问题 请问老师有没有"医学癌症TCGA-基因差异表达分析"课程基因表达数据下载后提取癌症组织数据，并用于课程“医学癌症TCGA-生存分析”的代码，感觉跨度有点大。

问题 比较基因组数据分类

老师我想知道我做比较基因组的韦恩图数据在哪个文件里，我想知道我做的物种里特有的基因家族但是我不知道在哪个文件里

问题 没有转录组数据能进行基因家族分析吗？

基因家族分析一般会结合上家族内基因表达数据，假如没有做转录组也是可以进行分析的；1. 假如家族不是太大，可以选择用实时定量进行表达模式变化分析；2. 可以下载其他人上传至NCBI上的数据，只需研究性状及实验设计符...

问题 想请教一下，conet网络构建的课程，用提供的数据文件分析完全可以，但是用我的数据文件就报错。我尝试了用测序公司提供的xlsx格式，并把数据形式改成和课程提供数据完全一样，再转化成txt制表符文件格式后输入，选择第二个选项（由biom格式转化来的文件），结果报错。把测序公司提供的biom格式文件输入，选择第三个选项（biom HDF5格式，还是报错）。这是什么问题呢？

问题 病毒鉴定需要选数据库吗？

大家好！我想鉴定侵染植物的细菌携带的病毒，鉴定的时候应该怎么选数据库呢？

文章 R包venn绘制韦恩图

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

文章 比较3种差别表达方法对TCGA转录组数据的分析

...ceRNA网络分析》的课程中，我们都介绍了针对TCGA的转录组数据，进行基因的差异表达分析。当时我们介绍的都是采用edgeR 软件包进行的分析， 有学员问我，采用DESeq2 和limma 的方法也可以进行差异表达的分析。当然，这两个软件...

问题 TCGA下载数据更改了工作目录

各位老师：TCGA下载数据下载了一半，又改了另外一个工作目录，结果出现下面信息，如何解决？谢谢了！

文章 Graphpad Prism绘制分组直方图

...方法如下： 1.选择 分组直方图 图形类型，并设置每列数据个数。 2.如图所示，填写表格数据。数据分A、B两组，每一行为一项数据。 3.点击"Graphs" 中的 "Data 1" 展示结果图。 还可以选择其他形式的分组直方图： （1...

问题 HiC测序下机数据需要过滤吗？

请问HiC数据在分析前需要进行过滤吗？若需要，流程是什么？是否与普通二代测序过滤流程一致？谢谢！

问题 基因家族分析数据准备

基因家族数据准备中，运行到保留蛋白编码基因这一步时运行完检查文件protein_coding.gff3，发现有些基因好像后面不是gene_biotype，这对后面的分析有影响吗？还是需要改一下代码

文章 测序数据文件中MD5是个啥 ？不要无视我的存在！

测序公司在释放原始数据的目录下都会有一个MD5文件，对于不太了解MD5的老师，可能会直接忽略这个文件。实际上这个文件还是很有必要的。那MD5到底是干嘛的呢？ MD5简介 MD5全称MD5消息摘要算法（英语：MD5 Message-Digest Algorithm...

问题 无参的转录组数据，能进行转录因子调控结合分析吗？

在转录组标准分析后的数据挖掘课程里，有进行转录因子调控结合分析方法。对于无参的转录组数据，能进行转录因子调控结合分析吗？

文章 graphpad prism绘图时，Y轴的缺口设置

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

文章 如何正确选择差异统计检验

...面对那么多统计学检验方法，我们该怎么选择最适合我们数据的检验方法至关重要了，因为选错了检验方法很可能导致错误的结论！这里我以微生物多样性研究中所涉及到的统计学检验方法给大家总结一下； 微生物多样性测序...