全部注释到种是不是过度注释了
老师,您好,我在运行gatk的HaplotypeCaller时,因为样本过多(二三百个样本),运行成功的单个样本运行了24+个小时,尝试了采用ParaFly工具多任务并行,并且也尝试了同时运行多个nohup sh gatk.g.sh > gatk.g.sh.o&(一个gatk.g.sh对应...
进行排序时提示 ERROR net.maizegenetics.dna.map.PositionListBuilder - validateOrdering: PositionChr:HIC_SCAFFOLD_11Pos:40436InsertionPos:0Name:SHIC_SCAFFOLD_11_40436Variants:G/AMAF:NaNRef:G and PositionChr:HIC_SCAFFOLD_9Pos:117578893InsertionPos:0Name:SHIC_SCAFFOLD_9_117578893Variants:G/AMAF:N...
在用GATK CALL 变异后生成的g.vcf.gz文件用GATK的GenomicsDBImport工具导入db的时候出现了问题。我用的命令是:gatk --java-options "-Xmx50g" GenomicsDBImport \ -L intervals.list --tmp-dir $tmpdir -R $REF --batch-size 5 \ --reader-threads 5 --max-num-interva...
家族里的成员大多数有两个相同的结构域,而有些成员只有一个结构域,那么建树的时候应该怎么截取结构域呢?
...件已存在,无法再次创建。这通常是由于系统认为该用户的mailbox文件已经存在,因此无法再次创建。 解决这个问题的方法: 检查邮箱文件是否已存在:在运行 useradd 命令之前,可以先检查一下该用户的邮箱文件是否已经存在...
老师您好!我画的图小于200Mb的可以标出基因在染色体的具体位置,但是基因在染色体上的位置大于200Mb的基因画不出来。new 1.txt谢谢您!