...这一步报错如图: 具体: manager@bl8vbox[mcsanX] blastall -i pep.fa -d pep.fa -e 1e-10 -p blastp -b 5 -v 5 -m 8 -o mcscan/AT.blast [11:41AM] [blastall] WARNING: Unable to open output file mcscan/AT.blast: [blastall] FATAL ERROR: BlastFormattingInfoNew...
...的代码就可以照抄分析,提高分析数据效率,今天是第1个数据,后续还有数据慢慢给大家分享: 数据介绍:GSE192575 来自谷歌翻译: 基于顺铂的化疗是不可切除膀胱癌最常见的治疗方法,并且也越来越多地用作手术和放疗之...
...底我是使用CCA还是RDA呢? DCA分析可判别使用哪个方法更好: RDA还是CCA: - 根据看分析结果中Axis Lengths的第一轴的大小 - 如果大于4.0,就应选CCA(基于单峰模型,典范对应分析) - 如果在3.0-4.0之间,选RDA和CCA均可 - 如果小于3...
...Partial Least Square with Discriminant Analysis ) O2PLS 模型用于两个数据组间的整合分析,包括系统生物学组学间关联、分子调控机制-表型间关联等各种大数据组的内在联系都可通过此模型进行整合分析。该模型一方面可反映不同数据...
...最少的SNP数据区分尽量多的样品,也就是指纹图谱DNA fingerprinting。这里介绍一个软件可以做这个事情: SNPT下载地址:http://www.shigatox.net/stec/cgi-bin/snpt 这个软件可以做的分析: Indentify unique SNPs profiles and assign sequence types(MST);Calc...
...向引用,即捕获组行为。 反向引用写法为\1 \2 ...或\g{1} \g{2} ...,相应的数字表示对应顺序的捕获组 例如: $_="abba"; if (/(.)\1/){ #(.)\1表明会匹配两个同样的字符。 print "bb"; } 反向引用不必紧...
...的结果文件的时候,一定会想:这怎么下手?!如果再配个说明书该多好啊! “说明书”应该具备的作用 一份合格的“说明书”应该能够让0基础的同学看懂庞杂的数据结果,知道结果背后的生物学意义,解决“是什么”的问...
...之后,身边的朋友建议我找一些项目管理工具,来帮助我更好地管理手中的项目。 虽然朋友的建议很有道理,但是一旦真正开始寻找,很快我就意识到选择合适的项目管理软件可能与管理项目一样困难。 市面上的项目管理...
使用参数说明: $ Rscript heatmap_group_plot.r -husage: heatmap_group_plot.r [-h] -i filepath -m filepath -g group ...
GFF3每一行代表一个序列元件(以#为开头的注释行除外),每一行有且只有9列(也就是每个序列元件有9个属性),列与列只能必须使用tab键来分割,如果某个序列元件的某个属性为空那么必须使用“.”来代替,格式如下: 2L ...
R是红色的处理组的荧光,G是绿色的对照组的荧光。这里的“对照组”是指健康人的标本吗?R/G的意义是什么,log2(R/G)就是探针表达量吗?下图有两个channel 因此是双色通道,经过log2转换过。然而下面出现了log2(G/R),完全...
做了四个植物,只有一个有4个基因加倍,其他都没有加倍的。发文章影响吗?
...析? 此外还想请教一下根据mitof分析结果可以看到在一个基因位置基因id:9852 发生了2个拷贝,这种情况需要把这个基因拆成2个吗?9852在基因组注释结果里是1个基因,中间没有终止密码子。 或者在命名的时候命名为9852_1, 9852_2?...
...9008万), 全国博士仅有80万(1978年至2017年之和), 这个比例仅仅只有万分之五点七即5.7‱! 将一万人扔到操场上,正好可以站满个标准操场, 但满场人头中找出的博士却只够站个五人颁奖台, 而我站在操场的人群中,甚...