各位老师好,想请教一下,下图的是如何做出的,是通过ssgsea或是GSVA吗?如果是,那么图中的生物学功能项目(如EMT1、EMT2、pan-F-TBRS等)是如何获得的? 图1、2来自:m6A regulator-mediated methylation modification patterns and tumor microenvir...
...模型,通过载荷图初步判断不同数据组中相关性和权重都比较高的变量,筛选出影响另一组学的重要变量。图中每个点到原点的距离高度代表基因或者代谢物和另外一个组学相关性的大小,图中标示出对另一个组学影响较大的前...
...电荷残基(Total number of positively charged residues)、不稳定系数(Instability index)、总平均亲水性(Grand average of hydropathicity-简写GRAVY)、脂肪指数(Aliphatic index) 利用Expasy server(www.expasy.org)的ProtParam(ExPASy - ProtParam tool)进行分析,虽...
...表,做好高级个性化分析发表高分1区不是梦!T2T基因组/比较基因组/泛基因组分析学习链接:T2T基因组组装与注释分析;动植物泛基因组分析 ;比较基因组分析 4. 群体重测序遗传进化分析+GWAS文章,篇篇10+分,缩短分析周期,...
... 这个可以采用在线服务网站miRWalk 进行预测。使用方法也比较简单,适合对少量的miRNA 和基因进行预测,如果要进行批量的预测,可以下载网站上整理好的预测结果,在本地完成预测 2. miRNA 靶向lncRNA 的预测 这个的预测,也可...
如何看一个基因是不是转录因子,属于哪个转录因子家族?
linux终端如何打开一个应用的GUI.docx,无论如何,感谢查看。
...学视频不一样;蛋白序列上显示gene_id有三个;我不知道如何选取哪一个进行接下来的GFF3基因位置分析;GFF3文件上没有染色体位置信息,和教学视频的格式不同-gene出现在第3列;gene_id出现在第9列我该如何选取有效的ID呢?如何...
...子和水稻。 1. 基于群体分化(FST 法) 群体的固定系数 F 反映了群体等位基因杂合性水平。固定系数 F 是 F 统计量(FST)的一个特例:FST 分析扫描全基因组范围内的 SNP 位点,计算每个 SNP 的 FST 值,其取值范围为0~1...
需要进行基因家族分析,请问如何鉴定一个基因家族?
...分离重新获得杂交瘤细胞。 ③原生生物污染主要是大家比较头疼的黑胶虫,污染后会陆续出现多少不等的小黑点。 二、融合后细胞不生长 ①融合后细胞不生长可能是因为融合试剂有毒性,部分毒性试剂作用时间过长引起...
老师们好,我通过下载拟南芥的家族基因序列,用于本地blast我的转录组数据,获得62个含结构域的基因。通过CDD-search确定其中46个基因含有完整的结构域,但有16个基因只有部分结构,如图,黄色标记的是含部分结构域的基因。...