基因组survery做出的结果是1g，但是hifiasm的拼接结果是2g，是什么原因呢，需要用purge_dup去冗余吗
...析（FAMD）中，前两个主成分解释了54.9%的变异。分析结果显示，α多样性指数与食草动物和前肠发酵者来源的粪便微生物群落呈正相关，而与肉食动物、后肠发酵者和pduC基因丰度呈负相关。肉食动物菌群与基质利用和代谢产物浓...
利用hmmer进行二次搜索提取序列时，按照命令把E值设为0.1或者稍大一点1e-5，怎么出提示错误？如果把E值设为1e-10可以正常运行。 实际上我在做第一次搜索提取序列时也出现了错误，课件里的evalue值是1.2e-28，我在运行时也出...
...员20000+人的专业生信教学团队）精心为您筹备了《转录组结果解读与挖掘精讲班》，3天时间，让您全面理解转录组结果数据，掌握标准分析后的数据挖掘思路及方法技巧，让您看结果有信心，写文章有底气！ 转录组数据解读与...
...的正则表达式。-v: 增加输出的详细程度，例如在处理时显示脚本信息。--quiet 或 -silent: 等同于-n选项，仅打印处理后的行。--verbose: 等同于-v选项，提供详细的处理信息。--version: 显示sed的版本信息。-h 或 --help: 显示帮助信息。 [...
...compound ID和description是一对多的关系，需要让compound与注释结果成一对一的形式，这个应该咋筛选？我知道的方法是按score值选取数值最大的注释结果，但是score值也有多个相同的，您看这个表 另外想请问各位老师，做进一步的代...
你好，我按照课程的流程分析自己的样品，但是得到的结果只有一条直线，请问应该怎么解决？
...//www.omicsclass.com/article/507 其中给大家介绍到了pheatmap返回结果是一个列表，其中包括行列聚类的返回结果，而这一结果又是基于hclust聚类返回的结果，这里刚好可以利用cutree函数对其聚类结果进行划分。 首先基于pheatmap参数cutre...
...+(-0.0991×SCGB2A1) +(-0.1080×AXIN2) +(-0.1516×MMP1)。Kaplan-Meier曲线显示，模型预测的低风险组与高风险组相比，高风险组患者的死亡风险明显高于低风险组（下图A），ROC曲线对于5年生存预测风险评分的AUC值为0.741（下图B），模型对直肠...
老师，构建拟南芥特异性nbs基因家族hmm文件进行hmmsearch（e-20）搜索到的序列还需要到pfam或CDD进行再次搜索验证么，不进行这一步可不可以
...号引起来 其他参数 -a 附加分组列名，结果将在图中显示 -T 可指定所要展示的top基因个数，默认20 -l 可指定所要展示的基因列表，基因之间用空格隔开，默认NULL -t 是否给输出结果图添加title，默认False不添加 -o...
...即为要进行绘制；--add_r 指定是否在绘制的相关性热图中显示相关系数r；-t 指定热图展示的形状，默认为上三角形；-d 指定热图中相关系数r的排列方式，默认为AOE；--Rdata 指定是否输出筛选后的相关系数r值结果，在命令中添加...
做eggNOG的时候，没有结果是咋回事呢？