问题 请教一下，如果基因组注释文件不是染色体序号而是scaffold序号，是不是代表着这个物种的基因组染色体定位尚不明确呀？

问题 基因家族在求串联复制是，是自己写perl 脚本根据在染色体上距离不超过200kb来计算，还是要MCScanx的计算结果好呢？

问题 我用MCScan跑的染色体共线性图结果中，只显示出两条染色体，大部分用一个数线表示是什么意思呢，求救大神~~

问题 您好，我跟着咱们的一篇文章进行操作，在第四步始终找不到文件，应该怎么操作呀，是关于faprotax这个程序，无法继续进行下去，请老师指点

问题 我想问一下公司的cleandata怎么导入到qiime2里面去，原始数据我会 建一个rawData_manifest，但是cleandata只有一个fastq文件了。

问题 你好，我想请问一下qq图做出来的这种结果是不是不太好呢，横坐标超过4之后突然就变得很陡峭，这大概是什么原因呢？

问题 请问老师，我计算的测序深度1×才61.41% ，这个数值是很低嘛？课程中的值都达到90%多了。这个测序深度只要是看哪一个呢？

问题 请问老师，串联复制基因对在染色体上之间有别的成员有问题吗，如下图，标记的两个基因是一对，我核对了基因位置应该不是数据出错了

问题 我在进行变异结果质控过滤，去掉低质量的变异结果发现我材料的变异结果都是0

hrA1   1       .       A       <NON_REF>       .       PASS    END=3   GT:DP:GQ:MIN_DP:PL      ./.:0:0:0:0,0,0 ./.:0:0:0:0,0,0 ./.:0:0:0:0,0,0 ./.:0:0:0:0,0,0 ./.:0: 0:0:0,0,0 ./.:0:0:0:0,0,0 ./.:0:0:0:0,0,0 ./.:0:0:0:0,0,0 ./.:0:0:0:0,0,0 ./.:0:0:0:0,0,0 ./.:0:0:...

问题 scaffold

在做circos图的时候，我的基因家族的一个基因在scaffold上，没有定位到染色体上，那我画circos图时候准备配置文件时候是不是可以chr1，chr2，chr3，chr4，chr5，chr6，scaffold，这样可以吗？还是把scaffold写成chr0？

问题 泛基因家族mkdir文件夹显示已存在，但目录里没有任何内容

新打开服务器只进行了修改密码的操作，但无法mkdir pan-gene-family的文件夹显示文件已存在，但目录下没有需要解压的demo文件，文件都已从网盘下载了，不知道是什么原因导致的，希望老师看见可以回答一下

问题 基因家族系统发育树构建

在检查输出的结构域文件WRKY_domain_final_aligned.fasta时发现有重复的id，是应该去掉一个吗，怎么选择留下的序列呢

文章 pip安装python模块

python模块安装还是非常简单的，只要把pip安装好之后，一切都用一条命令搞定。 如果你使用的是从 python.org 下载的Python 2 >=2.7.9 或者Python 3 >=3.4，那么pip是已经安装了。 1. pip安装首先需要下载并安装setuptools，否则提示：...

问题 cg view使用问题

大家有会类似这种，有COG的相关注释的作图吗，我早网站上做的图都是没有这种cog注释的。帮助有红包相送，谢谢啦

问题 GSDS error 报错

老师好，我在做基因结构时GSDS一直出现这个错误 我做了三个物种的其中一个物种的gff可以绘制，如图， 其他的就不可以，如图下， 但是报错都一样，希望老师可以帮帮我