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文章 组学大讲堂-8月直播课程安排!总有一个适合你!

...拟机应用8月7日15:00在线绘制维恩图与热图8月11日15:00Mutmap数据分析实操8月14日15:00进化树构建与美化8月18日15:00SRA数据库测序数据下载8月21日15:00文章经典图片之R语言再现8月25日15:00QTL-seq数据分析实操8月28日15:00 直播地址及观看...

问题 无参的转录组数据,能进行转录因子调控结合分析吗?

在转录组标准分析后的数据挖掘课程里,有进行转录因子调控结合分析方法。对于无参的转录组数据,能进行转录因子调控结合分析吗?

文章 一个自动获取最新文献的方法!

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

问题 老师您好,想请教一个临床数据下载解释问题

...一个问题。以"TCGA-STAD",为例子,按照您的方法下载的临床数据(XML)中,在radiation或drug表格中的患者,是指没有接受过radiation/drug ,还是说没有相关数据,不知道他们是否有接受radiation/drug呢?请问是否官网有相关介绍?谢谢您...

问题 转录组测序数据量如何选择?

我想做个转录组实验,但是不知道应该测多少合适,公司说有有4G、6G、8G之类的是啥意思?怎么衡量测的数据量够不够呢?

问题 有个问题想请教一下大家,从数据库中下载的原始数据的gff文件,他们是怎么得到这些基因的注释信息的的,测完序后根据序列比对吗?

文章 graphpad prism绘图时,Y轴的缺口设置

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

文章 如何正确选择差异统计检验

...面对那么多统计学检验方法,我们该怎么选择最适合我们数据的检验方法至关重要了,因为选错了检验方法很可能导致错误的结论!这里我以微生物多样性研究中所涉及到的统计学检验方法给大家总结一下; 微生物多样性测序...

文章 关于Cytoscape利用蛋白质互作网络分析info文件绘制网络图过程中节点String_id转换成GeneID 或者Symbol问题

有学员反映在学习GEO芯片数据挖掘,利用差异基因进行蛋白质互作网络分析的过程中,获得的info文件中之涉及了String_id,利用Cytoscape进行绘图的过程中无法知道对应的具体基因ID是什么或者Gene Symbol是什么,这些并不能直观显...

问题 利用正则表达式是否可以将一列数据变成三列

类似上述数据想变成 0 \tab3,x x x x\tab3,,,,, 也就是说每三个数据做成一行,

问题 二代测序数据可否用于基因家族分析

样本数据是二代测序得到的,请问二代测序结果可以用来做基因家族的分析嘛?准确性和全面性是否会受到质疑?

问题 MEGA构建系统发育树时总是报错 No common sites found

已经筛选好了保守结构域,但是构建系统发育树时总是报错 老师您好,我想问下我通过hummer得到的蛋白序列用mega构建进化树,出现报错No common sites found,报错之后让我进行Pairwise Distances计算,随后删除带有n/c的序列,随后...

问题 人类疾病时序基因数据难找怎么办

在做时序基因(RNA转录组的)预测人类复杂疾病的课题,但是一直找不到合适的数据

文章 R语言绘制多分组差异分析结果图

...FC和FDR的阈值线 fc_cutoff <- 2 fdr_cutoff <- 0.01 3 读入数据 #设置工作路径 setwd("/share/work/wangq/piplines/class/ref/03.deg") data<-read.table("Volcano1.txt", header=TRUE,sep = "\t") head(data) 文件格式如下: ID    FDR    log2FC    clusterOs01g0140...

文章 测序数据文件中MD5是个啥 ?不要无视我的存在!

测序公司在释放原始数据的目录下都会有一个MD5文件,对于不太了解MD5的老师,可能会直接忽略这个文件。实际上这个文件还是很有必要的。那MD5到底是干嘛的呢? MD5简介 MD5全称MD5消息摘要算法(英语:MD5 Message-Digest Algorithm...