...用第一步建模的结果来预测另外一个队列的基因表达量，这个队列中的样本量只有GWAS结果，称之为gwas cohort， 这一步可以看做是对gwas cohort中的基因表达量进行填充，需要注意的是，这里分析用到的变异位点应为表达量模型构建...
...变量中： 首先，通过perl -V指令查看@INC的内容： perl -V 可以看到此时我们的环境变量如下： 打开环境变量配置文件，添加环境变量： export PERL5LIB=你的路径:$PERL5LIB perl -V 重新对模块进行调用，可以看到问题解决了： perldoc ...
...基因没有找到motif，可能是motif的氨基酸长度较长，因此可以调节搜索的上限值，同时也可以调节查找的motif数量值，这样可能会更容易查找） 即在Linux输入的命令如下： meme protein.fa -protein oc ./ -nostatus...
...生收到小纸条：我以为是情书，没想到是劝离..... 这个新闻真是，过于真实！！ 好了，以上的这些仅仅为吐槽，考研过程中确实存在颇多艰辛的地方， 可是想想自己你拿到心仪的录取通知书的一瞬间，一切都...
报错信息提示在运行R时缺失libpcre2-8.so.0这个共享库文件，libpcre2-8.so.0是PCRE（Perl Compatible Regular Expressions）库的一个版本，通常用于支持正则表达式。 解决方法： 1.安装或更新PCRE库。根据你使用的Linux发行版，可以使用相应的...
...色体的降解，和2014年促进在细胞生长方面的实时观察。这个惊人的数字清晰地表明这些细胞在过去六十年中对研究的重要性。HeLa细胞的多功能性和强大功能使其成为必不可少的实验室工具，继续为人类健康与疾病的基础提供新...
...同的铁吸收途径对PAO1和PAO1Δtesf突变体摄取镓的影响。在这个双突变株中也观察到细胞内铁水平的显著下降（图3B），这表明HitABC转运体是铜绿假单胞菌铁摄取的主要贡献者。 图2：Ga(NO3)3对野生型铜绿假单胞菌及其不同突变体...
... sample. Counts 就不用说了，来看看FPKM和FPKM-UQ有啥差别，这个可以查看GDC的官方说明文档中的转录组分析部分，两者的计算公式： RCg: 比对到基因上的reads数量 RCpc: 比对到所有编码蛋白基因上的reads数量 RCg7...
...体的小问题，利用RNA-seq进行分析也能发高分文章？当然可以！ 这次跟大家分享的文献就是针对水稻旗叶中磷的再运转问题开展的实验(发在Plant Biotechnology Journal上），利用RNA-seq数据分析相关基因的表达情况及功能的。 材料与...
...信息，仔细看还是有很多信息的，这里就不详细说明了，这个文件的前三列就是我们需要的内容，只不过第二列是Gene Title ，第三列是Gene Symbol ，制作芯片注释文件时只需要复制前三列内容，第一步删除注释信息，第二步将第二...
...路，点击“《WGCNA加权基因共表达网络分析视频课程》”可以进行WGCNA分析方法的学习。 TCGA表达数据的挖掘 先介绍两篇利用TCGA人类癌症数据库中的基因表达数据发表的文章，主要利用WGCNA的方法来筛选与癌症发生、发展相关的...
我们之前对基因家族分析发SCI这个低投入、快产出的研究热点进行了多次的追踪，并连续解读了多篇该类SCI，期望能在行文思路上给大家以借鉴，详细解读内容请点击以下链接查看： 菠萝基因家族分析文章解读木薯基因家族分...