找到约 15 条结果

问题 【求助,可有偿】下图是如何做出的?如何获得图中的生物学功能项目?

各位老师好,想请教一下,下图的是如何做出的,是通过ssgsea或是GSVA吗?如果是,那么图中的生物学功能项目(如EMT1、EMT2、pan-F-TBRS等)是如何获得的? 图1、2来自:m6A regulator-mediated methylation modification patterns and tumor microenvir...

问题 你好,不知道使用Rstudio软件如何提取mRNA 表达量矩阵?如何获取mRNA_info.txt文件~非常感谢

文章 O2PLS-DA分析

...模型,通过载荷图初步判断不同数据组中相关性和权重都比较高的变量,筛选出影响另一组学的重要变量。图中每个点到原点的距离高度代表基因或者代谢物和另外一个组学相关性的大,图中标示出对另一个组学影响较大的前...

问题 请问TCGA肿瘤mRNA构建风险评分如何构建?risk score模型构建好了,如何计算验证模型的risk score?

文章 蛋白质的理化性质除了用Expasy网站还能用TBtools等分析

...电荷残基(Total number of positively charged residues)、不稳定系数(Instability index)、总平均亲水性(Grand average of hydropathicity-简写GRAVY)、脂肪指数(Aliphatic index) 利用Expasy server(www.expasy.org)的ProtParam(ExPASy - ProtParam tool)进行分析,虽...

文章 天宫一号曾为农业做出的贡献!

...表,做好高级个性化分析发表高分1区不是梦!T2T基因组/比较基因组/泛基因组分析学习链接:T2T基因组组装与注释分析;动植物泛基因组分析 ;比较基因组分析 4. 群体重测序遗传进化分析+GWAS文章,篇篇10+分,缩短分析周期,...

文章 TCGA差异表达分析结果,构建ceRNA调控网络

... 这个可以采用在线服务网站miRWalk 进行预测。使用方法也比较简单,适合对少量的miRNA 和基因进行预测,如果要进行批量的预测,可以下载网站上整理好的预测结果,在本地完成预测 2. miRNA 靶向lncRNA 的预测 这个的预测,也可...

问题 哥,您好,如何检查GFF文件里面的mRNA ID是否对应一致,或者如何改脚本,get_gene_weizhi.pl

问题 转录因子如何预测?

如何看一个基因是不是转录因子,属于哪个转录因子家族?

问题 linux终端如何打开一个应用的GUI

linux终端如何打开一个应用的GUI.docx,无论如何,感谢查看。

问题 老师;我这儿GFF3文件格式和教学视频不一样;蛋白序列上显示gene_id有三个;我不知道如何选取哪一个进行接下来的GFF3基因位置分析;GFF3文件上没有染色体位置信息,和教学视频的格式不同-gene出现在第3列;gene_id出现在第9列我该如何选取有效的ID呢?如何修改Perl脚本?如何能成功提取基因位置信息呢?望老师指点!谢谢呢

...学视频不一样;蛋白序列上显示gene_id有三个;我不知道如何选取哪一个进行接下来的GFF3基因位置分析;GFF3文件上没有染色体位置信息,和教学视频的格式不同-gene出现在第3列;gene_id出现在第9列我该如何选取有效的ID呢?如何...

文章 群体进化选择消除分析

...子和水稻。  1.  基于群体分化(FST 法) 群体的固定系数 F 反映了群体等位基因杂合性水平。固定系数 F 是 F 统计量(FST)的一个特例:FST 分析扫描全基因组范围内的 SNP 位点,计算每个 SNP 的 FST 值,其取值范围为0~1...

问题 如何鉴定一个基因家族

需要进行基因家族分析,请问如何鉴定一个基因家族?

文章 杂交瘤技术制备单克隆抗体:详细流程与常见问题解析

...分离重新获得杂交瘤细胞。 ③原生生物污染主要是大家比较头疼的黑胶虫,污染后会陆续出现多少不等的黑点。   二、融合后细胞不生长 ①融合后细胞不生长可能是因为融合试剂有毒性,部分毒性试剂作用时间过长引起...

问题 基因家族成员如何取舍,命名?如何查找外显子和内含子结构?

老师们好,我通过下载拟南芥的家族基因序列,用于本地blast我的转录组数据,获得62个含结构域的基因。通过CDD-search确定其中46个基因含有完整的结构域,但有16个基因只有部分结构,如图,黄色标记的是含部分结构域的基因。...