问题 基因家族结构域及基因家族长度问题

...想请教一下，在鉴定基因家族成员时，如果此类基因家族的典型结构域有2个比如说A,B，我看文献上已鉴定出来的此类家族一般成员同时含A，B;或者含A;或者B就说明是属于这个基因家族的，但是鉴定的时候有时候会出现A，B，C这...

问题 多序列比对构树

请问一下，多序列比对之后的结果可以直接用于构树，不进行gap删除吗？因为我的序列比较多（几百条），用gblocks提取的保守序列很短，不到10bp，太短了构不了树。

问题 docker desk中设置文件共享夹不能同步

...享文件夹，但是我在输入ll查询文件后，发现红框里显示的东西在我电脑的文件夹里并没有。而且我在电脑文件创建一个测试文件后，在终端输入ll后也不会出现我所新创建的文件。 我是用的mac，按照组学课堂docker教学课程学习...

文章 clinvar数据库人类疾病数据库ANNOVAR数据库使用

clinvar是一个开放的数据库，每个研究机构都可以向其提交数据，对于提交的信息，会有专家团队进行审核评级。对于数据库中的位点，根据注释信息的可靠性，分成了1到4个不同的星级，星级越高，可信度越高。 数据库地址...

问题 老师 gff3文件第三列应该显示gene cds exon等符号处 没有gene符号 最后找到的文件也是空的 怎么办

问题 老师您好，生信文章因步骤相似，都是用固定的几个网站，文章查重重复率较高，老师生信类文章重复率一般要求多少？

问题 用qiime1 pick otu时，用de novo方法到最后一步时，出现图片的情况，好几个小时都是这样，出了什么问题？

问题 安装docker镜像的时候出现“unable to connect to 104.18.122.25:443. Do you need an HTTP proxy?”这个怎么解决呀？

问题 我改正了这些错误，但是还是无法把data里的数据软连接道01 data prepare上，不知道哪里出错了，基因文件和gff文件没有问题

问题 GATK 很慢，怎样分染色体CALL 变异

在使用GATK CALL 变异的时候非常的慢，一天一个样本还没有结束，能不能分染色体CALL 变异？原先的命令如下： gatk --java-options "-Xmx50g" HaplotypeCaller -R $REF   \     -I $workdir/3.map/result/${i}.sorted.dedup.bam \     -O ${i}.g.vcf.gz --max-alterna...

问题 运行mcmctree报错2.0

补充：使用的是是组学大讲堂的镜像，用singularity调用的，前一步顺利运行，这一步报错的 麻烦老师尽快再回答一下吧！！卡在这里好几天了！！！ 或者能不运行mcmctree，用别的什么结果运行cafe5吗 —————————— ...

问题 利用Perl遍历哈希

上次的问题不太明确，这次重新提问一下，谢谢各位老师！ 读入cucumberprotein.fasta文件，创建一个id和序列对应的hash, 遍历该hash，并输出到一个新创建的文件中

问题 进化树构建出问题

用自己做的物种蛋白序列单独构建进化树和加入其他参考物种（包括自己的物种）构建进化树的分组不一样，希望老师看到能解答下这种情况该如何处理？

问题 circos标签显示不全

我想做圈图，由于在一个位置上有12个基因，直接用标签没办法显示，想问问老师，这个图中的红色标注的折线是怎么实现的呢？

问题 circos圈图参数——热图

请问画圈图时，用热图表示，用颜色的深浅来表示数值的大小，这个要怎么设置，图例要怎么设置。还有怎么改变其中一个圈的宽度