_length文件出错了,我找了相关问题回答,但是不知道这个脚本应该修改哪里才好