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问题 植物线粒体组装unicycler软件里的spades报错

...      (kmer_coverage_model.cpp   : 218)   Too many erroneous kmers, the estimates might be unreliable  * 0:07:10.518  1785M / 18G   WARN    General                 (kmer_coverage_model.cpp   : 327)   Valley value was estimated improperly, reset to 3  * 0:07:10.523  1785...

问题 docker-GSDS网站出错:Request-URI Too Long The requested URL's length exceeds the capacity limit for this server.

Request-URI Too Long The requested URL's length exceeds the capacity limit for this server.

用户 No One And You

文章 外源插入流程报错运行不了

...128: BiopythonWarning: You may be importing Biopython from inside the source tree. This is bad practice and might lead to downstream issues. In particular, you might encounter ImportErrors due to missing compiled C extensions. We recommend that you try running...

问题 TCGA数据下载后保存出错

...g data for project TCGA-STAD GDCdownload will download 407 files. A total of 105.663384 MB Downloading as: Sun_Aug__5_19_35_20_2018.tar.gz Downloading: 110 MB     >  > # 保存结果,方便后面使用 > data <- GDCprepare(query = query,  +                       ...

话题 fpkm_and_plot.R

文章 IF=5 | 健康犬的肠道微生物组和代谢组对膳食纤维的反应

“ 2024年12月《mSystems》发表了一篇题为“Response of the gut microbiome and metabolome to dietary fiber in healthy dogs”的文章。” 这项研究探讨了膳食纤维与肠道微生物群及其功能之间的相互作用。通过分析健康犬只摄入不同纤维来源和数量...

文章 docker 报错 error during connect: In the default daemon configuration on Windows,

error during connect: In the default daemon configuration on Windows, the docker client must be run with elevated privileges to connect.: Get "http://%2F%2F.%2Fpipe%2Fdocker_engine/v1.24/images/search?limit=25&term=omicsclass": open //./pipe/docker_engine: The system cannot find the file specifi...

文章 python 读取kegg绘图配置文件中的kgml文件内容

...ot.nodeName=='pathway':    for i in root.childNodes:        if i.nodeType==1:            if i.nodeName=='entry':                link=i.getAttribute('link')                 #print link+'\n'             for g in i.childNodes:                if g.nodeName=='gra...

文章 Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色

...ry(Vennerable) data(StemCell) w <- Venn(Sets=StemCell[1:2]) plot(w, type="squares") 自行修改颜色,当然type还有"circles","squares","triangles","ellipses","AWFE","ChowRuskey","AWFE".类型包括圆形,椭圆形等,这里绘制的是方形的维恩图,修改颜色代码如...

文章 宏基因组的基因组binning-BASALT 介绍和用法

...的用户可以使用下面的代码安装python BASALT_setup_China_mainland.py# 或者,从腾讯 iCloud(https://share.weiyun.com/r33c2gqa)下载 BASALT.zip 的神经网络训练模型并运行mv BASALT.zip ~/.cachecd ~/.cacheunzip BASALT.zip 其他的还可以尝试使用docker, conda,sing...

用户 The ANswer

用户 The,one

用户 The onion

用户 The Libertines