找到约 15 条结果

文章 R语言逻辑运算符与算术运算符

...持的关系运算符。 将第一个向量的每个元素与第二向量的相应元素进行比较。比较结果是一个布尔值。 大于(>) - 检查第一个向量的每个元素是否大于第二个向量的相应元素。示例代码:v <- c(2,5.5,6,9); t <- c(8,2.5,14,9);...

问题 关于使nohup vcftools过滤vcf文件的问题

了组学大讲堂GWAS分析课程的示例数据rice.raw.vcf.gz,并使vcftools软件进行过滤,并试验了使nohup和不使nohup后得到的文件结果比较,使nohup得到的vcf文件结果有异常不能进行后续分析,具体如下: 1)不使nohup时的...

文章 热门方向:AnnexinV/PI联合检测细胞凋亡

...明显!   正常细胞膜的磷脂分布是不对称的,活细胞磷脂酰丝氨酸(phosphatidylserine,PS)位于细胞膜的内表面,细胞凋亡时,细胞膜发生变化,PS从细胞膜的内表面翻转到细胞膜的外表面。   annexinV是一种对PS有高度亲和力的...

问题 GATK分析的第二种方法是不是有问题,怎么运行报错,结果也和第一种不一样,不是特别明白alt

文章 screen软件快捷键修改

screen默认功能按键为ctrl加a,但是这个键同时是回到行首这样非常泛的快捷键,所以如果想改怎么办呢? 可以创建一个~/.screenrc,并在此处添加类似 excape ^Xx 来让ctrl x 替代ctrl a ,当然你也可以使ctrl +a 然后再输一个a来实...

文章 R数据框之间的合并dplyr

1、转换与合并left_join(a, b, by = “x1”): 向数据集a加入匹配的数据集b记录(行)。right_join(a, b, by = “x1”): 向数据集b加入匹配的数据集a记录。inner_join(a, b, by = “x1”): 合并数据。仅保留匹配的记录。full_join(a, b, by = “x1...

文章 Screen:命令行下的多窗口管理器

...话 你可以在不终止程序的情况下分离 Screen 会话: 按 Ctrl-A,然后按 D 这样你就可以退出 Screen 会话,而其运行的程序依然在后台运行。 高级法 创建多个窗口 在一个 Screen 会话里,你可以创建多个窗口: 按 Ctrl-A,然后...

问题 我之前看了课程说是不做进化树,但是在这个图片的代码,直接把进化树文件删了之后,我就是t后面的删掉,a多样性和b多样性就做不了了,结果是空的…

问题 扩增子分析 :qiime2分析-多样性分析alpha-beta-差异比较等 课程的问题

#添加分类信息时报错 这是qiime2分析完数据后,再利qiime分析时候报错 #自己服务器进入的ampliseq-q1:v1.2使的命令:docker run --rm -v /disk1/liuh/qiime2:/work -it omicsclass/ampliseq-q1:v1.2 请老师帮忙解答一下,谢谢。

文章 SNP2CAPS使

...ATTTTTTTCGTAAAATGCGCTTAATTTTCCTCCCAGCAACCTTTCCACCAACTGAT >chr5D:9950377_Alt ACAACTTTATCTCGTATTTCATAGCAGTAGCCAACCAATCTTATGATATTTTGATGTTGGGCCCTCATAAGATTCAGAAGCTCATTCTTAAAACCAGCTTCGACTAGTCCGGGCTGGTTGTACAGTTTCTTCACGGCAATCACTTCCCCGCTATCAAGTACTCCCTGTTCAAAATCCCATGTTTAAAAGTAATAATGCAAGGGTTCAGGTAGCTAGTGTAG...

问题 GenotypeGVCFs合并不同种质的g.vcf文件

....vcf.gz -V gendb://db )。但是我发现生成的 all.raw1.vcf.gz文件,最前边的不是Chr1。而是Ch4(第四条染色体,参考基因组这样写的,少写一个r),在上一步生成的bd文件家,染色体是这样排序的,如下图。怎样调整一下,生成的all....

文章 HTML 转 PDF

... x 等系统下运行。 优点 生成PDF时会自动根据你在HTML页面H标签生成树形目录结构。 小巧方便,转换速度快。 跨平台,在Liunx下,在win下也可以(我也只在这两个平台下过)。使方式 使前的准备 使前一定要记得先下...

文章 三分钟让你理解什么是敏捷开发,这才是敏捷开发......

...经理为同一个产品服务,每一个产品都会绞尽脑汁想一个idea去实现产品、户的价值提升。 每一个idea就是一个项目,当项目经历了立项、启动、执行、上线、收尾,这个项目就变成了产品的一个功能或一个服务。 二、项...

问题 老师,这些文件在filezilla里下载不了,原因是无法启动传输。然后我在R里面找到了其的一些,是像第二张图那样下载的吗,为什么有些文件在路径找不到呢,这些文件应该怎么下载

问题 老师,构建泛基因列表使vcf文件,是下面图的sv数据吗,下面表格包括了CHROM,POS,REF,ALT,TYPE,MAF,MIS,ANN,将这些数据整理成vcf吗?

网站为http://111.203.21.71:8000/multi-omics/variation.html    ,老师您可以帮忙看一下吗?另外,这个表格是不可以下载的,需要手动复制,麻烦您