问题 hifiasm结果偏大怎么办，是什么原因呢

基因组survery做出的结果是1g，但是hifiasm的拼接结果是2g，是什么原因呢，需要用purge_dup去冗余吗

问题 RNA seq要用什么数据来构建WGCNA

  RNA SEQ数据有原始的计数数据，标准化后的计数数据，还有转化后的FPKM或者RPKM数据这么多种。请问各位老师，应该拿哪一种数据来构建WGCNA网络

问题 16S课程 启动镜像（DockerDesktop）

我之前安装的docker最新版本，使用window shell运行 docker run -it -m 20G --cpus 4 --rm -v D:/ampliseq:/work omicsclass/ampliseq:v2.0 没有问题。 但是，我现在想使用你们推荐的docker（主要为了调整CPU和内存）。 运行 docker run -it -m 20G --cpus 4 --rm -v D...

问题 GEO下载lncrna芯片注释问题

...是对探针进行注释，换了好几个芯片，都是发现没有对应的GPL注释文件，就算打开，也只有 来源与Platform GPL16956 这样一个没有什么实质意义啊，无法下一步， 或者是Platform GPL19615 这个平台也是无法出现正常gene symbol，不知道...

问题 一次搜索多个结构域

...rabidopsis_thaliana.gene.pep.fasta”； 对于ring finger这种pfam众多的家族，可以一次性把所有pfam一起做出来吗？还是一次只能搜索一个然后手动把搜索出来的所有序列和ID合在一起？谢谢老师解答！

问题 用iTOL美化进化树时出现如下问题，求解答。

对分支颜色修改以及拖拽数据进去时都会出现右上角红框所示，无法保存修改的东西，拖入数据显示无法找到对应ID,自己的数据和实例数据都是如此，希望高手解答，谢谢。

问题 请问左边这个图是什么图呀？应该用什么 进行构图？

请问大神们 这个左边的应该怎么画？这个图叫什么图呀？用文章中材料方法里的那种R包话呀？

问题 制作启动子顺式元件时，为什么报错呢Error:35

我按视频教程里的制作启动子顺式元件的，为什么报错呢;错在哪里呢

问题 蛋白质全长多序列比对

去掉了所有结构域缺失的序列想做做蛋白质全长多序列比对看看，结果发现序列缺失，如图：，但是前期在数据库看的时候确实有这个结构域如图，打开WRKY_pep_final_aligned文件后发现是这种情况：，但是其他序列比对后是，感觉...

问题 老师，您好，我在16S数据实操中的qiime聚类生成otu的第一个方法中操作 pick_de_novo_otus.py 这一步，缺少了很多文件，之后我又单独操作的，在操作第三步 # Assign taxonomy command 时，没有出现qiime_rep_set_tax_assignments.txt 这个文件，第四步也没有办法操作，是哪里出问题了呢

问题 基因组间共线性关系图位置信息错误

这里面蓝色条带应该去到下方红色2号染色体(中间，但是成图之后去到了红色2号染色体左端。检查了bed文件也没问题。但是图上的位置显示就是错误的，这有可能是什么原因？

问题 模式植物如拟南芥、水稻还能发基因家族文章吗？

我看近几年发的基因家族文章挺多的，但是自己研究的是模式植物，不知道能不能发啊？

问题 /biosoft/MCScanX/MCScanX/MCScanX mcscan/AT

请问一下MCScanX从网盘上下载下来，应该放在什么位置了？上面的绝对路径/biosoft/MCScanX/MCScanX/MCScanX mcscan/AT中在哪里建立biosoft文件？我是从网站下载的ova包，所以不知道老师的biosoft文件应该怎么建立？谢谢

问题 老师好，我在虚拟系统中筛选出53个基因，去两个网站上比对结构域，结果不同且差异较大，我选择了pfarm网站中的53个基因。但是再构建进化树时用邻接法却提示我序列差异太大，画不出来。然后我删掉了序列很短的基因6个。就画出来了。请问老师，我是应该筛掉基因还是用最大简约法画树。希望老师指导。谢谢！

问题 CCS报错---unsupported sequencing chemistry combination

...g kit: 100356200 basecaller version: 2.3.0.0.140640 另外尝试了不同的ccs版本都报一样错,有遇到过同样问题的大佬求指教，比较急，谢谢~