...进化等具有重要作用。散在重复序列鉴定可以使用REPuter在线软件分析；串联重复序列鉴定可以使用TendemRepeatFinder (TRF)软件分析。 参考：https://www.jianshu.com/p/6cc92fd7a845 https://www.jianshu.com/p/f94ba9df9c3e
...回所有子、孙文件（目录）； ignore.case 若为TRUE则在匹配pattern时不区分大小写； include.dirs 在recursive为TURE，即显示所有子、孙文件时，若include.dirs为FALSE则只列出最终端的文件名，而不列出中间层级的目录名； no.. ...
...视化神器--Mapman 2.收藏贴-基因/蛋白功能注释、富集分析在线工具详解 3. 如何下载基因组及查找基因 4. CDS、cDNA、ORF等等傻傻分不清 5. qRT-PCR相对定量计算详解 6. 绘一棵超酷炫的系统发育树！ 7. 100+篇2019年基因家族分析SCI...
(rnaseq) [yangxm@sonmi 5.deg]$ Rscript $scriptdir/deseq_analysis.r -i $workdir/4.expression/all_gene_count.tsv -g normal_vs_tumor.compare.txt -k $workdir/4.expression/all_gene_fpkm.tsv -r normal --fdr 1 --fc 1.1 -p normal_vs_tumor Loading required package: ggplot2 Loading required package: edgeR...
fatures.xlsx
...g ortholog Sc1 xiaomai1D --cscore=0.7 --no_strip_names 2. 提取匹配的最佳区域，生成.block文件 我们提取其他物种与黑麦区块匹配的最佳区域，主要用于分析基因组复制产生的区域。生成的文件以Sc1.Damai1.blocks为例，第一列为黑麦，...
老师您好！我在分析鸡的基因家族的时候，发现鸡的基因ID、mRNA ID与蛋白ID之间都是没规律的。蛋白ID、基因ID、mTNA ID前面几个字母分别以P、G、T结尾，这个很容易解决。但后面的11位数字编码却毫无规律可谈，蛋白fa文件中，蛋...
用迅雷在ncbi上下载的.sra格式文件，下载保存在了本地，如何转换为.fastq格式文件？请各位老师同学指点，谢谢！
我们下载第三方镜像，尤其是整套分析流程的镜像之后，如何查看其安装的软件和软件版本？
... ‘get_aes_var’ is not exported by 'namespace:rvcheck' 原因是rvcheck版本过高,降级即可 remove.packages("rvcheck") install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/rvcheck/rvcheck_0.1.8.tar.gz",repos = NULL,type = "source") BiocManager::install("ggtree") 注意，低...
...生长过程中起着重要作用；今天就通过一篇2019年2月20日在线发表在genes（IF=3.191）上的文章，一起了解一下这个IR1/AFBs 生长素受体蛋白家族。 榨菜，想必大家都喜欢吃！榨菜原材料是茎瘤芥(Brassica juncea var. tumida Tsen et Lee)，十字...
老师，我在做泛基因家族分析中，结构变异与基因表达分析，#删除一些不需要的基因的表达量（B73的一些基因在其他物种中不存在同源基因） perl $scriptsdir/grep_famgene_fpkm.pl WRKY_gene_fpkm.xls ../03.PAV/PAV_gene.list WRKY_gene_fpkm.filter.xls ${re...