老师你好，我想问下做WGCNA分析的时候，我的样本信息特征是处理时间不一样，请问cor相关系数该选择("pearson", "kendall", "spearman")哪一个？
请老师帮忙看一下，用调整前还是调整后的基因组注释比较好？
生存分析（Survival Analysis）、Cox风险比例回归模型（Cox proportional hazards model）及C-index 1. 生存分析 生存分析指的是一系列用来探究所感兴趣的事件的发生的时间的统计方法。常见的有1）癌症患者生存时间分析2）工程中的失败时...
老师我想比较蝶形花亚科的叶绿体基因组，但到目前为止，已经发表的已经有70多种，不可能都进行比较，那如何选择有代表的物种进行分析呢，大概选择几种合适？
... 可以看出该基因家族的基因长度差异较大，motif的分布也比较散， 请教一下老师，在这种情况下，我该如何取舍以获得一个良好的系统发育树呢？ 是该舍弃掉那些太长或太短的基因吗？可是他们又的确是含有保守结构域的呀...
...是取样时间间隔过短的原因，生物学重复（组内）的相关系数（0.7左右）低于样品间（组间）相关系数（0.8-0.9），我想知道这样数据还能用吗？
...ce选项，再按+号移动它的位置在最上方。因为我这台电脑比较老，所以U盘只能显示为removeable device，对于一些比较新的主板，可以直接显示出U盘的名称。那就把这个名称移动到最上方即可。然后按F10保存设置，按回车确认，系...
例如绘制韦恩图： library(Vennerable) data(StemCell) w <- Venn(Sets=StemCell[1:2]) plot(w, type="squares") 自行修改颜色，当然type还有"circles","squares","triangles","ellipses","AWFE","ChowRuskey","AWFE".类型包括圆形，椭圆形等，这里绘制的是方形的维...
一般在算基因和性状相关性时，采用皮尔逊相关性相关系数。但是其实还可以就相关性的大小计算一个显著性的p_value，看一下相关性是否是由于随机导致的 。 采用R中的cor.test进行计算： cors <- cor.test(x,y) # 获得p_value pvalue &l...
在共线性分析中发现结果太少，将minspan=30改为=0后结果仍然很少，能不能调整cscore的值呢，这个值指向的是哪个参数啊，是类似于E值的存在吗，怎么调整比较好呢
前不久无意间发现TBtools居然有益智小游戏的功能，觉得比较有趣，所以在这贴一下文章。 截至2019.6.21，TB tools最新版本为1.6。太老的版本是不会有的，大家就别找了，更新最新版的吧！贪吃蛇 之前的TBtools版本中，已有不少朋...
...时显示绘图结果，调整方便，结果支持PDF版下载，是一款比较好用的绘图小工具，有需要的请收藏吧！最后奉上Exon-Intron Graphic Maker地址：http://www.wormweb.org/exonintron 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文...
请问如何对muscle比对之后得到的结果进行手动调整呢？比如这种，试着调整了一下，第一次粗暴的将WRKY中间一条横杠去掉，结果报错ERROR: The sequences in the input alignment should be aligned in order to us，第二次将结构域中阶所有横杠去掉...