问题 想请教老师热图里的Row-z-score和Column-z-score分别是如何计算。我的数据热图用Row-z-score画完结果显示与实际数值不大对，选column好像才对。

文章 多序列比对-蛋白序列保守结构域比对图绘制 genedoc

... 导入之后，就可以得到文章开头的图片了：黑色表示100%显示,  4. 编辑美化结果： 圆圈1处，可显示和不显示相似按钮，圆圈2处为调出设置对话框： 4.1  编辑字号大小,显示长度 选择configure 中的project选项卡,进行显示...

问题 对基因家族比对结果验证，不同数据库的反馈差异很多，求解惑

...验证比对结果步骤遇到了如下问题： smart网站返回结果显示，分析得到的所有序列都未得到有效验证，如下图： 但CDD和pfam数据库的验证显示，分析得到的序列结果基本都通过了验证 请问这样大的差异，结果是否还可用？...

问题 对orthofinder结果绘制花瓣图代码报错

请问，输入花瓣图的代码绘制，显示报错是什么原因？ 错误显示在 Python 脚本中，Ellipse 类的初始化方法被调用时给出了多余的参数。Ellipse 类的初始化方法只接受四个位置参数，但却提供了五个。 但当我改动成四个后，绘制...

问题 请教老师，用自己的hmm文件，进行了domain的二次搜索，结果如下图所示。结果显示仍然会有很多只是匹配了一部分序列片段。我用这些部分比对上的结果截取序列后，再三大数据库对比发现也存在我想要的domain. 现在的问题是，如果要这些部分的结果截取序列，做进化树就会差异太大。如果不要部分比对上的，又怕少了家族序列。只有一部对比上的，到底如何取舍呢？这样的情况如何处理，有没有相关的标准？谢谢

文章 GEO在线分析工具--GEO2R进行基因差异表达分析

...的数据，注意，登录号只能是GSE登录号。以GSE106876为例，搜索结果如下图B。若对应的GSE数据不能利用GEO2R在线工具分析，网址会进行提示。   差异分组 搜索出所有样品之后，选择Define groups，选定差异比较分组的样品（如...

问题 circo 绘图时基因标签不显示

基因标签文件如下 文本路径如下 配制文件如下 完整配制文件如下 命令与运行结果如下

文章 蛋白互作网络分析可视化文件修改升级 支持 PDF导出

使用NotePad++等文本编辑器打开html文件，文件中要修改4处地方。（注意以下截图左边为源文件，右边为修改后） 1.在原文件第十一行添加两行代码。如下图所示，将右边文件的两行代码复制，粘贴到左边文件第十，十一行之间...

文章 Linux三剑客之grep-文件中的信息捕获

...结束，而不是换行符 其他选项： -s， --no-messages ：不显示错误消息-v， --invert-match ：选择非匹配的行-V， --version ：显示版本信息并退出--help ：显示此帮助文本并退出 输出控制： -m， --max-count=NUM      匹配NUM次后停止-b，...

文章 MYSQL数据库常用语句命令

...引或唯一键DROP INDEX u_name ON n;DROP INDEX i_age ON n; 7.数据库视图 # 创建视图CREATE VIEW v AS SELECT id, name FROM n;CREATE VIEW v(id, name) AS SELECT id, name FROM n;# 查看视图(与表操作类似)SELECT * FROM v;DESC v;# 查看创建视图语句SHOW CREATE VIEW v;# 更改视...

问题 关于进化树+基因结构+motif—1张图全显示 的问题

黄老师，用TBtools软件将进化树，基因结构和motif进行一张图显示时，出现图片这样结果，请问那里出现错误？

文章 泌尿感染（UTIs）宏基因组分析

...采样 微生物组成及多样性分析 （1）物种组成聚类结果显示（结果1图a），泌尿系统微生物组被分为16个不同的簇（称为“尿型”），通常由单一的细菌为优势群体，尿型与诊断类别有显著关联（卡方检验，P＜0.001），健康者尿...

问题 目的：安装Docker Desktop 1.本人电脑：win10家庭版 2.做了什么：开启CPU虚拟化、开启Hyper-V、获得下载地址、在注册表编辑器中改了Professional、桌面上新建containers.cmd并以管理员身份运行 3.产生结果：c盘内存从7G变成2G,Docker结果显示，磁盘空间不足，……引发异常的上一位置中堆栈跟踪的末尾……，再次点击变成如图一所示， 4.请老师指教呀

文章 Evolview：制作图例

...!Title or !Legend文本图例标题!ShowLegends0 或 10：隐藏；1：显示 命令示例： [1].   使用进化树“(A:0.1,(B:0.2,(C:0.3,(D:0.4,E:0.5)40:0.6)80:0.05)100:0.1)90:0.43;” [2].   图例是附加在其他设置内容中，包括分支的颜色、标签的颜色、标签背景...

文章 Rstuido相关快捷键

...将光标定位到控制台 Ctrl - 3 将焦点定位到帮助 Ctrl - 4 显示历史 Ctrl - 5 显示文件 Ctrl - 6 显示图像 Ctrl - 7 显示包 Ctrl - 8 显示工作空间