问题 转录组测序数据fastq统计结果怎么看？ 双端测序怎么计算reads数量？

学生最近获得了一种寄生植物的转录组数据，宿主是银杏，测序材料是三片寄生植物叶子（三个重复）。现结果如下： 请问老师: ①因为是双末端测序，比如说我要算重复1的总reads大小，是应该把YX-001-1和YX-001-2的reads相加，还...

文章 awk统计文件某列中某关键词出现次数

有时我们需要统计文件的某列中某些词出现的次数，可以在Linux下使用sort | uniq -c，那用awk怎么操作呢? 示例文件test.txt a 00 b 01 c 00 d 02 1、统计文件test.txt中第2列不同值出现的次数 awk '{sum[$2]+=1}END{for(i in sum)print i"\t"sum[i]}' test...

问题 vlookup使用

老师您好，我做PPI图时，按照视屏教学中的步骤使用的vlookup，但筛选不出结果，请问是excel的问题还是其他什么原因？

问题 构建进化树

利用hummer搜索之后得到相应的序列，在构建进化树过程中，出现以下问题： （1）（2）如何删除序列差异较大的gap，若有，请给予详细的步骤

问题 做BSA混池定位时，如果分离群体中隐性基因致死，没有纯合隐性植株，可以用测序的方法做BSA混池定位么？

问题 老师您好，我在安装GraphPad Priam时，老是出现如下问题，换了几个下载地址都是这样的问题，一直安装不了。求解决方法！！！

问题 老师您好，我用TBtools的压缩文件包安装时，用java打开TBtools_v0.53只能出来一个小窗口，请问这种怎么解决

问题 基因注释文件gff第9列，ID标签和parent标签与蛋白序列和cds序列里面的ID都不一致怎么办

问题 老师好，我用自己的数据根据参考基因组挂在染色体这一步，最后画共线性图报错，麻烦老师看一下

问题 老师您好，在做比较基因组提取CDS、蛋白序列和最长转录本时候，提取出的文件是空的，这是什么原因，请老师解惑

问题 转录组问题

老师您好，我想问一下，我做的转录组数据，处理与未处理之间的差异显著的基因，上调基因远远大于下调基因，怎么解释原因呢？谢谢老师

问题 0

老师们，请问一下MCMCtree估算物种分歧时间，运行过程中没有任何报错很顺利，但最后一步出现下图报错，导致输出结果中没有Figtree.tre文件。 我是用的学校的服务器，自己安装的软件，求各位老师解答，谢谢！！！

问题 当保留蛋白编码序列时，为什么会提示有这个报错？检查发现'!'应该是没有输入错误的

原命令：agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl --gff $gff --attribute biotype --value protein_coding -t '!' -o $species.protein_coding.gff3 报错：The test to apply is Wrong: !. We want something among this list: <,>,<=,>=,! or =.

问题 老师，您好，我按照课程执行重测序里面的变异结果统计与绘图，其中indel可以正常执行，但是snp运算没有结果，请问老师是什么原因呢？

老师，您好，我按照课程执行重测序里面的变异结果统计与绘图，其中indel可以正常执行，但是snp在运行perl $scriptdir/vcf_start.pl -vcf snp.unknown_multianno.vcf -type snp时总是出错，显示Use of uninitialzed value in division (/) at /work/scripts/vcf_stat.pl...

文章 使用fastp软件对fastq文件进行剪切

fastp是一款较新的数据质控软件，可以对测序数据进行处理。这里介绍如何对fastq文件进行剪切。 其命令如下: fastp --in1 data_yuanshi/Tres_2_1.clean.fq.gz --out1 Tres_2_1.clean.fq.gz --in2 data_yuanshi/Tres_2_2.clean.fq.gz --out2 Tres_2_2.clean.fq.gz  --trim_...