问题 WGCNAcor相关系数的选择

老师你好，我想问下做WGCNA分析的时候，我的样本信息特征是处理时间不一样，请问cor相关系数该选择("pearson", "kendall", "spearman")哪一个？

文章 如何让开发变得敏捷起来？

...交付价值，就没必要采用敏捷研发的模式。决策者一定要回归到软件的价值和本质上来思考，不能盲目跟风。 下面推荐一款适合各大团队使用的敏捷开发工具CORNERSTONE，它是一款基于智能化框架，能为企业打造专属管理体系的...

文章 Cox生存分析与KM生存分析介绍 生存分析（Survival Analysis） Cox proportional hazards model

生存分析（Survival Analysis）、Cox风险比例回归模型（Cox proportional hazards model）及C-index 1. 生存分析 生存分析指的是一系列用来探究所感兴趣的事件的发生的时间的统计方法。常见的有1）癌症患者生存时间分析2）工程中的失败时...

话题 相关系数

问题 老师，您好，我想咨询一下转录组测序相关系数的问题。

...是取样时间间隔过短的原因，生物学重复（组内）的相关系数（0.7左右）低于样品间（组间）相关系数（0.8-0.9），我想知道这样数据还能用吗？

文章 皮尔逊相关系数，并计算其p value 值

一般在算基因和性状相关性时，采用皮尔逊相关性相关系数。但是其实还可以就相关性的大小计算一个显著性的p_value，看一下相关性是否是由于随机导致的 。 采用R中的cor.test进行计算： cors <- cor.test(x,y) # 获得p_value pvalue &l...

文章 教你如何使用u盘安装Linux系统

...ce选项，再按+号移动它的位置在最上方。因为我这台电脑比较老，所以U盘只能显示为removeable device，对于一些比较新的主板，可以直接显示出U盘的名称。那就把这个名称移动到最上方即可。然后按F10保存设置，按回车确认，系...

问题 基因组组装着丝粒问题

请老师帮忙看一下，用调整前还是调整后的基因组注释比较好？

问题 老师您好，我想比较蝶形花亚科物种的叶绿体基因组，由于已经发表的基因组较多，应该如何选择有代表性的进行分析

老师我想比较蝶形花亚科的叶绿体基因组，但到目前为止，已经发表的已经有70多种，不可能都进行比较，那如何选择有代表的物种进行分析呢，大概选择几种合适？

问题 系统发育树:基因结构比较散，长度差异大，如何绘制满意的系统发育树？

... 可以看出该基因家族的基因长度差异较大，motif的分布也比较散， 请教一下老师，在这种情况下，我该如何取舍以获得一个良好的系统发育树呢？ 是该舍弃掉那些太长或太短的基因吗？可是他们又的确是含有保守结构域的呀...

文章 必须收藏！比较基因组学分析必备神器-OrthoVenn2

全基因组直系同源基因簇（Orthologousclusters）的分析是比较基因组学研究中的一项重要内容，直系同源基因簇之间的聚类及网络构建有助于解释跨多物种的蛋白质的功能和进化关系，今天小编给大家分享由西南大学生物学研究中...

问题 比较基因组学鉴定出的两个物种的基因家族的基因存在共线性,如何计算它们的kaks

文章 Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色

例如绘制韦恩图： library(Vennerable) data(StemCell) w <- Venn(Sets=StemCell[1:2]) plot(w, type="squares") 自行修改颜色，当然type还有"circles","squares","triangles","ellipses","AWFE","ChowRuskey","AWFE".类型包括圆形，椭圆形等，这里绘制的是方形的维...

问题 老师您好，我做比较基因组时，orthofinder2运行时出现报错，这是什么原因？该如何解决。请老师解答

文章 TBtools，不仅仅是生信小工具

前不久无意间发现TBtools居然有益智小游戏的功能，觉得比较有趣，所以在这贴一下文章。 截至2019.6.21，TB tools最新版本为1.6。太老的版本是不会有的，大家就别找了，更新最新版的吧！贪吃蛇 之前的TBtools版本中，已有不少朋...