...因在染色体位置构图那一节内容,自己操作在ncbi上下载的拟南芥注释文件并未发现其染色体信息(如图),如果按照课堂上的fadix命令,则构建不了染色体长度相关信息。如何根据在ncbi上的注释文件.gff进行fadix呢
老师,您好, 我在用脚本提取基因序列的时候遇见一个问题, 所有命令是:perl script/tiquxulie.pl Ginkgo_biloba.HiC.genome.fasta gene_weizhi.txt gene_weizhi.fa 结果出现提示:Substitution loop at /usr/share/perl5/Bio/SeqIO/fasta.pm line 142, <GEN0> chunk 1 ...
按照说明建立了.cmd文件,但是以管理员身份运行的时候,总是不能出现下图这样的,而是黑色界面出现后即闪退消失,请问有大佬能够帮忙解决嘛,非常感谢!
在使用最新版本Maxquant(MaxQuant 2.4.3.0)进行蛋白质搜库的时候,点击开始之后,会弹出一个弹窗,如下: 提示.NET Core SDK需要更新。 .net core 3.1更新教程: 进入下载网址:https://dotnet.microsoft.com/zh-cn/download/dotnet/3.1 选择所需版...
按照老师安装的方法,也是下载大讲堂百度云上的biolinux的ova文件,运行manager@bl8vbox[share1] /biosoft/meme-v4.12.0/bin/meme pep_id-seq-F.fa -protein -oc u-box_motif -nostatus maxsize 600000 -mod anr -n motifs 10 -minw 6 maxw 50时,出现 zsh: no such file or directory:...
由于我的样本量只有五个,带入conet算一直报错,请问可以怎么处理这种情况呢?需要再多加两个样本,新加样本中的值等于(前面5个样本和/5)吗?这样可以吗?想采取平均值法多弄两个样本出来,请问这样可以吗?会对结果...
求助各位大佬:六年前在一家公司做了外显子芯片,他们交付的数据文件是IDAT文件,现在想打开文件无法找到可以打开该文件的方法。
请问https://www.omicsclass.com/article/872帖子里说的分离NR/NT数据库的脚本和所需文件,gi_taxid_nucl.dmp.gz和gi_taxid_prot.dmp.gz文件无法下载,提示没有这个文件,请问这两个文件现在变成什么了?现在数据库都更新了,请问还能用这个方法...
蓝色的这块,为什么它和其他的块有联系呢
这是参考文章 第一个图是参考多基因组做的 为什么4个不同物种不会分开 3个的可以,请问老师参考文章的图怎么做?
根据教程运行保留最长转录本的时候,跑了好几个小时,它程序终止了,但是很多跑出来的.longest_isoform.gff3 文件有一部分是有内容,有一部分是空的,现在我要怎么做,可以保留已经跑完的id,然后继续跑没跑完的
具体情况是这样的,说我字体数据库里没有这样的字体,这种情况怎么解决?
...10-30, identities >90%, and match lengths >100 bp. 这个验证鉴定的基因的方法该怎么操作? 谢谢
老师您好,在进行ka/ks计算的时候,发现输入指令/biosoft/KaKs_Calculator2.0/src/AXTConvertor dup_gene_paired1.phy dup_gene_paired1.axt,总是出现错误,zsh: no such file or directory: /biosoft/KaKs_Calculator2.0/src/AXTConvertor,应该怎么处理?我用的是咱们网站...